LINES HOMOLOG 1; LINS1

  • LINS
  • LINES, DROSOPHILA, HOMOLOG OF, 1
  • WINS1
  • FLJ10583

HGNC 批准的基因符号:LINS1

细胞遗传学位置:15q26.3 基因组坐标(GRCh38):15:100,566,913-100,603,031(来自 NCBI)

▼ 说明

LINS1 基因编码果蝇片段极性基因的人类同源物,该基因编码 WNT 信号通路的重要调节因子(参见,例如 WNT1, 164820)(Akawi 等人总结,2013)。

▼ 克隆与表达

Katoh(2002) 使用果蝇 Lin 作为查询来搜索人类 EST 数据库,然后对人类胎儿脑、肺、肝和肾的 Poly(A)+ RNA 混合池进行 PCR,克隆了 LINS,作者将其称为 WINS1。 推导的 757 个氨基酸的蛋白质包含 Lin 同源结构域,与小鼠 Wins2 具有 60.0% 的氨基酸一致性。 Northern 印迹分析在成人睾丸、前列腺、脾脏、胸腺、骨骼肌、胎儿肾脏和大脑中检测到 2.8 kb 转录本。 在测试的 8 个癌细胞系中均未检测到 LINS 表达。

▼ 基因结构

Katoh(2002)确定LINS基因含有7个外显子。

▼ 测绘

Katoh(2002)通过序列分析,将LINS基因定位到染色体15q26。

▼ 分子遗传学

纳吉马巴迪等人(2011) 对 136 个近亲家庭(超过 90% 是伊朗人,不到 10% 土耳其或阿拉伯人)进行了纯合性作图,随后进行了外显子富集和下一代测序,孤立了常染色体隐性智力障碍的综合征或非综合征形式。 在一个家庭(家庭 7903014)中,6 个孩子中有 4 个患有中度智力障碍和小头畸形,符合常染色体隐性遗传智力发育障碍 27(MRT27;614340),Najmabadi 等人(2011) 鉴定了 LINS 基因中的纯合截短突变(610350.0001)。

Akawi 等人的 2 名同胞,由也门血统的近亲父母所生,患有非综合征性 MRT27(2013) 鉴定了 LINS 基因中的纯合 5 bp 缺失,导致剪接缺陷和过早终止(610350.0002)。 该突变是通过纯合性作图和全外显子组测序的结合发现的。 阿卡维等人(2013) 表明,这些发现暗示 WNT 信号通路与人类认知和/或大脑发育有关。

▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):

.0001 智力发育障碍,常染色体隐性遗传 27
LINS1、4-BP DEL、985CATG
Najmabadi 等人对来自近亲家庭的 4 名患有常染色体隐性智力发育障碍 27(MRT27; 614340) 的儿童进行了研究(2011) 在 LINS 基因中发现了一个纯合的 4-bp 缺失,导致移码(His329fs)。 尽管临床细节有限,但患者患有小头畸形和智力障碍。

阿卡维等人(2013) 指出 Najmabadi 等人发现的删除(2011) 的外显子 5 中为 c.985_988delCATG,预计会导致移码和提前终止(His329Ter)。

.0002 智力发育障碍,常染色体隐性遗传 27
LINS1,c.1219_1222+1delAAAGG
Akawi 等人在 2 名同胞中,由也门血统的近亲父母所生,患有智力发育障碍 27(MRT27;614340)(2013) 在 LINS 基因(c.1219_1222+1delAAAGG) 中发现了一个纯合的 5-bp 缺失,改变了内含子 5 的 5 素供体剪接连接处和外显子 5 的 3 素末端的第一个共有核苷酸。对患者细胞的分析表明,该突变导致外显子 5 的跳跃,这可能导致缺乏几个保守氨基酸的截短蛋白质,这被预测为对蛋白质的功能有害。 该突变是通过纯合性作图和全外显子组测序的结合发现的。 未受影响的父母是杂合突变,而 200 名健康对照者中不存在这种突变。 患者精神运动发育迟缓,言语能力非常差或缺乏,点头,中面部轻度扁平,肌张力低下,生长不良。 他们没有小头畸形。