NK2 同源基因 8; NKX2-8
- NK2,果蝇,8 的同源物; NKX2.8
- NK2,果蝇,H的同源物; NKX2H
- NKX2-9,小鼠,同系物
HGNC 批准的基因符号:NKX2-8
细胞遗传学位置:14q13.3 基因组坐标(GRCh38):14:36,580,003-36,582,613(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Apergis 等人通过筛选人肝癌细胞 cDNA 表达文库是否能够结合启动子连接的偶联元件(PCE),该元件是甲胎蛋白(AFP; 104150) 基因启动子的一个位点(1998) 分离出编码 NKX2.8 的 cDNA,NKX2.8 是一种与果蝇 nk2 相关的蛋白质。 预测的 239 个氨基酸的 NKX2.8 蛋白是碱性的,计算的 pI 为 9.6。 NKX2.8包含nk2相关蛋白的特征同源基因和保守肽。 通过 SDS-PAGE 检测,体外翻译的 NKX2.8 蛋白迁移为大约 34 kD 的多肽。 Northern 印迹和 RT-PCR 分析显示,NKX2.8 在胎儿肝脏中以 1.6 kb mRNA 形式表达,但在成人肝脏中不表达,并且在表型与胎儿肝脏相似的 3 个细胞系中表达。 阿佩吉斯等人(1998) 发现 NKX2.8 与 PCF(Wen 和 Locker(1994) 确定的 AFP 发育调节因子)有几个共同特征:两者都结合 PCE,激活 PCE 的转录,并在与 AFP 相同的细胞类型中表达。
▼ 基因家族
霍兰德等人(2007) 指出 NKX2-2(604612) 和 NKX2-8 基因与果蝇 vnd 共同是直系同源的,并构成 Nk2.2 基因家族。
▼ 基因结构
通过对基因组克隆的分析,Apergis 等人(1998) 确定 NKX2.8 基因含有一个内含子。 开放解读码组的 GC 含量异常高,高达 71%。
桑塔加蒂等人(2001)发现NKX2.8的序列与小鼠中的Nkx2-9的序列最相似,并指出这2个基因是直系同源的。
▼ 测绘
桑塔加蒂等人(2001) 在 3 种脊椎动物中观察到 Pax9(167416) 和 Nkx2-9 之间的保守同线性:人类、小鼠和日本河豚(Fugu rubripes)。 在人类中,NKX2.8 基因位于 PAX9 上游约 80 kb 处。 PAX9 和 NKX2.8 在染色体 14q12-q13 上头对头定位。