RAS 相关蛋白 RAB38; RAB38

HGNC 批准的基因符号:RAB38

细胞遗传学位置:11q14.2 基因组坐标(GRCh38):11:87,809,489-88,175,503(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

雅格等人(2000)通过SEREX(cDNA表达文库的血清学分析)筛选了黑色素瘤cDNA文库,并分离了43个基因,其中2个,NY-MEL-1和NY-MEL-3(CAPG;606280),编码具有差异组织表达的新基因产物。 NY-MEL-1 编码 211 个氨基酸的 RAB-GTP 结合蛋白,命名为 RAB38。 雅格等人(2000) 指出,在 40 多种已知的 RAB 蛋白中,RAB38 具有独特的 COOH 末端,可以进行翻译后法尼基化和棕榈酰化,脂质修饰通常发生在 RAS 蛋白中,但不会发生在其他 RAB 蛋白中。 它也是唯一一个在黑素细胞中显示出主要 mRNA 表达的 RAB 基因,这是一种可能与黑素体转移和对接相关的细胞特异性表达模式。 Northern印迹分析显示在其他正常组织中没有检测到表达。 与这种谱系特异性一致,RAB38 mRNA 在 80% 至 90% 的黑色素瘤(19 例中的 17 例)中表达,但在非黑色素恶性肿瘤中很少表达(16 例中的 1 例)。 RT-PCR和Northern印迹分析显示正常组织中RAB38在睾丸中表达最高,在肿瘤细胞中表达不同,反映了这些细胞的增殖活性。

▼ 测绘

国际辐射混合测绘联盟将 RAB38 基因定位到 11 号染色体(stSG50874)。

Loftus 等人根据人类基因组序列数据(2002) 确定 11 号染色体上的 RAB38 基因座近端侧翼为 11q14-q21 处的酪氨酸酶(TYR; 606933),远端侧翼为 11q14.2-q22.3 处的 EED(605984) 和 11q13.5 处的 MYO7A(276903)。

▼ 动物模型

Loftus 等人通过使用微阵列分析(2002) 证明 RAB38 具有与黑素细胞基因相似的表达谱。 比较基因组分析将人 RAB38 定位于小鼠巧克力(cht) 基因座。 在 cht 小鼠中,他们在 Rab38 的保守 GTP 结合域中发现了 gly146 至 thr(G146T) 突变。 纯合突变小鼠表现出与酪氨酸酶相关蛋白 1(TYRP1;115501)突变的小鼠相似的棕色皮毛,这是一种眼皮肤白化病小鼠模型。 在纯合 cht 突变黑素细胞中,Tyrp1 蛋白靶向黑素体的能力受到损害。 这些观察结果以及 GFP 标记的 RAB38 与野生型黑素细胞中的终末期黑素体共定位的事实表明,RAB38 在 TYRP1 的分选中发挥作用。 这项研究证明了表达谱分析在鉴定哺乳动物疾病基因中的有用性。