溶质载体家族25，成员42； SLC25A42
HGNC 批准的基因符号：SLC25A42
细胞遗传学位置：19p13.11 基因组坐标（GRCh38）：19:19,063,993-19,113,029（来自 NCBI）
▼ 描述
SLC25A42 属于线粒体载体蛋白 SLC25 家族（Haitina 等，2006）。SLC25A42 是一种线粒体辅酶 A（CoA） 转运蛋白（Shamseldin 等人，2016 年总结）。
▼ 克隆和表达
通过搜索 SLC25 家族成员的数据库，Haitina 等人（2006） 鉴定了 SLC25A42 的 2 个剪接变体。推导的蛋白质含有418个氨基酸。定量实时PCR在所有检查的大鼠组织中检测到可变表达，其中在脂肪中表达最高，其次是下丘脑和包含胼胝体、穹窿、丘脑、下丘脑、视交叉、脑桥、中脑和小脑的大脑冠状切片。
▼ 基因结构
Haitina 等人（2006）确定SLC25A42基因含有7个外显子。
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通过基因组序列分析进行绘图，Haitina 等人（2006） 将 SLC25A42 基因对应到 19 号染色体。他们将小鼠基因对应到 8 号染色体。
▼ 分子遗传学
Shamseldin 等人发现，一名 16 岁男孩的父母是沙特近亲，患有周期性代谢危机，伴有不同程度的脑肌病特征和神经退行性病变（MECREN; 618416）（2016） 在 SLC25A42 基因（N291D; 610823.0001） 中发现了纯合错义突变。该突变是通过外显子组分析发现的，与家族中的疾病分离，并且在 ExAC 数据库或 700 个内部对照外显子组中未发现。分子模型表明 N291 残基面向底物结合凹槽的内部。该突变无法挽救吗啡敲低 slc25a42 基因的斑马鱼的运动缺陷表型，表明该突变导致功能丧失。
阿尔曼奈等人（2018） 在来自 8 个不相关的近亲家庭的 12 名 MECREN 患者中发现了 SLC25A42 基因纯合 N291D 突变。即使在家庭内部，表型也存在很大差异，作者认为外源因素和压力源可以调节疾病的严重程度。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。
尤索等人（2019） 在一名患有 MECREN 的沙特男孩中发现了纯合 N291D 突变。一名患有该疾病的无亲属关系的德国男孩的剪接位点突变是纯合的（610823.0002）。对德国患者的细胞分析没有显示典型的 SLC25A42 转录本，而是显示了 3 个异常转录本。与对照组相比，患者成纤维细胞的总细胞 CoA 减少了约 20%。这些突变是通过外显子组测序发现并通过桑格测序证实的，在所有未受影响的父母中都发现了杂合状态，证实了分离。
▼ 动物模型
Shamseldin 等人（2016） 发现斑马鱼 slc25a42 基因的吗啡啉敲低会导致早期运动发育缺陷、肌肉无力和尾巴弯曲。突变动物还存在严重的肌肉紊乱和线粒体异常，包括线粒体内膜碎片和对照组中观察到的致密膜网络的缺失。
▼ 等位基因变异体（2 个选定示例）：
.0001 代谢危机，反复发作，具有不同的脑肌病特征和神经功能衰退
SLC25A42、ASN291ASP
Shamseldin 等人对一名 16 岁男孩进行了研究，该男孩的父母是沙特近亲，患有复发性代谢危象，伴有不同程度的脑肌病特征和神经功能退化（MECREN; 618416）,（618416）（2016） 在 SLC25A42 基因中鉴定出纯合 c.871A-G 转换（c.871A-G，NM_178526），导致高度保守残基处的 asn291 到 asp（N291D） 取代。该突变是通过外显子组分析发现的，与家族中的疾病分离，并且在 ExAC 数据库或 700 个内部对照外显子组中未发现。分子模型表明 N291 残基面向底物结合凹槽的内部。该突变无法挽救吗啡敲低 slc25a42 基因的斑马鱼的运动缺陷表型，表明该突变导致功能丧失。
阿尔曼奈等人（2018） 在来自 8 个不相关的中东近亲家庭的 12 名 MECREN 患者中发现了 SLC25A42 基因纯合 N291D 突变。即使在家庭内部，表型也存在很大差异，作者认为外源因素和压力源可以调节疾病的严重程度。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。作者将 N291D 称为该人群的创始人等位基因。
尤索等人（2019） 在一名 6 岁男孩中发现了纯合 N291D 突变，该男孩由沙特近亲结婚父母所生，患有 MECREN。该突变是通过外显子组测序发现并通过桑格测序证实的，在每个未受影响的亲本中都发现了杂合状态，证实了分离。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。
.0002 代谢危机，复发性，具有不同的脑肌病特征和神经功能衰退
SLC25A42，IVS5DS，TA，+2
Iuso 等人在一名 9 岁德国男孩中发现，该男孩的父母无关，患有复发性代谢危象，伴有不同程度的脑肌病特征和神经功能退化（MECREN；618416）（2019） 在 SLC25A42 基因（c.380+2T-A, NM_178526.4） 的内含子 5 中发现纯合 T 到 A 颠换，导致剪接位点改变。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的，在未受影响的父母中发现处于杂合状态，证实了分离。该变体曾在 gnomAD 数据库中以杂合状态被发现。对患者细胞的分析没有显示典型的 SLC25A42 转录本，而是显示了 3 个异常转录本。与对照组相比，患者成纤维细胞的总细胞 CoA 减少了约 20%。
