RNA 结合基序蛋白 25; RBM25
- 富含 ARG/GLU/ASP 的蛋白质,120-KD;RED120
HGNC 批准的基因符号:RBM25
细胞遗传学位置:14q24.2 基因组坐标(GRCh38):14:73,058,531-73,123,898(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Fortes 等人使用质谱分析来鉴定与 HeLa 细胞核裂解物中剪接共激活剂 SRM160(SRRM1; 605975) 和 SRM300(SRRM2; 606032) 相关的蛋白质,然后进行数据库分析(2007) 鉴定了 RBM25,他们将其称为 RED120。 推导的 843 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 120 kD。 它包含一个 N 端富含脯氨酸的结构域,随后是一个 RNA 识别基序、一个富含 RE/RD 二肽的区域,以及一个预计参与 RNA 结合和 3 引物末端加工的 C 端 PWI 结构域。 免疫组织化学分析显示,RED120 集中在染色质间颗粒或核斑点中,并且在细胞质中检测到其他染色。
▼ 基因功能
Fortes 等人使用 HeLa 细胞核裂解物的相互免疫沉淀分析(2007) 证实了 RED120 和 SRM160 之间的直接相互作用。 RED120-SRM160 相互作用对 RNase 处理不敏感。 RED120 与多种剪接成分相关,包括 CBP80(NCBP1;600469)、Sm 蛋白(参见 603451)和小核 RNA(参见 180680)。 RNase 处理消除了 RED120 和 CBP80 之间的相互作用,但没有消除 RED120 和其他剪接组件之间的相互作用。 RED120 的免疫耗竭不会阻止 4 种不同前 mRNA 的剪接或切割。 RED120 在剪接后保持与 mRNA 的关联,并且在剪接后与 mRNA 衍生的外显子产物的关联比 cDNA 衍生的外显子更有效。
▼ 测绘
福特斯等人(2007) 指出 RBM25 基因对应到 14 号染色体。Hartz(2008) 根据 RBM25 序列(GenBank AK026107) 与基因组序列(build 36.1) 的比对,将 RBP25 基因对应到染色体 14q24.2。