类克鲁伯因子 6； KLF6

B 细胞衍生 1；BCD1
原癌基因 BCD1
转录因子 ZF9；ZF9
核心启动子元件结合蛋白；COPEB

HGNC 批准的基因符号：KLF6

细胞遗传学定位：10p15.2 基因组坐标（GRCh38）：10:3,775,995-3,785,208（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

妊娠特异性糖蛋白（PSG）家族和相关基因的成员在其启动子区域没有 TATA 框或启动子。为了鉴定调节 PSG 基因表达的蛋白质，Koritschoner 等人（1997）用PSG5（176394）的核心启动子元件（CPE）筛选胎盘表达文库。他们分离了编码一种蛋白质的 cDNA，并将其称为“核心启动子元件结合蛋白”（CBPB 或 COPEB）。通过序列分析，Koritschoner 等人（1997）发现了 2 个可能的翻译起始密码子，使用它们将产生 283 或 290 个氨基酸的预测蛋白质。COPEB 包含一个 N 端酸性结构域、一个富含丝氨酸/苏氨酸的中心区域和 C 端区域的 3 个连续锌指结构域。体外COPEB翻译产物经SDS-PAGE检测质量为32kD。Koritschoner 等人使用表达 COPEB 的哺乳动物细胞（1997）表明 COPEB 能够将 PSG5 启动子的转录激活大约 4 倍。Gal4-COPEB 融合蛋白激活含有 Gal4 结合位点的异源启动子的转录。Northern 印迹分析显示，COPEB 在多种组织中以 4.5 kb mRNA 的形式表达，其中在胎盘中表达水平最高。

El Rouby 和 Newcomb（1996）鉴定了一种在 B 细胞中表达的新原癌基因，他们将其命名为 BCD1。他们通过其转化 NIH 3T3 细胞的能力，从 B 细胞慢性淋巴细胞白血病患者的外周血淋巴细胞中克隆了它。BCD1基因的表达仅限于2种组织：正常个体的CD19+ B细胞和睾丸。研究中 50% 的 B 细胞慢性淋巴细胞白血病患者的恶性 B 细胞未检测到 BCD1 基因转录本；然而，当刺激恶性 B 细胞进行终末分化为浆细胞时，BCD1 基因表达被诱导，表明与 B 细胞成熟有关。由于BCD1序列是从白血病患者身上分离出来的，Patrito 和 Bocco（1998）认为 COPEB 和 BCD1 之间的序列差异是肿瘤发展的结果。这些差异可能是由于 COPEB 和另一种普遍表达的蛋白质之间的重排导致融合蛋白，或者是由于 COPEB 中的多个突变。

实质组织中的伤口修复需要驻留间充质细胞的协调变化，最终导致纤维化。在肝脏中，这种反应涉及肝星状细胞，这是一种位于肝窦内皮下空间的非实质细胞类型。星状细胞表达肌源性中间丝结蛋白，在正常肝脏中，是类视黄醇的主要储存位点，类视黄醇存在于视黄酯的细胞质液滴中。其他器官中的类似细胞包括肾脏中的系膜细胞和肺中的肺成纤维细胞。星状细胞对损伤的反应被称为“激活”，代表一种具有独特时间序列的细胞程序，涉及基因表达的上调和下调。分离和培养星状细胞的方法可用于探索星状细胞活化的分子机制。为了扩大对参与激活过程的转录因子的搜索范围，使用消减杂交来鉴定单剂量四氯化碳（CCl4）（一种已知的肝纤维化促进剂）后体内大鼠星状细胞早期诱导的转录物。以这种方式分离出与锌指蛋白显示同源性的cDNA。拉齐乌等人（1998）分离了全长大鼠和人类 cDNA，他们将其命名为 ZF9，并表征了 ZF9 蛋白的产生。他们确定 ZF9 是激活细胞中的一种核 DNA 结合蛋白，它以上下文依赖性方式反式激活驱动星状细胞纤维化的关键启动子。ZF9 核苷酸序列预测它是 Kruppel 样家族的成员，具有富含丝氨酸-脯氨酸簇和亮氨酸的独特 N 末端结构域。ZF9 特异性结合含有 GC框基序的 DNA 寡核苷酸。拉齐乌等人（1998）指出 COPEB/BCD1 是 Zf9 的人类同源物。

▼ 测绘

El Rouby 等人的地图（1997）通过对人类/啮齿动物体细胞杂交体进行Southern印迹分析确定了BCD1的染色体分配，所述杂交体细胞在一个或多个杂交细胞系中含有单个染色体或多个不同的人类染色体。通过荧光原位杂交（FISH）确认并细化了 10 号染色体的分配，该基因将基因定位于 10p15-p14。作者：FISH，Onyango 等人（1998）进一步将地图位置细化至10p15。通过同样的方法，Ratzu 等人（1998）将 ZF9 基因分配给 10p。

▼ 分子遗传学

纳尔拉等人（2001）证明 KLF6 在人类前列腺癌的一个子集中发生突变。杂合性丢失分析显示，77%（22 个中的 17 个）原发性前列腺肿瘤中有 1 个 KLF6 等位基因缺失。对保留的 KLF6 等位基因的序列分析显示，71% 的肿瘤中存在突变。功能研究证实，野生型 KLF6 以不依赖于 p53 的方式上调 p21（WAF1/CIP1；116899），并显着降低细胞增殖，而肿瘤来源的 KLF6 突变体却不会。此外，纳尔拉等人（2001）证明来自同一患者的前列腺癌内的不同恶性病灶含有不同的 KLF6 突变。纳尔拉等人（2001）观察到 33 个前列腺肿瘤中有 18 个具有 KLF6 突变。在鉴定的 26 个突变中，23 个位于 KLF6 反式激活域内。这些突变导致 25 个非保守氨基酸发生变化并引入提前终止密码子。这些突变均不存在于患者的正常前列腺组织 DNA 或来自 50 个未受影响的无关个体的 100 条染色体的种系 DNA 中。大多数突变影响高度保守的氨基酸，表明这些残基具有重要的功能。

Cho 等人在一组 80 例散发性胃癌中（2005）在KLF6基因的外显子2中鉴定出4个错义突变（参见例如602053.0006）；相应的正常组织中不存在突变，表明体细胞突变。此外，37 个提供信息的病例中有 16 个（43.2%）显示 KLF6 位点等位基因丢失。所有突变病例以及16例等位基因丢失中的13例均为晚期肠型胃癌并伴有淋巴结转移。

▼ 等位基因变异体（6 个选定示例）：.

0001 前列腺癌、体细胞
KLF6、SER116PRO
在前列腺癌患者（176807）的肿瘤中，Narla 等人（2001）鉴定出 1 个 KLF6 等位基因的杂合性丢失和 T 到 C 的转变，导致氨基酸 116（S116P）处丝氨酸到脯氨酸的取代。

.0002 前列腺癌，体细胞
KLF6，SER137TER
在前列腺癌患者（176807）的肿瘤中，Narla 等人（2001）发现 KLF6 基因在 1 个等位基因上杂合性丢失，并且 C 至 A 颠换导致残基 137（S137X）处丝氨酸至终止密码子取代。

.0003 前列腺癌，躯体
KLF6，ALA123ASP
在前列腺癌患者（176807）的肿瘤中，Narla 等人（2001）鉴定了 C-A 颠换，导致肿瘤中残基 123（A123D）处丙氨酸替换为天冬氨酸，并导致野生型 KLF6 等位基因杂合性丧失。这些突变并未在种系中发现。

.0004 前列腺癌，体细胞
KLF6，TRP64ARG
在前列腺癌患者（176807）的肿瘤中，Narla 等人（2001）鉴定了 KLF6 基因中的 C 到 T 转变，导致第 64 位残基（W64R）处的色氨酸被精氨酸取代。肿瘤缺失了另一个 KLF6 等位基因。

.0005 前列腺癌，体细胞
KLF6，LEU169PRO
在前列腺癌（176807）患者的肿瘤中，Narla 等人（2001）鉴定了 KLF6 基因中的 T 到 C 转变，导致残基 169（L169P）处亮氨酸取代为脯氨酸。肿瘤还丢失了另一个 KLF6 等位基因。

.0006 胃癌，躯体
KLF6，SER155ARG
在肠型散发性胃癌（137215）的肿瘤组织中，Cho 等人（2005）鉴定了 KLF6 基因外显子 2 中 3412C-A 颠换的杂合性，导致反式激活结构域中的 ser155 到 arg（S155R）取代。在相应的正常组织中未发现该突变，提示存在体细胞突变。