遗传性前列腺癌,11; HPC11
细胞遗传学位置:17q12 基因组坐标(GRCh38):17:33,500,000-39,800,000
▼ 测绘
古德蒙德森等人(2007) 对 1,501 名患有前列腺癌的冰岛男性和 11,290 名对照者进行了全基因组关联扫描,随后在荷兰、西班牙和芝加哥的个体中进行了 3 项病例对照复制研究,发现前列腺癌与 TCF2 基因内含子 2 中 rs4430796 的 A 等位基因之间存在关联(HNF1B; 189907)(综合研究 p = 1.4 x 10(-11)) 。 作者指出,这种变异带来的风险不大(等位基因优势比,1.22),但由于它很常见,因此人群归因的风险很大。
在一项针对前列腺癌的大型全基因组关联研究中,Thomas 等人(2008) 证实了 Gudmundsson 等人发现的关联(2007) 与 SNP rs4430796(9.58 x 10(-10)) 的 A 等位基因。
在一项针对前列腺癌的大型两阶段全基因组关联研究中,来自英国和澳大利亚的白人参与者筛查了 541,129 个 SNP,Eeles 等人(2008) 在 17 号染色体上发现了 6 个强相关的 SNP(P 小于 10(-6))。 其中四个位于 17q12,与 HNF1B 基因中的 rs7501939 观察到的关联性最强(OR = 0.71,P = 10(-12))。 观察到 SNP rs4430796 的 P 值为 8.3 x 10(-12)。
孙等人(2008) 对 2 个研究人群的 17q12 处的 HNF1B 基因进行了精细定位研究,并确定了与前列腺癌风险相关的第二个位点,距第一个已知位点(rs4430796) 约 26 kb 着丝粒; 这些基因座被重组热点分开。 孙等人(2008) 在另外 5 个人群中证实了与第二个基因座(rs11649743) 中的 SNP 的关联,对 7 项研究的等位基因测试的 P = 1.7 x 10(-9)。 在对另一个 SNP 进行调整后,每个 SNP 的关联仍然显着。
Levin 等人通过对来自 403 个家庭的 542 名患有前列腺癌的非西班牙裔男性和 473 名未患病男性进行针对性 SNP 分析(2008) 发现 17q12 上 HNF1B 基因中 rs4430796 的 A 等位基因与前列腺癌显着相关,特别是在 50 岁之前诊断的男性中(p = 0.006,比值比为 1.92),但与年龄较大的男性无关(p = 0.118)。 与非携带者相比,A 等位基因纯合携带者在早期患前列腺癌的风险增加了 3.70 倍。 结果证实了前列腺癌与染色体 17q12 上的 SNP 相关,并表明该位点也可能在早发的遗传性前列腺癌中发挥作用。
伯恩特等人(2011) 对 10,272 名前列腺癌患者和 9,123 名欧洲血统对照者的 17q12 区域中含有 HNF1B 的 79 个 SNP 进行了基因分型。 最显着的关联是与 rs4430796(p = 1.62 x 10(-24))。 即使在对 rs4430796 进行调整后(p = 0.007),风险也与 rs7405696(p = 9.35 x 10(-23)) 相关。 在该区域的第二个位点,前列腺癌风险与 rs11649743 相关(p = 3.54 x 10(-8)),但发现与 rs4794758 的关联性更强(p = 4.95 x 10(-10)),这解释了当两个 SNP 都包含在同一模型中时使用 rs11649743 观察到的所有风险(rs116 的 p = 0.32) 49743;rs4794758 的 p = 0.002)。 序贯条件分析表明,5 个 SNP(rs4430796、rs7405696、rs4794758、rs1016990 和 rs3094509)共同构成了该区域的最佳风险模型。 该研究证明了 HNF1B 区域的变异与前列腺癌风险之间存在复杂的关系。