含有 PAS 结构域的阻遏物 1; PASD1
- 癌睾丸抗原 63; CT63
- OXTES1
HGNC 批准的基因符号:PASD1
细胞遗传学位置:Xq28 基因组坐标(GRCh38):X:151,563,183-151,676,738(来自 NCBI)
▼ 说明
PASD1 与生物钟转录因子 CLOCK(601851)-BMAL1(ARNTL; 602550) 相互作用,抑制转录激活并抑制昼夜节律计时。 PASD1 仅在健康个体的种系组织中表达,但它可以在致癌转化后在体细胞来源的细胞中被诱导(Michael et al., 2015)。
▼ 克隆与表达
Liggins 等人通过使用弥漫性大 B 细胞淋巴瘤(DLBCL) 患者的血清筛选睾丸 cDNA 文库(2004) 鉴定了健康个体血清无法识别的几种新的或未表征的抗原,包括 OXTES1。
利金斯等人(2004) 表征了编码 OXTES1 抗原 PASD1 的基因。 他们鉴定了 PASD1 的 2 个变体,一个全长转录本和一个保留内含子 14 的转录本。全长转录本编码推导的 772 个氨基酸的蛋白质,该蛋白质具有 N 端内质网(ER) 保留信号,随后是包含核受体框的 PER(参见 602260)-ARNT(126110)-SIM(参见 603128)(PAS) 结构域、一个包含核受体框的卷曲螺旋结构域亮氨酸拉链和核定位信号,以及 C 端 ER 保留信号。 保留内含子 14 的变体编码全长异构体的前 638 个氨基酸,后面是一个额外的氨基酸和一个终止密码子。 它缺乏全长亚型的 C 端 ER 保留信号。 对多组织表达阵列的分析表明,PASD1 的表达仅限于睾丸。 RT-PCR 检测 DLBCL 系中的表达。
通过在数据库中搜索包含 PAS 结构域的蛋白质,Michael 等人(2015) 确定了 PASD1。 与 CLOCK 蛋白一样,PASD1 具有 PAS-A 结构域和 C 端螺旋区域,但缺乏 DNA 结合基本螺旋-环-螺旋(bHLH) 结构域和 PAS-B 结构域,而这些结构域对于 CLOCK 与 BMAL1 相互作用至关重要。 PASD1 在哺乳动物中广泛保守,但在小鼠谱系中不存在。 免疫荧光显微镜证明转染的 HEK293 细胞中两种 PASD1 亚型仅存在核定位。
▼ 基因功能
Michael 等人使用荧光素酶分析(2015) 证实 PASD1 不能驱动转录激活,并且 PASD1 的两种亚型都会抑制 CLOCK-BMAL1 活性。 免疫沉淀分析显示 PASD1 与 BMAL1 相互作用,但不与 CLOCK 相互作用。 突变分析表明 PASD1 的 C 末端足以抑制 CLOCK-BMAL1 活性。 PASD1 对 CLOCK-BMAL1 活性的调节是通过作用于 CLOCK 外显子 19 编码区域的 PASD1 C 端卷曲螺旋结构域发生的。 将 PASD1 引入细胞会减弱分子昼夜节律振荡器的稳健性。 在癌细胞系中,PASD1在黑色素瘤、非小细胞肺癌、大细胞肺癌和乳腺癌细胞系中表达最高。 人类癌细胞中 PASD1 的敲低导致昼夜节律周期的幅度显着增加。 迈克尔等人(2015) 得出结论,PASD1 在人类癌症中上调时会抑制生物钟功能,并提供从致癌转化到抑制昼夜节律的分子联系。
▼ 基因结构
利金斯等人(2004)确定PASD1基因包含16个外显子。
▼ 测绘
利金斯等人(2004) 指出 PASD1 基因对应到染色体 Xq28。