RHO GTP 酶激活蛋白 8; ARHGAP8
- GTP 酶激活蛋白,RHO,8
- 含有 BCH 结构域、富含脯氨酸和 CDC42GAP 样蛋白 1;BPAP1
HGNC 批准的基因符号:ARHGAP8
细胞遗传学位置:22q13.31 基因组坐标(GRCh38):22:44,752,574-44,862,783(来自 NCBI)
▼ 描述
小 GTP 酶控制生长和发育过程中的细胞动态。具有 GTP 酶激活结构域(GAP) 结构域的蛋白质,例如 ARHGAP8,可催化小 GTP 酶从活性 GTP 结合形式转化为非活性 GDP 结合形式(Lua 和 Low,2004)。
▼ 克隆和表达
通过在数据库中搜索与 CDC42GAP(ARHGAP1; 602732) 相似的序列,然后对乳腺癌细胞系进行 PCR,Shang 等人(2003)克隆了 ARHGAP8 的剪接变体,他们将其命名为 BPGAP1。推导的 433 个氨基酸的蛋白质包含 BNIP2(603292) 和 CDC42GAP 同源(BCH) 结构域,随后是富含脯氨酸的区域和具有催化活性所需的保守精氨酸的 C 端 GAP 结构域。数据库分析确定了 3 种可能的编码 BPGAP1 样蛋白的剪接变体,它们的 N 端半部有所不同。RT-PCR 检测到所有测试的人类细胞系和小鼠组织中 BPGAP1 的表达。
Johnstone 等人使用候选基因方法来鉴定 22 号染色体区域中与杂合性丢失有关的假定肿瘤抑制基因(2004) 鉴定了 ARHGAP8 基因。他们鉴定了由外显子 5 选择性剪接产生的 3 种不同的 ARHGAP8 转录本。含有外显子 5 的变体编码推导的 464 个氨基酸的蛋白质,计算得出的分子量为 53.5 kD。该亚型包含一个假定的 N 端 BCH 脂质结合结构域、一个富含脯氨酸的中央 SH3 结构域结合基序和一个具有保守催化精氨酸的 C 端 RhoGAP 结构域。缺乏外显子5的变体编码在BCH结构域中缺失31个氨基酸的蛋白质,而具有截短的外显子5的变体编码在BCH结构域中缺失5个氨基酸的蛋白质。Northern blot分析检测结肠中ARHGAP8的表达,骨骼肌、小肠、胃和睾丸,在肾脏和胎盘中表达最高。约翰斯通等人(2004) 还鉴定了小鼠 Arhgap8。该小鼠基因缺乏与人类外显子 5 相当的外显子,编码 325 个氨基酸的蛋白质,与人类 ARHGAP8 有 80% 的同一性。约翰斯通等人(2004) 指出 Shan 等人报道了一个名为 Arhgap8 的小鼠基因(2003)实际上代表了一个独特的基因,Prr5(609406),位于紧邻Arhgap8的着丝粒处。
▼ 基因功能
尚等人(2003) 发现 BPGAP1 在体外选择性增强 RhoA(ARHA; 165390) GTPase 活性,尽管它也与 CDC42(116952) 和 RAC1(602048) 强烈相互作用。Pull-down 和免疫共沉淀研究表明,BPGAP1 与其他含有 BCH 结构域的蛋白质形成亲同和异嗜复合物。表位标记的 BPGAP1 在转染的乳腺癌细胞系中诱导伪足并增加细胞迁移率。伪足的形成需要 BPGAP1 的 BCH 和 GAP 结构域,但不需要富含脯氨酸的区域。BPGAP1 诱导的伪足形成受到组成型活性 RhoA 突变体的共表达或 CDC42 和 RAC1 的显性失活突变体的不同抑制。尽管诱导了伪足,但没有富含脯氨酸区域的 BPGAP1 突变体未能增加细胞迁移。
通过蛋白质沉淀和基质辅助激光解吸/电离质谱,Lua 和 Low(2004) 发现 BPGAP1 在几种人类细胞系中与 cortactin(EMS1; 164765) 直接相互作用。渐进性缺失研究表明,cortactin 的 SH3 结构域直接与 BPGAP1 氨基酸 182 至 189 处富含脯氨酸的基序相互作用。用 cortactin 和 BPGAP1 共转染人胚胎 293T 细胞,导致两种蛋白在细胞外周共定位并增强细胞迁移。用丙氨酸取代 BPGAP1 中的 pro184 和 pro186 消除了相互作用,并且突变的 BPGAP1 未能促进 cortactin 易位到外周或增强细胞迁移。
▼ 基因结构
Johnstone 等人(2004) 确定 ARHGAP8 基因包含 13 个外显子,跨度 110 kb。外显子 1 嵌入 CpG 岛中。
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通过基因组序列分析进行绘图,Johnstone 等人(2004) 将 ARHGAP8 基因定位到染色体 22q13.31,紧邻 PRR5 基因的着丝粒。他们将小鼠 Arhgap8 基因定位到染色体 15E2,该区域显示出与人类染色体 22q13 同线性的区域。