ECM29 蛋白酶体接头和支架蛋白; ECPAS
ECM29,酵母,同源物; ECM29
- KIAA0368
HGNC 批准的基因符号:ECPAS
细胞遗传学位置:9q31.3 基因组坐标(GRCh38):9:111,360,684-111,484,382(来自 NCBI)
▼ 说明
KIAA0368 编码结合 26S 蛋白酶体的 200-kD HEAT 重复接头蛋白(参见 602706)(Gorbea 等人,2010)。
▼ 克隆与表达
Nagase 等人通过筛选大脑中表达的大蛋白(1997) 克隆了 KIAA0368,它编码预测的 1,441 个氨基酸的蛋白质。 RT-PCR 分析检测到所有检测的人体组织中都有表达,其中卵巢和大脑中的表达水平最高,其次是前列腺、胸腺、睾丸、骨骼肌和肾脏。
通过数据库分析,Gorbea 等人(2004) 获得了全长 KIAA0368,他们根据其酵母同源物将其命名为 ECM29。 预测的 1,839 个氨基酸蛋白包含一个 N 端二分核靶向信号、整个序列中至少 23 个 HEAT 基序、一个中央 Vps27/HGS(604375)/STAM(601899)(VHS) 样结构域和 2 个与 β-适应素(见 600157) N 端同源的潜在螺旋区域(作者称之为 HANT 结构域)。 戈尔比亚等人(2004) 还鉴定了 ECM29 N 末端的 2 个额外的替代序列。 蛋白质印迹分析在 HeLa 细胞中检测到 205-kD ECM29 蛋白。 Ecm29蛋白在小鼠睾丸和脑中表达较高,在肝脏中表达较低,在心脏和肾脏中几乎检测不到。 ECM29 与 HeLa 细胞中的 26S 蛋白酶体相关。 免疫荧光分析、共聚焦显微镜和计算分析表明 ECM29 定位于 HeLa 细胞的中心体、细胞核、内质网(ER) 和 ER-高尔基中间室。
▼ 基因功能
Gorbea 等人使用全基因组 2 杂交筛选和质谱分析(2010) 表明 ECM29 的 C 末端结合肌球蛋白(参见 160730)和驱动蛋白(参见 602809),而 N 末端结合内吞蛋白 VPS11(608549)、RAB11FIP4(611999) 和 rabaptin(RABEP1; 603616)。 全长 ECM29、ECM29 C 端半部和 ECM29 的小中心区域(但不是 EMC29 N 端半部)结合 26S 蛋白酶体。 共聚焦显微镜显示ECM29-26S蛋白酶体存在于flotillin(FLOT1;606998)阳性内涵体上,但不存在网格蛋白(参见118960)或caveolin(CAV1;601047)修饰的内涵体上。 戈尔比亚等人(2010) 提出 ECM29 作为将 26S 蛋白酶体偶联到特定细胞区室的转换因子。
Gorbea 等人利用 RNA 干扰(2013) 表明,人类细胞中 ECM29 的缺失导致 TLR3(603029) 依赖性信号传导增加,同时 TRAF3(601896) 丰度增加、IRF3(603734) 核定位增加以及自噬抑制。 他们提出 ECM29-26S 蛋白酶体在介导自噬、TLR3 转移和 TLR3 依赖性信号传导减弱中发挥作用。
▼ 测绘
通过辐射杂交分析,Nagase 等人(1997) 将 KIAA0368 基因对应到 9 号染色体。
Gross(2015) 根据 KIAA0368 序列(GenBank BC021127) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 KIAA0368 基因对应到染色体 9q31.3。