染色体排列维持磷酸蛋白 1; CHAMP1
- CAMP; CHAMP
- 锌指蛋白 828;ZNF828
- 13 号染色体开放解读码组 8;C13ORF8
- KIAA1802
HGNC 批准的基因符号:CHAMP1
细胞遗传学位置:13q34 基因组坐标(GRCh38):13:114,314,502-114,327,321(来自 NCBI)
▼ 描述
微管与动粒的正确附着对于染色体的准确分离至关重要。CHAMP1 是维持着丝粒-微管附着和中期板上染色体排列所需的锌指磷蛋白(Itoh et al., 2011)。
▼ 克隆和表达
Nagase 等人通过对从大小分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,(2001) 克隆了 CHAMP1,他们将其命名为 KIAA1802。推导的蛋白质含有821个氨基酸。RT-PCR ELISA 检测到所有成人和胎儿组织以及所检查的特定成人大脑区域中 CHAMP1 表达中等。
Itoh 等人通过对人脑 cDNA 文库进行 PCR 检测(2011) 克隆了 CHAMP1,他们将其称为 CAMP。推导的812个氨基酸的蛋白质在其N末端附近具有2个C2H2型锌指基序,在其C末端附近具有3个C2H2型锌指基序。CAMP 的中心区域包含 16 个 SPE 基序(共有序列,PxxSPExxK)、10 个 WK 基序(SPxxWKxxP)和 6 个 FPE 基序(FPExxK)。有丝分裂细胞的免疫荧光分析揭示了 CAMP 从中期到后期沿着染色体臂以及动粒和纺锤体纤维定位。数据库分析在脊椎动物中检测到 CAMP 直系同源物,但在蠕虫、苍蝇或酵母中未检测到。
▼ 基因功能
MAD2L2(604094) 在纺锤体组装检查点中发挥核心作用,确保所有染色体在后期之前正确的着丝粒-微管附着。Itoh 等人通过对表达表位标记的 MAD2L2 的 HEK293 细胞进行免疫沉淀分析,然后进行质谱分析(2011) 发现 CAMP 结合 MAD2L2。通过小干扰 RNA 消除 HeLa 细胞中的 CAMP,消除了 MAD2L2 的纺锤体定位,并减少了中期板上排列的染色体数量。CAMP 的敲低还引起纺锤体轴的旋转、多极纺锤体的形成以及不规则的 K 纤维厚度。CAMP 敲低细胞的活细胞成像显示染色体排列延迟,着丝粒附着的微管从未发展成粗 K 纤维,和在长期有丝分裂停滞期间逐渐从中期板移位的动粒对。CAMP 多个丝氨酸的有丝分裂磷酸化对于染色体排列至关重要。CAMP 与 CENPE(117143) 和 CENPF(600236) 共定位于动粒上,但它不直接与这些蛋白质相互作用。CAMP、CENPE 和 CENPF 的三重敲低对染色体排列没有附加作用,表明这些蛋白质在相同的途径中发挥作用。结构域分析显示,CAMP 的 WK 区域结合 MAD2L2,SPE 基序在有丝分裂过程中被磷酸化,FPE 基序参与纺锤体/动粒定位,CAMP 的 C 端锌指结构域参与染色体和纺锤体定位。CAMP的C端结构域对染色体排列也有抑制作用,
▼ Mapping
Hartz(2015) 根据 CHAMP1 序列(GenBank AK074894) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 CHAMP1 基因对应到染色体 13q34。
▼ 分子遗传学
解密发育障碍研究(2015)结合外显子组测序和基于芯片的染色体重排检测,对 1,133 名患有严重未确诊发育障碍的儿童及其父母进行了检查。作者确定了 2 名患有常染色体显性智力低下 40(MRD40; 616579)、畸形特征和先天性异常的患者,他们的 CHAMP1 基因(616327.0001-616327.0002) 存在从头功能丧失突变。没有进行功能研究。
Hempel 等人在 5 名具有 MRD40 的无关患者中(2015) 在 CHAMP1 基因(616327.0003-616327.0006) 中鉴定出 4 个不同的从头杂合截短突变。这些突变是通过外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实。尚未对这些变体进行功能研究,但预计所有变体都会产生一种截短的蛋白质,该蛋白质缺乏功能上重要的 C 末端结构域,该结构域调节 CHAMP1 定位到染色体和有丝分裂纺锤体,从而为其致病性提供机制理解。Rauch 等人报告了其中一名患者(2012)。
▼ 等位基因变异体(6 个选定示例):.
0001 智力低下,常染色体显性 40
CHAMP1,TRP334TER
在一名患有常染色体显性智力低下 40(MRD40;616579) 的男孩中,解密发育障碍研究(2015) 在 CH 中发现了从头杂合的 c.1002G-A 转变AMP1 基因,导致 trp334-to-ter(W334X) 替换。没有对该变体进行功能研究。
.0002 智力低下,常染色体显性 40
CHAMP1,ARG497TER
在一名患有常染色体显性智力低下 40(MRD40;616579) 的女孩中,解密发育障碍研究(2015) 发现 CHAMP1 基因中存在从头杂合的 c.1489C-T 转变,导致 arg497 到 ter(R4) 97X) 替代。没有对该变体进行功能研究。
.0003 精神发育迟滞,常染色体显性遗传 40
CHAMP1,2-BP DEL,1866CA
在一名患有常染色体显性遗传精神发育迟滞 40(MRD40;616579)的欧洲血统 4 岁男孩(A 族)中,Hempel 等人(2015) 在 CHAMP1 基因中发现了一个从头杂合的 2-bp 缺失(c.1866_1867delCA),导致移码和提前终止(Asp622GlufsTer8)。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,在 dbSNP(版本 136)、1000 基因组计划或 ExAC 数据库中不存在。尚未对该变体进行功能研究,但预计该突变会导致截短的蛋白质缺乏功能上重要的 C 末端结构域。
.0004 精神发育迟滞,常染色体显性遗传 40
CHAMP1,GLN590TER
在一名患有常染色体显性遗传精神发育迟滞 40(MRD40;616579) 的荷兰裔 3 岁男孩(B 族)中,Hempel 等人(2015) 鉴定了 CHAMP1 基因中的从头杂合 c.1768C-T 转变,导致 gln590 到 ter(Q590X) 的取代。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,在 dbSNP(版本 136)、1000 基因组计划或 ExAC 数据库中不存在。尚未对该变体进行功能研究,但预计该突变会导致截短的蛋白质缺乏功能上重要的 C 末端结构域。
.0005 精神发育迟滞,常染色体显性遗传 40
CHAMP1,ARG398TER
Hempel 等人在一名患有常染色体显性智力低下 40(MRD40; 616579) 的荷兰血统 18 岁男孩(C 家庭)中(2015) 鉴定了 CHAMP1 基因中的从头杂合 c.1192C-T 转换,导致 arg398 到 ter(R398X) 取代。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,在 dbSNP(版本 136)、1000 基因组计划或 ExAC 数据库中不存在。尚未对该变体进行功能研究,但预计该突变会导致截短的蛋白质缺乏功能上重要的 C 末端结构域。亨佩尔等人(2015) 指出 Rauch 等人发现了相同的从头 R398X 突变(2012) 51 名患有严重智力障碍的人中的 1 名接受了三重外显子组测序。
.0006 精神发育迟滞,常染色体显性遗传 40
CHAMP1,1-BP DEL,635C
在一名患有常染色体显性遗传精神发育迟滞 40(MRD40;616579) 的荷兰裔 3 岁女孩(D 族)中,Hempel 等人(2015) 在 CHAMP1 基因中发现了一个从头杂合的 1-bp 缺失(c.635delC),导致移码和提前终止(Pro212LeufsTer7)。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,在 dbSNP(版本 136)、1000 基因组计划或 ExAC 数据库中不存在。尚未对该变体进行功能研究,但预计该突变会导致截短的蛋白质缺乏功能上重要的 C 末端结构域。