前列腺癌相关非编码 RNA 1； PRNCR1

前列腺癌相关转录 8；PCAT8
癌症相关区域长非编码 RNA 4；CARLO3
lncRNA CARLO3

HGNC 批准的基因符号：PRNCR1

细胞遗传学位置：8q24.21 基因组坐标（GRCh38）：8:127,079,873-127,092,594（来自 NCBI）

▼ 描述

长非编码 RNA（lncRNA），例如 PRNCR1，是长度超过 200 bp 的转录物，不具有蛋白质编码潜力，并且在各种细胞过程中发挥作用（Kim et al., 2014）。

▼ 克隆和表达

通过对与前列腺癌相关的 8 号染色体区域进行精细定位和测序（参见 HPC10, 611100），Chung 等人（2011）鉴定了 PRNCR1。转录物长约 13 kb，并且是聚腺苷酸化的。PRNCR1 与 1 号染色体的 SRRM1（605975）转录物具有序列相似性。

Kim 等人通过对人类结直肠癌衍生细胞进行序列分析和 RACE（2014）在染色体 8q24.21 的一个区域中发现了几种 lncRNA，包括 PRNCR1，他们将其称为 CARLO3，该区域包含与癌症相关的变异和增强子活性。

▼ 基因结构

Chung 等人（2011）观察到 PRNCR1 转录本不包含内含子。

▼

通过基因组序列分析进行绘图，Chung 等人（2011）将 PRNCR1 基因定位到染色体 8q24。

通过序列分析，Kim 等人（2014）将 PRNCR1 基因对应到染色体 8q24.21 缺乏蛋白质编码基因的区域。

▼ 基因功能

使用实时定量 RT-PCR，Chung 等人（2011）发现，与从相同前列腺癌组织中显微解剖的正常前列腺上皮细胞相比，PRNCR1 的表达在 10 个显微解剖的前列腺癌细胞群中的 5 个和 4 个前列腺上皮内瘤变中的 2 个中上调。通过小干扰 RNA 双链体敲低 PRNCR1 会降低雄激素敏感的 LNCaP 前列腺癌细胞的细胞活力，并降低雄激素受体（AR; 313700）阴性前列腺癌细胞系的生长。雄激素刺激后，PRNCR1 的敲除降低了共转染 AR 报告基因的表达。

杨等人（2013）报道，在侵袭性前列腺癌中高度过表达的 2 个 lncRNA，PRNCR1 和 PCGEM1（605443），相继与 AR 结合，并强烈增强前列腺癌细胞中配体依赖性和配体非依赖性 AR 介导的基因激活程序和增殖。PRNCR1 与增强子上羧基末端乙酰化 AR 的结合及其与 DOT1L（607375）的关联似乎是将第二个 lncRNA PCGEM1 募集到 AR 氨基末端（该末端被 DOT1L 甲基化）所必需的。出乎意料的是，PCGEM1 招募的 pygopus-2（PYGO2; 606903） PHD 结构域对特定蛋白质标记的识别增强了 AR 结合增强子对这些细胞中靶基因启动子的选择性环化。在耐药性前列腺癌细胞中，这些过度表达的 lncRNA 可以与以下物质相互作用，并且是以下物质所必需的：截短和全长 AR 的强烈激活，导致 AR 转录程序的配体孤立激活和细胞增殖。在去势抵抗性前列腺癌细胞系中，针对这些 lncRNA 的条件表达短发夹 RNA 强烈抑制体内肿瘤异种移植物的生长。杨等人（2013）的结论是，这些过度表达的 lncRNA 有可能成为前列腺肿瘤去势抵抗的必要组成部分。

▼ 分子遗传学

Chung 等人（2011）在 PRNCR1 基因内发现了一个与前列腺癌易感性相关的 4-SNP 单倍型（p = 2.00 x 10（-24），OR = 1.74，95% 置信区间 = 1.56-1.93）。有关与前列腺癌相关的 8q24 染色体上多个孤立变异的讨论，请参见 HPC10（611100）。