WD 重复含有蛋白 82; WDR82
- 跨膜蛋白 113; TMEM113
HGNC 批准的基因符号:WDR82
细胞遗传学定位:3p21.2 基因组坐标(GRCh38):3:52,254,423-52,278,648(来自 NCBI)
▼ 说明
WDR82 是哺乳动物 SET1A(611052) 和 SET1B(611055) 组蛋白 H3(参见 602810)lys4 甲基转移酶复合物的调节组件(Lee 和 Skalnik,2005;Lee 等人,2007)。 WDR82 另外与多种蛋白质复合物相关,包括含有伴侣蛋白的 TCP1(186980) 复合物和蛋白磷酸酶-1(PP1;参见 176875) 复合物(Lee et al., 2010)。
▼ 克隆与表达
在他们的图 3 中,Lee 等人(2010) 表明 WDR82 蛋白包含分布在整个分子中的 7 个 WD40 结构域。
▼ 测绘
Scott(2007) 根据 TMEM113 序列(GenBank AC092045) 与基因组序列(build 36.2) 的比对,将 TMEM113 基因对应到染色体 3p21.1。
▼ 基因功能
Lee 等人通过对 HEK293 细胞核提取物中的 WDR82 免疫沉淀的核蛋白进行质谱分析(2010) 鉴定出 WDR82 是几种蛋白质复合物的组成部分,包括 4 个不同的组蛋白 H3 lys4 甲基转移酶复合物、一个包含伴侣蛋白的 TCP1 复合物和一个 PP1 复合物。 他们进一步表征了 PP1 复合物,发现它含有 PNUTS(PPP1R10; 603771)、TOX4(614032)、WDR82 以及 PP1、PP1-α(PPP1CA; 176875)、PP1-β(PPP1CB; 600590) 或 PP1-γ(PPP1CC; 1769) 3 个催化亚基中的任何一种14)。 他们将这种复合物称为 PTW/PP1,其表观分子质量约为 200 kD,表明它的每个亚基包含 1 个分子。 突变分析表明,人类 WDR82 与小鼠 Pnuts 的中心结构域相互作用。 WDR82 不与任何其他人类 PTW/PP1 亚基直接相互作用。 PTW/PP1 复合物在体外有效地使小鼠 RNA 聚合酶 II(POLR2A;180660) 大亚基的分离 C 端结构域去磷酸化。 PTW/PP1 复合物在 HEK293 细胞的整个细胞周期中保持稳定,但其与染色质的关联受到调节。 PTW/PP1 在间期与染色质相关,在早期有丝分裂期间被排除在浓缩染色体之外,并在末期晚期重新加载到染色体上。
Austenaa 等人使用免疫共沉淀分析(2021) 发现 ZC3H4 和 WDR82 是小鼠骨髓源性巨噬细胞和 HeLa 细胞中的相互作用伙伴。 WDR82 和 ZC3H4 通过 ZC3H4 的 C 末端相互作用,形成复合物,起到基因外转录抑制子的作用。 染色质免疫沉淀测序分析表明,Wdr82 和 Zc3h4 的基因组分布重叠,并且这两种蛋白都被招募到小鼠巨噬细胞中 RNA 聚合酶 II 高占据的位点。 对小鼠巨噬细胞和 HeLa 细胞的进一步分析表明,WDR82 和 ZC3H4 抑制从顺式调控元件(例如增强子和启动子)转录的长非编码 RNA(lncRNA),并且复合物的转录终止需要这些 lncRNA 的第一个外显子。