PIF1,酿酒酵母,同源物; PIF1

  • PIF

HGNC 批准的基因符号:PIF1

细胞遗传学位置:15q22.31 基因组坐标(GRCh38):15:64,815,631-64,827,172(来自 NCBI)

▼ 说明

PIF1 是一种 5-prime-to-3-prime DNA 解旋酶,可负向调节端粒酶(参见 TERT;187270),端粒酶是一种维持端粒长度的逆转录酶(Zhang 等,2006)。

▼ 克隆与表达

通过在数据库中搜索大肠杆菌 RecD 的同源物,然后对 HEK293 细胞系 cDNA 文库进行 PCR,Zhang 等人(2006)克隆了PIF1。 推导的 641 个氨基酸的蛋白质的预测分子量为 71 kD,并包含 7 个保守的 DNA 解旋酶基序。

通过数据库分析和 HEK293 细胞的 PCR,Mateyak 和 Zakian(2006) 克隆了人类 PIF 的几种剪接变体。 Northern 印迹分析仅在胸腺中检测到 PIF 表达。 RT-PCR检测到普遍存在的PIF表达,在胸腺中表达最高,在心脏、大脑和骨骼肌中表达极低。 表位标记的 PIF 定位于转染的人细胞系的细胞核,并且 PIF 表达的离散核灶与 PML 体重叠或并置(参见 102578)。

▼ 基因功能

张等人(2006) 表明野生型 PIF1,而非 ATP 酶/解旋酶缺陷型 PIF1 突变体,在人纤维肉瘤细胞系中表达后引起端粒缩短。 PIF1 在体外降低端粒酶持续合成能力并解开端粒 DNA/端粒酶 RNA(TERC; 602322) 双链体,并且在体外和体内优先结合端粒 DNA。 张等人(2006) 提出 PIF1 抑制端粒酶的机制涉及端粒 DNA/端粒酶 RNA 复合物的解旋。

Mateyak 和 Zakian(2006) 使用同步 HeLa 细胞发现 PIF1 mRNA 和蛋白的表达受到细胞周期调节,在 S/G2 期晚期达到峰值。 PIF1的半衰期短,其降解是通过泛素化和蛋白酶体降解介导的。 后期促进复合物/环体激活剂过度表达后,PIF1 的丰度下降(参见 ANAPC1;608473)。 PIF1 与催化端粒酶亚基 TERT 相互作用,并且用来自人类细胞系的 PIF1 免疫沉淀端粒酶活性。

帕施克等人(2013) 表明 Pif1 解旋酶具有指数级有效的 G-四链体解旋作用,并且在整个进化过程中都是保守的。 来自经过超过 30 亿年进化分离的生物体的 Pif1 解旋酶抑制了酵母中 G-四链体基序的 DNA 损伤。 在缺乏 Pif1 解旋酶的情况下产生的 G-四链体诱导的损伤导致了新的遗传和表观遗传变化。 此外,当在酵母中表达时,人 PIF1 抑制 G-四链体相关的 DNA 损伤和端粒延长。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Zhang 等人(2006) 将 PIF1 基因定位到染色体 15q22.31。