GIPC PDZ 包含域家族,成员 1; GIPC1

  • GAIP C 端相互作用蛋白 1
  • GIPC
  • RGS19 相互作用蛋白 1;RGS19IP1
  • 19 号染色体开放解读码组 3;C19ORF3
  • GLUT1 C 端结合蛋白;GLUT1CBP
  • 联连蛋白

HGNC 批准的基因符号:GIPC1

细胞遗传学位置:19p13.12 基因组坐标(GRCh38):19:14,477,760-14,496,132(来自 NCBI)

▼ 描述

GIPC1 是一种调节细胞表面受体表达和转移的支架蛋白(Lee et al., 2008)。

▼ 克隆与表达

G 蛋白信号传导调节剂(例如,RGS3;602189)充当 GTP 酶激活和增强蛋白,与异三聚体 G 蛋白的 α 亚基结合。尽管它们的 RGS 结构域具有诊断性且高度同源,但 RGS 蛋白的 N 和 C 末端高度不同。GAIP(RGS19; 605071) 是一种膜锚定的 RGS 蛋白,位于参与膜转移的网格蛋白包被的囊泡上。De Vries 等人通过使用以 GAIP 为诱饵的酵母 2 杂交系统筛选大鼠垂体细胞库,并搜索 EST 数据库(1998)获得了编码GIPC1的cDNA,他们将其称为GIPC。预测的 36 kD 亲水性 GIPC1 蛋白含有 333 个氨基酸,包括多个磷酸化位点和一个 80 至 100 个氨基酸的 PDZ 结构域。包含 PDZ 结构域的蛋白质(参见 DLG4;602887)通常识别 C 端氨基酸并参与蛋白质网络信号传导。GIPC1 与大鼠 Gipc 具有 96% 的氨基酸同一性。Northern印迹分析在所有测试的组织中检测到1.8-kb转录物,在胰腺中表达最强,其次是骨骼肌、脑、肾、胎盘、肺、肝脏,在心脏中表达最低。表达水平与 GAIP 的表达水平不相关。免疫印迹分析证明 GIPC1 主要存在于胞质组分中,但也存在于膜组分中。免疫荧光分析显示内源性 GIPC1 在整个细胞质中以弥漫性和点状染色模式表达。Northern印迹分析在所有测试的组织中检测到1.8-kb转录物,在胰腺中表达最强,其次是骨骼肌、脑、肾、胎盘、肺、肝脏,在心脏中表达最低。表达水平与 GAIP 的表达水平不相关。免疫印迹分析证明 GIPC1 主要存在于胞质组分中,但也存在于膜组分中。免疫荧光分析显示内源性 GIPC1 在整个细胞质中以弥漫性和点状染色模式表达。Northern印迹分析在所有测试的组织中检测到1.8-kb转录物,在胰腺中表达最强,其次是骨骼肌、脑、肾、胎盘、肺、肝脏,在心脏中表达最低。表达水平与 GAIP 的表达水平不相关。免疫印迹分析证明 GIPC1 主要存在于胞质组分中,但也存在于膜组分中。免疫荧光分析显示内源性 GIPC1 在整个细胞质中以弥漫性和点状染色模式表达。免疫印迹分析证明 GIPC1 主要存在于胞质组分中,但也存在于膜组分中。免疫荧光分析显示内源性 GIPC1 在整个细胞质中以弥漫性和点状染色模式表达。免疫印迹分析证明 GIPC1 主要存在于胞质组分中,但也存在于膜组分中。免疫荧光分析显示内源性 GIPC1 在整个细胞质中以弥漫性和点状染色模式表达。

Bunn 等人使用酵母 2 杂交系统(1999) 分离了编码 GIPC1 的 cDNA,他们将其称为 GLUT1CBP(GLUT1(SLC2A1; 138140) C 末端结合蛋白)。SDS-PAGE 和蛋白质印迹分析显示除小肠外的所有测试组织中均表达 39-kD 蛋白。Northern 印迹分析显示 GIPC1 和 SLC2A1 的表达模式相似,两者在大脑中表达最强。

▼ 基因功能

使用酵母 2 杂交分析,De Vries 等人(1998) 发现 GIPC1 结合 GAIP 而没有结合其他 RGS 蛋白,并且相互作用发生在 GAIP 的 C 端丙氨酸和 GIPC1 的 PDZ 结构域之间。

通过酵母 2-杂交分析,Bunn 等人(1999)表明C19ORF3通过其PDZ结构域结合SLC2A1。使用酵母 2-杂交筛选脑相互作用蛋白,他们确定只有 SLC2A1、KIF1B 和 α actinin-1(ACTN1; 102575) 通过其 PDZ 结构域结合 C19ORF3;肌球蛋白 VI(MYO6; 600970) 显示与 C19ORF3 相互作用,但不是通过 PDZ 结构域。

纳卡卡什等人(2006) 发现在培养的小鼠肾上皮细胞中,Myo6 募集到未包被的内吞囊泡依赖于 Synectin。Myo6 结合 Synectin 的 C 末端结构域,Myo6 的募集需要吞噬受体(例如巨蛋白(LRP2;600073))的 PDZ 结合结构域与 Synectin 的 PDZ 结构域之间的相互作用。

Endoglin(131195) 是一种主要在内皮细胞中表达的 TGF-β(TGFB1; 190180) 辅助受体。Lee等人主要使用胚胎小鼠内皮细胞系(2008) 表明内皮糖蛋白和 Gipc 直接相互作用。这种相互作用增强了 TGF-β-1 诱导的 Smad1(601595)/Smad5(603110)/Smad8(SMAD9; 603295) 磷酸化,增加了 Smad1/Smad5/Smad8 响应启动子,并抑制内皮细胞迁移。

通过辐射杂交分析和 FISH 进行绘图,Von Kap-Herr 等人(2000) 将 GIPC1 基因定位于染色体 19p13.1。

▼ 分子遗传学

在 3 个不相关的中国家庭(家庭 1、家庭 7 和家庭 8)中,患有眼咽远端肌病 2(OPDM2;618940) 的受影响成员中,Deng 等人(2020) 鉴定了 GIPC1 基因(GGC(n); 605072.0001) 5-prime 非翻译区(UTR) 中的杂合三核苷酸重复扩增。通过连锁分析、长程测序和 PCR 分析相结合发现的扩增与家族中的疾病分离。

习等人(2021) 在 28 名 OPDM2 患者的 GIPC1 基因非编码外显子 1(CGG(n)) 中发现了杂合三核苷酸重复,其中包括来自 4 个不相关家庭的 18 名患者和 10 名散发性疾病患者。通过结合连锁分析、长程测序、全外显子组测序和 PCR 分析在家族 1 中发现的扩增与该家族中的疾病分离。通过直接分析 GIPC1 基因中的 CGG 重复长度来识别其他患者。患者的重复长度范围为 70 至 138。在亲代到后代的遗传中观察到重复长度的扩展和收缩。

▼ 动物模型

Chittenden 等人(2006) 发现 Synectin-null 小鼠比野生型小鼠小,动脉数量减少,多个血管床的动脉分支模式改变,而静脉系统保持正常。由于激活的 Rac1 定位异常,来自 Synectin-null 小鼠的原代动脉(而非静脉)内皮细胞在体外表现出管形成、迁移和增殖减少以及极化受损(602048)。没有联联蛋白的斑马鱼胚胎中也存在类似的动脉系统缺陷。

纳卡卡什等人(2006) 发现 Synectin 缺失的小鼠与巨蛋白缺失的小鼠一样,表现出蛋白尿。来自 Synectin-null 小鼠的尿液含有视黄醇结合蛋白(参见 RBP1;180260),这是一种已知的巨蛋白配体。Myo6 是一种参与内吞转移的基于肌节蛋白的分子马达,在未联联蛋白的肾脏中表达上调。与野生型相比,突触蛋白缺失小鼠肾脏近端小管中的巨蛋白表达正常,表明突触蛋白缺失小鼠的巨蛋白回收存在缺陷。纳卡卡什等人(2006) 得出结论,联联蛋白是巨蛋白在体内适当转移所必需的。

▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):.

0001 眼咽远端肌病 2
GIPC1、GGC(n) 重复扩展、5-素 UTR
Deng 等人在 3 个不相关的中国家庭(家庭 1、7 和 8)中患有眼咽远端肌病 2(OPDM2;618940) 的受影响成员中(2020) 在 GIPC1 基因的外显子 1 中发现了杂合三核苷酸重复扩展(GGC(n))。翻译从外显子 4 开始,因此重复扩增发生在基因的 5 引物非翻译区(UTR)。通过连锁分析、长程测序和 PCR 分析相结合发现的扩增与家族中的疾病分离。对患者队列的进一步分析发现,另外 9 名散发性疾病的中国患者和 7 名日本 OPDM 先证者也存在相同的杂合重复扩增。受影响个体的 GGC 重复次数范围为 73 至 164,而对照组的 GGC 重复次数范围为 12 至 32。值得注意的是,家庭 1 中有 1 名未受影响的个体重复扩张超过 500 人,且难以检测;该患者的 DNA 在 PCR 分析中没有产生“锯齿图案”。这些发现表明可能存在不完全外显率。患者骨骼肌显示 GIPC1 mRNA 水平升高,但重复序列周围的蛋白质水平和甲基化与对照相似。免疫染色显示,GIPC1 蛋白分布在患者和对照组的骨骼肌细胞质中,但部分与 p62(SQSTM1;601530) 共定位于患者细胞的边缘空泡和核内包涵体中。患者细胞的 RNA 测序显示几个基因的差异调节。邓等人(2020) 假设随着转录扩展的 GGC 重复序列升高 GIPC1 mRNA 水平可能会导致 RNA 毒性。这些发现表明可能存在不完全外显率。患者骨骼肌显示 GIPC1 mRNA 水平升高,但重复序列周围的蛋白质水平和甲基化与对照相似。免疫染色显示,GIPC1 蛋白分布在患者和对照组的骨骼肌细胞质中,但部分与 p62(SQSTM1;601530) 共定位于患者细胞的边缘空泡和核内包涵体中。患者细胞的 RNA 测序显示几个基因的差异调节。邓等人(2020) 假设随着转录扩展的 GGC 重复序列升高 GIPC1 mRNA 水平可能会导致 RNA 毒性。这些发现表明可能存在不完全外显率。患者骨骼肌显示 GIPC1 mRNA 水平升高,但重复序列周围的蛋白质水平和甲基化与对照相似。免疫染色显示,GIPC1 蛋白分布在患者和对照组的骨骼肌细胞质中,但部分与 p62(SQSTM1;601530) 共定位于患者细胞的边缘空泡和核内包涵体中。患者细胞的 RNA 测序显示几个基因的差异调节。邓等人(2020) 假设随着转录扩展的 GGC 重复序列升高 GIPC1 mRNA 水平可能会导致 RNA 毒性。免疫染色显示,GIPC1 蛋白分布在患者和对照组的骨骼肌细胞质中,但部分与 p62(SQSTM1;601530) 共定位于患者细胞的边缘空泡和核内包涵体中。患者细胞的 RNA 测序显示几个基因的差异调节。邓等人(2020) 假设随着转录扩展的 GGC 重复序列升高 GIPC1 mRNA 水平可能会导致 RNA 毒性。免疫染色显示,GIPC1 蛋白分布在患者和对照组的骨骼肌细胞质中,但部分与 p62(SQSTM1;601530) 共定位于患者细胞的边缘空泡和核内包涵体中。患者细胞的 RNA 测序显示几个基因的差异调节。邓等人(2020) 假设随着转录扩展的 GGC 重复序列升高 GIPC1 mRNA 水平可能会导致 RNA 毒性。

Xi等人在28名中国OPDM2患者中,包括来自4个无关家庭的18名患者和10名散发性疾病患者(2021) 在 GIPC1 基因(NM_005716) 的非编码外显子 1 中发现了杂合三核苷酸重复扩增(CGG(n))。通过结合连锁分析、全外显子组测序、长程测序和家族 1 中的 PCR 分析发现了扩增,并与家族中的疾病分离。通过直接分析 GIPC1 基因中的 CGG 重复长度来识别其他患者。患者的重复长度范围为 70 至 138。