SIM bHLH 转录因子 1; SIM1
- SINGLE-MINDED, 果蝇,同源物,1
HGNC 批准的基因符号:SIM1
细胞遗传学位置:6q16.3 基因组坐标(GRCh38):6:100,385,008-100,464,928(来自 NCBI)
▼ 描述
SIM1 属于转录因子 bHLH/PAS(basic helix-loop-helix/Per-Arnt-Sim) 家族,其特征是 DNA 结合和二聚化所需的 N 端 bHLH 结构域和充当二级二聚化接口的 PAS 结构域。靶基因的转录控制需要与另一种转录因子、芳基烃受体核转位子(ARNT; 126110) 或中枢神经系统中普遍存在的同源物 ARNT2(606036) 进行异二聚化(Ramachandrappa 等人总结,2013)。
▼ 克隆和表达
Chrast 等(1997) 克隆了与果蝇 sim 基因 SIM1 和 SIM2 2 个同源物相对应的人胎儿肾 cDNA(600892)。SIM1 编码推导的蛋白质,含有 766 个氨基酸,计算分子量为 85 kD。人类和小鼠 SIM1 蛋白具有 96% 的氨基酸序列同一性。人 SIM1 的 N 端部分与 SIM2 的氨基酸一致性为 87.2%,其中包括保守的 bHLH、PAS1、PAS2 和 HST 结构域,C 端部分的氨基酸一致性为 18%,其中包含富含丝氨酸的区域。对 20 个成人和胎儿组织的 Northern 印迹分析仅在胎儿肾脏中检测到约 9.5 kb SIM1 转录物。
▼ 测绘
Chrast 等人通过荧光原位杂交和辐射混合作图(1997) 将 SIM1 基因定位于 6q16.3-q21。范等人(1996) 将小鼠 Sim1 基因定位到 10 号染色体的近端区域,位于 Fyn(参见 137025)和 Ros1(参见 165020)之间。
▼ 基因功能
持有者等(2000) 指出小鼠 Sim1 在发育中的肾脏和中枢神经系统中表达,对于下丘脑视上核和室旁核(PVN) 的形成至关重要。先前的神经解剖学和药理学研究表明 PVN 与体重调节有关:PVN 神经元表达黑皮质素 4 受体(MC4R;155541),并且似乎是 α-黑素细胞刺激激素(176830)的生理目标,该激素抑制食物摄入。
博内丰德等人(2013) 指出,芳基碳氢化合物受体核转位子之一(ARNT 或 ARNT2)需要作为 SIM1 的二聚化伴侣才能发挥转录因子的作用。
▼ 细胞遗传学
对小鼠和人类的研究揭示了许多基因突变会导致严重肥胖。霍尔德等人(2000) 研究了一名早发性肥胖且 1p22.1 和 6q16.2 之间平衡易位的女孩。霍尔德等人(2000) 对两个易位断点进行了克隆和测序。该易位似乎没有影响 1p 上的任何转录单位,但它破坏了 6q 上的 SIM1 基因,将 5 引物启动子区域和 bHLH 结构域与 3 引物 PAS 和假定的转录调控结构域分开。霍尔德等人(2000) 假设 SIM1 的单倍体不足,可能作用于 PVN 中 MC4R 的上游或下游,是导致患者严重肥胖的原因。Faivre 等人在一名患有 Prader-Willi 综合征(PWS; 176270) 样表型(包括肥胖)的男孩中。
▼ 动物模型
Sim1 无效等位基因纯合子(Sim1 -/-) 的小鼠缺乏室旁核(PVN),会在围产期死亡。相比之下,米肖等人(2001) 表明 Sim1 杂合子小鼠能够存活,但出现早发性肥胖,线性生长增加、高胰岛素血症和高瘦素血症。Sim1 +/- 小鼠食量过多,但它们的能量消耗并未减少,这使它们与其他早发性肥胖小鼠模型不同,例如缺乏瘦素(164160) 和黑皮质素受体 4(155541)。与正常同窝小鼠的定量组织学比较表明,Sim1 +/- 小鼠的 PVN 含有的细胞平均减少了 24%,而没有选择性损失任何可识别的主要细胞类型。由于 PVN 的获得性病变也会导致食欲增加,但能量消耗不会减少,