氧甾醇结合蛋白样蛋白 2; OSBPL2
- OSBP相关蛋白2;ORP2
- KIAA0772
HGNC 批准的基因符号:OSBPL2
细胞遗传学位置:20q13.33 基因组坐标(GRCh38):20:62,238,520-62,296,182(来自 NCBI)
▼ 描述
OSBPL2 是细胞内脂质受体 OSBP 家族的成员。有关 OSBP 的背景信息,请参见 OSBP2(606729)。
▼ 克隆和表达
通过筛选可能编码大脑中表达的大蛋白的 cDNA,Nagase 等人(1998) 鉴定了一个编码 OSBPL2 的 cDNA,他们将其称为 KIAA0772。KIAA0772 编码推导的 468 个氨基酸的蛋白质。RT-PCR 分析检测到 KIAA0772 广泛但中等表达,在骨骼肌和肺中表达水平较低。
Laitinen等人通过EST数据库搜索与OSBP(167040)同源的序列,然后进行RT-PCR(1999) 鉴定了 6 个 OSBP 相关蛋白,包括 OSBPL2,他们将其称为 ORP2。Northern 印迹分析显示主要 4.4-和 2.8-kb 转录本的广泛表达,这些转录本在脑、心脏、肾脏、肝脏和胎盘中最为丰富。在骨骼肌和心肌中,检测到了 6.6kb 和 1.2kb 的转录本,在大脑中,检测到了较小的 6.0kb 的转录本。
徐等人(2001)通过数据库检索和多轮cDNA文库筛选克隆了ORP2。ORP2 编码推导的 468 个氨基酸的蛋白质。荧光显微镜显示高尔基体中 ORP2 表达,布雷菲德菌素 A 处理导致其重新定位。
莱托等人(2001) 使用带有特异性引物的 RT-PCR 分析来分离编码 ORP2 的全长 cDNA。序列分析预测该 480 个氨基酸的蛋白质含有约 400 个氨基酸的 C 端甾醇结合(SB) 结构域,其中包括 OSBP 基序(EQVSHHPP)。ORP2 没有 N 端 血小板-白细胞C 激酶底物 同源(PH) 结构域。它与 OSBPL1B(606730) 最为同源,在 SB 结构域中具有 85% 的同一性。
贾沃斯基等人(2001) 克隆了多个 OSBP,包括 OSBPL2。RT-PCR 分析检测到 OSBPL2 普遍表达,在视网膜、视网膜色素上皮脉络膜、松果体和培养的视网膜色素上皮细胞中表达水平最高。
Xing 等人使用 RT-PCR(2015)发现Osbpl2在小鼠耳蜗和大脑中强烈表达,在心脏、肝脏、脾脏、肺、肾和肌肉中也表达。通过免疫组织化学分析,他们发现Osbpl2定位于小鼠耳蜗的血管纹、螺旋神经节、螺旋韧带、内毛细胞和外毛细胞。通过免疫组织化学分析,Thoenes 等人(2015) 发现 Osbpl2 在 P20 和 6 个月大小鼠的耳蜗外毛细胞和内毛细胞的静纤毛中显着表达。
▼ 基因功能
使用酵母互补分析,Xu 等人(2001) 表明 ORP2 过度表达会导致细胞生长停止。结合分析显示 ORP2 与磷脂酸的结合最强,与心磷脂和磷脂酰肌醇 3-磷酸的结合较弱。
▼ 基因结构
通过序列分析,Lehto 等人(2001)确定OSBPL2基因包含14个外显子。贾沃斯基等人(2001)发现它包含15个外显子。
▼
通过序列分析进行绘图,Lehto 等人。Jaworski et al.(2001) 将 OSBPL2 基因对应到 20 号染色体(2001) 证实了染色体 20q 上的定位。
▼ 分子遗传学
邢等人(2015) 研究了一个大的 7 代汉族家族(JSNY-028),该家族分离常染色体显性非综合征性听力损失(DFNA67;616340),其中已知 DFNA 基因的突变已被排除。通过对该家族 25 名受影响成员进行全外显子组测序,他们鉴定出了与 OSBPL2 基因外显子 3 中密码子 51/52 相对应的 2 bp 缺失(c.153_154delCT;606731.0001) 的杂合性。他们还研究了 26 名未受影响的家庭成员,发现该突变与该疾病完全分离。该突变根据 dbSNP(build 135)、1000 Genomes Project、HapMap 和 YanHuang 数据库进行筛选。邢等人(2015) 然后从不相关的常染色体显性非综合征性耳聋家系中筛选了 452 名散发患者和 38 名先证者,并鉴定了一个错义变异(c. 583C-A;L195M) 位于 OSBPL2 基因的外显子 7 中。在 300 个对照中没有发现这种突变;然而,没有家庭成员可以进行隔离分析。
Thoenes 等人在一个德国家庭中使用全基因组连锁分析和全外显子组测序来分离常染色体显性感音神经性听力损失(2015) 在 OSBPL2 基因中发现了杂合 2-bp 缺失(c.141_142delTG; 606731.0002)。在 1000 个基因组计划(版本 20110521)或外显子组变异服务器(ESP6500)数据库中没有发现这种与表型分离的突变。
▼ 历史
通过辐射杂交分析,Nagase 等人(1998) 将 OSBPL2 基因定位到 9 号染色体。
▼ 等位基因变异(2 个选定示例):.
0001 耳聋,常染色体显性 67
OSBPL2、2-BP DEL、153CT
Xing 等人通过对患有非综合征性听力损失(DFNA67; 616340) 的 7 代汉族家族(JSNY-028) 受影响成员进行全外显子组测序,(2015) 在 OSBPL2 基因的外显子 3 中发现了杂合 2-bp 缺失(c.153_154delCT, NM_144498.2)。删除将导致残基 52 后发生移码,如果翻译,将产生从密码子 52 到 151 的 99 个新氨基酸,并在密码子 152(Gln53ArgfsTer100) 处终止翻译。这种与该疾病在家族中分离的突变在 300 名种族匹配的对照中并未发现。该突变根据 dbSNP(build 135)、1000 Genomes Project、HapMap 和 YanHuang 数据库进行筛选。正常和预测的突变 OSBPL2 蛋白结构的比较表明,该突变可能破坏 OSBP 相关结构域,
.0002 耳聋,常染色体显性遗传 67
OSBPL2,2-BP DEL,141TG
通过全基因组连锁分析,然后对患有常染色体显性非综合征性听力损失的 6 代德国家庭的受影响成员进行全外显子组测序(DFNA67;616340),Thoenes 等人(2015) 在 OSBPL2 基因中发现了杂合 2-bp 缺失(c.141_142delTG, NM_144498.2)。该突变预计会导致移码和提前终止(Arg50AlafsTer103)。该缺失与家族中的表型分离,在 dbSNP(版本 135)、1000 基因组计划(版本 20110521)或外显子组变异服务器(ESP6500)数据库中不存在。