YTH 域包含蛋白 2; YTHDC2
- 环孢菌素 A 相关解旋酶样蛋白;CAHL
HGNC 批准的基因符号:YTHDC2
细胞遗传学位置:5q22.2 基因组坐标(GRCh38):5:113,513,682-113,595,283(来自 NCBI)
▼ 描述
YTHDC2 属于 ATP 依赖性 RNA 解旋酶的 DExD/H框 家族。该家族的成员在 RNA 加工和代谢中发挥作用,包括转录、选择性剪接和降解(Tanabe 等人的总结,2014)。
▼ 克隆与表达
环孢素 A(CsA) 是一种天然化合物,具有多种生物活性,包括免疫抑制、抗伴侣活性、转运蛋白抑制和抗病毒活性。Morohashi 等人使用固定化 CsA 捕获 CsA 结合蛋白,然后进行质谱分析、数据库分析和人肝脏总 RNA 扩增(2011) 克隆了 YTHDC2,他们称之为 CAHL。推导的 1,430 个氨基酸的蛋白质具有 N 端 R3H 结构域,随后是 DExHc 型解旋酶结构域、锚蛋白(参见 612641)结构域、HELICc 结构域、HA2 区域和 C 端 YTH 结构域。RT-PCR检测到CAHL在睾丸中表达最高,在肠、肾、心脏和胸腺中表达较低,在其他组织中很少或没有表达。在所有检查的人类肿瘤细胞系中均检测到 CAHL 表达。
Jain 等人使用免疫荧光分析(2018) 发现 Ythdc2 定位于小鼠 I 期精子细胞的细胞质。
▼ 基因结构
Tanabe 等人(2014) 确定 YTHDC2 基因的启动子区域有一个与 cAMP 响应元件重叠的 CpG 岛。它还具有 GATA(参见 305371)和 AP1(参见 165160)结合位点。
▼ 测绘
Fanale 等(2014) 报道 YTHDC2 基因对应到染色体 5q22.2。
贾恩等人(2018) 报道小鼠 Ythdc2 基因定位于 18 号染色体。
▼ 基因功能
使用突变分析,Morohashi 等人(2011) 确定 CAHL 的 C 末端区域结合 CsA。CAHL 的 C 末端区域表现出 RNA 依赖性 ATP 水解,这种水解被 CsA 以剂量依赖性方式抑制。CAHL 表达被 TNF-α(TNF; 191160) 上调,但不被其他促炎细胞因子上调。人肝细胞系中 CAHL 表达的敲低可减少丙型肝炎病毒(HCV;参见 609532)的复制。相反,CAHL的过度表达以剂量依赖性方式增加HCV复制。CAHL 与 HCV 衍生的 RNA 聚合酶 NS5B 和宿主衍生的亲环蛋白 B(CYPB;123841) 形成复合物。CAHL 的敲低导致 CYPB 从 NS5B-RNA 复合物中解离。
田边等人(2014) 发现 YTHDC2 的敲低会减少 Huh7 人肝细胞癌细胞的生长和不依赖贴壁的集落形成。Huh7 细胞的 TNF 刺激导致磷酸化的 JUN(165160) 和 ATF2(123811) 与 YTHDC2 启动子中的 cAMP 反应元件结合,同时 YTHDC2 上调。
▼ 分子遗传学
Fanale 等人通过分析 72 名散发性胰腺腺癌患者的外周血白细胞 DNA 样本(参见 260350)(2014) 鉴定了包含 YTHDC2 的 5 号染色体区域的拷贝数变异(CNV)。该区域在 50% 的患者中显示出 1 个等位基因缺失,但在对照组中则没有。此外,82.6% 的西西里患者表现出 1 个等位基因种系缺失。
▼ 动物模型
在诱变筛选中,Jain 等人(2018) 鉴定了一种名为“ketu”的小鼠突变体,它是由 Ythdc2 中的 his327 突变为 arg 突变引起的。雄性和雌性纯合ketu小鼠均不育。在雄性雄性小鼠中,未分化的生殖细胞分裂正常发生,但进入减数分裂并进行进展是有缺陷的,因为染色体过早凝结,生殖细胞经历了程序性细胞死亡。这种细胞死亡导致了性腺功能减退、成年小鼠减数分裂后细胞的缺失以及克图小鼠的不育。进一步分析表明,ketu 生殖细胞在转变为减数分裂 RNA 表达程序方面存在缺陷。在 ketu 小鼠中观察到的表型与缺乏 Meioc(616934)(Ythdc2 的伴侣)的小鼠相似。