半胱天冬酶招募含蛋白6; CARD6
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- 包含 NOD1 和 Cardiak 诱导的 NFKB 激活 1 的卡抑制剂; CINCIN1,包含
HGNC 批准的基因符号:CARD6
细胞遗传学定位:5p13.1 基因组坐标(GRCh38):5:40,841,196-40,855,353(来自 NCBI)
▼ 说明
半胱天冬酶募集结构域(CARD) 是一种蛋白质相互作用基序,通常由一束 6 个反向平行 α 螺旋组成。 含有 CARD 的蛋白质,例如 CARD6,参与信号复合物的组装,导致 半胱天冬酶 家族蛋白酶的激活和 NFKB(参见 164011)家族转录因子的诱导(Stehlik 等,2003)。
▼ 克隆与表达
Stehlik 等人通过在数据库中搜索编码包含 CARD 的蛋白质的基因,然后对骨骼肌 cDNA 文库进行 PCR(2003)获得了编码CARD6的cDNA。 推导的 311 个氨基酸蛋白包含一个 N 端 CARD,覆盖其前 91 个氨基酸,后面是几个潜在的磷酸化位点。 Northern 印迹分析在除大脑之外的所有检查组织中检测到 4.4 kb 转录本,仅在心脏和骨骼肌中检测到 6.3 kb 转录本。
通过数据库分析和脾 cDNA 文库的 PCR,Dufner 等人(2006) 克隆全长 CARD6。 该蛋白由 1,037 个氨基酸组成,包含 N 端 CARD,随后是富含谷氨酸的区域(GARR)、URG4 同源区和 C 端富含脯氨酸的区域(PRR)。 Stehlik 等人报道的剪接变体(2003),杜夫纳等人(2006) 称为 CINCIN1,编码包含全长 CARD6 的 CARD 和 GARR 的蛋白质,但缺少 URG4 同源区和 PRR。 相反,CINCIN1 具有独特的 3 引物末端外显子,编码全长 CARD6 中不存在的 30 个氨基酸。 Northern 印迹分析在大多数检查组织中检测到 4.2 kb CARD6 转录物。 内源性 CARD6 定位于人肝癌细胞系的微管。
▼ 基因功能
Stehlik 等人将 CARD6 的 CINCIN1 同工型与其他 18 个 CARD 家族成员转染后,使用免疫共沉淀法进行了测定(2003) 发现只有 NOD1(CARD4; 605980)、CARDIAK(RIPK2; 603455)、TUCAN(CARD8; 609051) 和 NAC(NALP1; 606636) 优先与 CINCIN1 相互作用。 CINCIN1 没有同源二聚化。 在人胚胎肾细胞中共表达 CARDIAK 与 CINCIN1 显着增加 CINCIN1 蛋白水平并间接诱导 CINCIN1 磷酸化。 CINCIN1 抑制 NOD1 和 CARDIAK 的 NFKB 诱导活性,但它不会通过任何其他检测的含 CARD 的蛋白质调节 NFKB 激活。 CINCIN1 不影响 NOD1 和 CARDIAK 的 半胱天冬酶-1(CASP1; 147678) 激活功能。
杜夫纳等人(2006) 发现全长 CARD6 蛋白与微管上的 RICK(RIPK2) 相互作用。 CARD6 和 RICK 的交互不需要 CARD。 CARD6 还结合 RIP1(RIPK1; 603453),RIP1 缺乏 CARD,但包含 C 端死亡结构域。 当共表达时,RICK 将 CARD6 靶向聚集体,聚集体是一种富含泛素的细胞质内含物,如果蛋白酶体受到损害或被压倒,聚集体就会在微管组织中心周围形成。 CARD6 靶向攻击体需要 RICK 的 CARD。 杜夫纳等人(2006)还发现CARD6表达通过几个孤立的信号转导途径对NFκB激活具有协同作用。
▼ 基因结构
斯特利克等人(2003) 确定 CARD6 基因包含至少 3 个外显子,跨度至少 18.9 kb。 杜夫纳等人(2006) 确定 CARD6 基因包含 4 个选择性剪接的外显子。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Stehlik 等人(2003) 将 CARD6 基因定位到染色体 5p12。 他们将小鼠 Card6 基因定位到与人类染色体 5p12 具有同线性同源性的 15A1 号染色体区域。 通过基因组序列分析,Dufner 等人(2006) 将 CARD6 基因定位到染色体 5p13.1。