叉头框蛋白 N1; FOXN1

• 有翼螺旋裸色；WHN

HGNC 批准的基因符号：FOXN1

细胞遗传学位置：17q11.2 基因组坐标（GRCh38）：17:28,506,210-28,538,899（来自 NCBI）

▼ 描述

FOXN1 基因编码一种转录因子，调节胸腺和皮肤上皮细胞的发育。FOXN1 在胸腺上皮细胞前体中表达，胸腺上皮细胞前体与 T 细胞祖细胞相互作用，促进胸腺中 T 细胞的发育，因此在胚胎开始的胸腺发育中发挥着重要作用。FOXN1 还在角质形成细胞、毛囊、指甲基质床中的上皮细胞和脉络丛细胞中表达（Auricchio 等人，2005 年、Chou 等人，2014 年和 Bosticardo 等人，2019 年总结）。

▼ 克隆与表达

小鼠和大鼠“裸”位点的突变破坏了正常的毛发生长和胸腺发育，导致裸鼠和大鼠免疫缺陷。尼尔斯等人（1994）表明，位于已知含有裸基因座的小鼠11号染色体区域的名为whn的基因编码转录因子翼螺旋结构域家族的新成员。预测的蛋白质长度为 648 个氨基酸。小鼠和大鼠裸等位基因上的whn 基因被破坏。突变转录本不编码特征性DNA结合域，强烈表明whn基因是裸基因。翼螺旋结构域基因的突变会导致果蝇的同源异型转化，并扭曲线虫外阴发育过程中的细胞命运决定。

塞格雷等人（1995）证实whn中的突变在小鼠中产生裸表型，并确定了大鼠cDNA的序列，其突变产生无毛和无胸腺。

Schorpp 等人使用交叉杂交（1997）分离出小鼠whn基因的人类直系同源物。预测的人类蛋白质还含有 648 个氨基酸，其中 85% 与小鼠蛋白质相同。

弗兰克等人（1999） 指出，在哺乳动物中，Whn 表达发生在胸腺上皮细胞以及毛囊的特定细胞中。在人类中，他们在毛囊前皮层和外根鞘最内层细胞的分化细胞中检测到 WHN mRNA 表达。未测定胸腺中的表达。

▼ 基因结构

Schorpp 等人（1997） 表征了小鼠和人类 FOXN1 基因。两者均包含 8 个编码外显子并包含 2 个替代的第一外显子。

▼

Schorpp 等人通过辐射混合分析进行绘图（1997） 将 FOXN1 基因分配到染色体 17q11-q12。

▼ 基因功能

Balciunaite 等人使用 RT-PCR（2002） 检测到裸胎（即 Foxn1 缺陷）胎儿胸腺中的 Wnt1（164820） 表达以及成年野生型胸腺中的 Wnt1 和 Wnt3（165330） 表达，其中它们在胸腺上皮细胞（TEC） 中的表达与胸腺细胞的存在无关。裸胎儿和成年野生型胸腺还表达Wnt4（603490）、Wnt5b（606361）和Wnt10b（601906），而胚胎第13天的野生型胎儿胸腺仅表达Wnt4和痕量Wnt5b。荧光素酶报告基因分析表明 Wnt1 和 Wnt4 可以向 TEC 发出信号。然而，Wnt4 而非 Wnt1 的过度表达会诱导 Foxn1 mRNA 和蛋白质的增加。Foxn1 在 TEC 中的表达受到与 Fzd7（603410） 和 Fzd8（606146） 结合的 Wnt4 和 Wnt5b 的调节。巴尔丘奈特等人。

Bleul 等人利用小鼠体内细胞谱系分析（2006） 证明了出生后皮质和髓质 TEC 的共同祖细胞的存在。为了探究出生后祖细胞的功能，Foxn1 的条件突变等位基因在体内单个上皮细胞中恢复为野生型功能。这导致胸腺小叶的形成，其中包含支持正常胸腺生成的皮质和髓质区域。因此，Bleul 等人（2006） 得出结论，单个上皮祖细胞可以产生完整且功能性的胸腺微环境，这表明可以开发基于细胞的疗法来治疗胸腺疾病。

哺乳动物的外部着色需要色素供体和色素受体。色素供体是黑素细胞，它们在称为黑素体的不同细胞器中合成黑色素。色素受体是上皮细胞，它们获取并保留大部分皮肤黑色素。Weiner 等人通过对小鼠毛囊进行免疫荧光分析（2007） 检测到 Foxn1 主要在分化毛发皮质前体中，毛发皮质接收来自黑素细胞的色素。小鼠功能获得和功能丧失实验表明，Foxn1 激活色素受体表型，受体细胞释放 Fgf2（134920）。韦纳等人（2007） 指出人类 FOXN1 也在毛皮层前体中表达。通过对人体皮肤进行免疫荧光分析，他们在大量基底上角质形成细胞中检测到了 FOXN1，包括所有第一层基底上角质形成细胞。FOXN1 也在基底角质形成细胞的子集中被发现。韦纳等人（2007） 的结论是，在小鼠和人类中，FOXN1 与色素受体细胞群相关。

拉森等人（2019） 在小鼠 Foxn1 的第一个内含子内发现了一个保守的顺式调控元件，该元件对于 TEC 中 Foxn1 的表达至关重要。在小鼠体内删除该元件会导致 TEC 中 Foxn1 表达完全丧失，以及胸腺和 T 细胞发育的丧失，但对皮肤中 Foxn1 表达或功能没有影响。

▼ 分子遗传学

T 细胞免疫缺陷、先天性脱发和指甲营养不良

Frank 等人在 2 名患有 T 细胞免疫缺陷、先天性脱发和指甲营养不良的姐妹中（TIDAND; 601705）（1999） 鉴定了 WHN 基因中的纯合无义突变（255X; 600838.0001）。阿德里亚尼等人（2004） 报道了来自 Pignata 等人报道的同一意大利社区的另外 4 名儿童（1996）和弗兰克等人（1999） 患有先天性脱发并在儿童早期死于严重感染。对占村庄人口 30% 的 843 名居民进行 FOXN1 R255X 突变筛查，鉴定出 55 名（6.52%）杂合携带者。一项家谱研究显示，这些人属于 39 个家族，这些家族在一个由 483 人组成的 7 代谱系中相互关联。档案研究确定了一对出生于 19 世纪初的单祖夫妇，

在一名 3.6 岁男孩（受试者 2）中，其父母可能是法国/非洲血统的远亲，患有 TIDAND、Markert 等人（2011） 鉴定了 FOXN1 基因中的纯合错义突变（R320W; 600838.0002）。尚未对该变体进行功能研究，但预计它会消除 FOXN1 活性。没有对患者细胞中的变异进行研究，但患者患有胸腺发育不全并且完全缺乏循环T细胞。

马克特等人（2011） 在一名患有 TIDAND 的葡萄牙儿童中发现了纯合 R255X 突变。作者指出，该突变发生在外显子 4 中。并未对该变异进行功能研究，也没有对患者细胞进行研究，但尽管该患者患有先天性无胸腺，但其循环寡克隆 T 细胞水平较低。

拉达·拉玛·德维等人（2017） 报道了一名 1 个月大的女孩，其父母为印度近亲，患有 TIDAND 和外显子 4 中的纯合 R255X 突变。通过外显子组测序发现的该突变与该疾病在家族中分离。未受影响的父母是杂合子携带者。没有对该变体进行功能研究。患者接受3次造血干细胞治疗，临床无改善；她在婴儿期就去世了。拉达·拉玛·德维等人（2017） 指出 FOXN1 的外显子 1 是非编码的。

婴儿 T 细胞淋巴细胞减少症，伴或不伴指甲营养不良，常染色体显性遗传

Bosticardo 等人对 25 名患有常染色体显性婴儿 T 细胞淋巴细胞减少症（伴或不伴指甲营养不良）的儿童和 22 名成人进行了研究（TLIND; 618806）（2019） 鉴定了 FOXN1 基因中的杂合突变（参见，例如 600838.0001；600838.0002；600838.0006-600838.0010）。大多数突变是无义、移码或剪接位点，预计会导致功能丧失和单倍体不足，尽管 4 名患者携带错义突变。没有进行变异的功能研究和患者细胞的研究。大多数儿科患者是通过新生儿 SCID 筛查发现的：他们发现 T 细胞受体切除环（TREC） 减少和 T 细胞淋巴细胞减少。

杜等人（2019） 还发现了几名患有杂合 FOXN1 突变的儿童，这些儿童是通过新生儿筛查发现 TREC 减少而首次发现的。变体的体外功能研究显示转录活性不同程度地降低，范围为对照值的 2% 至 95%，尽管大多数低于 20%。杜等人（2019） 强调突变的位置影响特定的转录功能。表型差异很大：一些患者没有症状，没有感染，而另一些患者则有头发或指甲异常和/或感染。

T 细胞免疫缺陷伴胸腺发育不全

Du 等人在一名由无关父母所生的患有 T 细胞免疫缺陷伴胸腺发育不全的女婴中（TIDTA; 242700）（2019） 鉴定了 FOXN1 基因中的复合杂合突变：（c.933_936dup, 600838.0004 和 c.1089_1103del, 600838.0005）。尽管 c.1089del 发生在 DNA 结合结构域的 C 末端区域，但这两种突变都发生在 DNA 结合结构域的外显子 7 中。通过外显子组测序发现的这些突变均遗传自未受影响的父母。通过基因组编辑表达这 2 个同源突变的小鼠对 Foxn1 转录活性表现出不同的影响。复合杂合突变小鼠具有明显的胸腺发育不全，T细胞发育受损，但没有脱发或甲床营养不良，类似于在患者中观察到的表型。相比之下，4 bp 重复的纯合小鼠体型较小，具有胸腺发育不全、毛发脱落和指甲长度缩短的裸表型。15 bp 缺失的纯合小鼠胸腺发育不全，但毛发和指甲正常，与复合杂合小鼠相似。任一等位基因杂合的小鼠与对照组相似。使用转录报告分析的体外研究表明，c.933dup 突变导致截短的蛋白质几乎没有转录活性，而 c.1089del 突变保留了 31% 的活性，这表明突变的影响因位置而异。此外，c.933dup 突变的转录活性降低会影响毛囊和角质形成细胞，而 c.1089del 突变则不会。这些结果表明，与胸腺发育相比，FOXN1 在控制毛发和皮肤发育方面的需求存在功能上的二分性。杜等人（2019） 得出结论，DNA 结合区的 C 末端将胸腺上皮细胞发育与角质形成细胞发育分开。

▼ 动物模型

苏等人（2003） 生成了一个 Foxn1 等位基因，称为 Foxn1-δ，它编码缺少外显子 3 的转录本，导致该蛋白质的 285 个残基 N 末端有 154 个氨基酸缺失。该等位基因纯合的小鼠表现出异常的胸腺结构，缺乏皮质和髓质结构域。与缺乏 Foxn1 的裸鼠的胸腺相比，Foxn1-δ 纯合子小鼠的胸腺促进 T 细胞发育，但在双阴性和双阳性阶段都有特定的缺陷。苏等人（2003） 得出结论，TEC 分化的启动和进展是 FOXN1 在遗传上可分离的功能，并且 N 末端结构域是串扰依赖性 TEC 分化所必需的。

阿莫罗西等人（2008） 发现小鼠 Foxn1 基因在发育中的脉络丛上皮细胞中表达，脉络丛是一种填充胚胎大脑侧脑室、第三脑室和第四脑室的结构。研究结果表明 FOXN1 可能参与大脑和神经管的发育和功能。

陈等人（2009） 产生了胎儿胸腺中 Foxn1 表达正常的小鼠系，但与野生型相比，出生后胸腺中的表达降低。突变小鼠的 Foxn1 功能在新生儿阶段均正常，但与野生型小鼠相比，成年小鼠的胸腺尺寸显着减小。Foxn1 下调导致胸腺区室和皮质髓质连接的紊乱。它还减少了 TEC 的增殖并导致特定 TEC 子集的丢失，从而导致 T 细胞发育缺陷。这些表型与老年野生型小鼠胸腺中观察到的表型相似。

博斯蒂卡多等人（2019） 发现，与野生型小鼠相比，杂合性 Foxn1 +/- 裸鼠的早期胸腺祖细胞（ETC） 数量减少，表明 5 周龄前淋巴前体细胞向胸腺的迁移减少，此时趋于正常化。这些细胞的 MHC II 型抗原水平降低，表明分化受损。这与某些在 CD4+ 和 CD8+ T 淋巴细胞发育中重要的 Foxn1 靶基因的表达降低有关，包括 Ccl25（602565）、Cxcl12（600835）、Psmb11（611137） 和 Cd83（604534）。研究结果表明，Foxn1 单倍体不足对胚胎发育期间和生命最初几周的 TEC 具有重要影响。

▼ 等位基因变异体（10 个选定示例）：

.0001 T 细胞免疫缺陷、先天性脱发和指甲营养不良
T 细胞淋巴细胞减少症，婴儿，伴或不伴指甲营养不良，常染色体显性遗传，包括
FOXN1、ARG255TER（rs10489456） 2）
T细胞免疫缺陷、先天性脱发和指甲营养不良

Pignata 等人描述的两姐妹。Frank 等（1996） 患有 T 细胞免疫缺陷、先天性脱发和指甲营养不良（TIDAND; 601705）（1999） 在 FOXN1 基因的外显子 5 中鉴定出纯合 c792C-T 转换，导致 arg255 到 stop（R255X） 取代，并预测由于无义介导的 mRNA 衰减而导致该蛋白质完全缺失。弗兰克等人（1999） 将该表型鉴定为人类裸鼠的同源物。姐妹俩来自意大利南部一个地理位置偏僻的小社区。

阿德里亚尼等人（2004） 报道了来自 Pignata 等人报道的同一意大利社区的另外 4 名儿童（1996）和弗兰克等人（1999） 患有先天性脱发并在儿童早期死于严重感染。对占村庄人口 30% 的 843 名居民进行 FOXN1 R255X 突变筛查，鉴定出 55 名（6.52%）杂合携带者。一项家谱研究显示，这些人属于 39 个家族，这些家族在一个由 483 人组成的 7 代谱系中相互关联。档案研究确定了一对出生于 19 世纪初的单一祖先夫妇，单倍型分析与突变的单一祖先起源一致。

在对弗兰克等人报告的患者所在的村庄人口进行基因筛查期间（1999）起源于 Amorosi 等人（2008） 鉴定出一个 R255X 突变纯合的女性胎儿。妊娠15周时的终止后检查显示，胎儿缺乏胸腺，皮肤明显异常，比平时紧致，并显示基底增生和成熟障碍，提示分化受损。该表型与小鼠的 Nude/SCID 表型相同。此外，胎儿患有多种神经管缺陷，包括无脑畸形和脊柱裂。

维利亚诺等人（2011） 报道了对来自意大利南部高风险村庄的具有纯合 R255X 突变的人类胎儿的研究。尽管发现了一些缺乏 CD3 的无功能 CD8+ 细胞，但 CD4+ T 细胞成熟完全受阻，CD8+ 细胞严重受损。T 细胞受体的产生出现了一定的多样性，但与对照组相比，这种多样性受到了损害，并且 α/β TCR 水平较低。胎儿体内未发现胸腺组织。B细胞或自然杀伤细胞的发育没有异常。研究结果表明，FOXN1 对于人类子宫内 T 细胞的发育至关重要。有限数量的 CD8+ 细胞的鉴定表明这些细胞的胸腺外起源，这意味着 FOXN1 孤立的淋巴细胞生成。

马克特等人（2011） 在一名患有 TIDAND 的葡萄牙儿童中发现了纯合 R255X 突变。作者指出，该突变发生在外显子 4 中。并未对该变异进行功能研究，也没有对患者细胞进行研究，但尽管该患者患有先天性无胸腺，但其循环寡克隆 T 细胞水平较低。

拉达·拉玛·德维等人（2017） 报道了一名 1 个月大的女孩，其父母是印度近亲，患有 TIDAND 和纯合 R255X 突变。通过外显子组测序发现的突变与家族中的疾病分离。未受影响的父母是杂合子携带者。没有对该变体进行功能研究。患者接受3次造血干细胞治疗，临床无改善；她在婴儿期就去世了。

婴儿 T 细胞淋巴细胞减少症，伴或不伴指甲营养不良，常染色体显性遗传

奥里奇奥等人（2005） 和博斯蒂卡多等人（2019） 报告了 17 名患有常染色体显性婴儿 T 细胞淋巴细胞减少症并伴有或不伴有指甲发育不良的成年个体（TLIND; 618806），与 FOXN1 基因中的杂合 c.763C-T 转变（c.763C-T, NM_003593） 相关，导致 arg255 到 ter（R255X） 取代。这些患者是 Adriani 等人研究的一大群意大利患者的一部分（2004）和弗兰克等人（1999）。博斯蒂卡多等人（2019） 指出 R255X 突变在 gnomAD 数据库中频率较低（3.98 x 10（-6））。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。

.0002 T 细胞免疫缺陷、先天性脱发和指甲营养不良
T 细胞淋巴细胞减少症，婴儿，无指甲营养不良，常染色体显性遗传，包括
FOXN1、ARG320TRP
T 细胞免疫缺陷、先天性脱发和指甲营养不良

在一名 3.6 岁男孩（受试者 2）中，Markert 等人的父母可能是法国/非洲血统的远亲，患有 T 细胞免疫缺陷、先天性脱发和指甲营养不良（TIDAND; 601705）（2011） 在 FOXN1 基因的外显子 6 中发现了一个纯合的 c.987C-T 转换，导致在参与 DNA 结合的叉头结构域中高度保守的残基处发生 arg320 到 trp（R320W） 的取代。尚未对该变体进行功能研究，但预计它会消除 FOXN1 活性。没有对患者细胞中的变异进行研究，但患者患有胸腺发育不全并且完全缺乏循环T细胞。他成功接受了胸腺移植。

T 细胞淋巴细胞减少症，婴儿，无指甲营养不良，常染色体显性遗传

在一名患有常染色体显性婴儿 T 细胞淋巴细胞减少症但无指甲营养不良的 1 岁男孩（P3） 中（TLIND; 618806），Bosticardo 等人（2019） 在 FOXN1 基因中发现了一个杂合的 c.958C-T 转换（c.958C-T，NM_003593），导致 arg320 到 trp（R320W） 取代。该突变是通过对涉及免疫缺陷的基因进行靶向测序而发现的，在gnomAD数据库中发现频率较低（3.19 x 10（-5））。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究，但预计会导致单倍体不足。该患者是通过新生儿 SCID 筛查发现的，胸腺阴影较小，且反复上呼吸道感染。

.0003 T 细胞免疫缺陷、先天性脱发和指甲营养不良
FOXN1，1-BP DEL，562A
Chou 等人在一名黎巴嫩近亲父母所生女孩中发现，该女孩患有 T 细胞免疫缺陷、先天性脱发和指甲营养不良（TIDAND; 601705）（2014） 在 FOXN1 基因中发现了一个纯合 1-bp 缺失（c.562delA, NM_003593），预计会导致 N 端结构域中的移码和提前终止（Ser188fs）。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的，与家族中的疾病分离。在 dbSNP 或 1000 个基因组计划数据库中，或者在 80 个中东外显子组的内部集合中都没有发现它。尚未进行该变异的功能研究和患者细胞中的变异研究，但注意到她有一些循环记忆 T 细胞。她在 5 个月大时死于造血干细胞移植并发症。

.0004 T 细胞免疫缺陷伴胸腺发育不全（1 名患者）
FOXN1、4-BP DUP、933ACCC
在一名由无关父母所生的女婴（患者 1）中，患有 T 细胞免疫缺陷伴胸腺发育不全（TIDTA; 242700），Du 等人（2019） 鉴定了 FOXN1 基因中的复合杂合突变：4 bp 重复（c.933_936dupACCC），预计会导致移码和提前终止（Thr313fsTer169），以及 15 bp 缺失（c.1089_1103del；600838.0005），预计会导致 trp 到 cys 替换，然后是框内删除 5 个高度保守的氨基酸（Trp363_Pro367delinsCys）。尽管 c.1089del 发生在 DNA 结合结构域的 C 末端区域，但这两种突变都发生在 DNA 结合结构域的外显子 7 中。通过外显子组测序发现的这些突变均遗传自未受影响的父母。使用基因组编辑在小鼠中表达这 2 个同源突变显示出突变对 Foxn1 转录活性的不同影响。复合杂合突变小鼠具有明显的胸腺发育不全，T细胞发育受损，但没有脱发或甲床营养不良，与患者1中观察到的表型相似。相反，4-bp重复的纯合小鼠体型较小，具有裸露表型，伴有胸腺发育不全、毛发脱落和指甲长度缩短。15 bp 缺失的纯合小鼠胸腺发育不全，但毛发和指甲正常，与复合杂合小鼠相似。任一等位基因杂合的小鼠与对照组相似。使用转录报告分析的体外研究表明，c.933dup 突变导致截短的蛋白质几乎没有转录活性，而 c.1089del 突变保留了 31% 的活性，表明突变的影响因位置而异。此外，c.933dup 突变的转录活性降低会影响毛囊和角质形成细胞，而 c.1089del 突变则不会。这些结果表明，与胸腺发育相比，FOXN1 在控制毛发和皮肤发育方面的需求存在功能上的二分性。杜等人（2019） 得出结论，DNA 结合区的 C 末端将胸腺上皮细胞发育与角质形成细胞发育分开。而 c.1089del 突变却没有。这些结果表明，与胸腺发育相比，FOXN1 在控制毛发和皮肤发育方面的需求存在功能上的二分性。杜等人（2019） 得出结论，DNA 结合区的 C 末端将胸腺上皮细胞发育与角质形成细胞发育分开。而 c.1089del 突变却没有。这些结果表明，与胸腺发育相比，FOXN1 在控制毛发和皮肤发育方面的需求存在功能上的二分性。杜等人（2019） 得出结论，DNA 结合区的 C 末端将胸腺上皮细胞发育与角质形成细胞发育分开。

.0005 T 细胞免疫缺陷伴胸腺发育不全（1 名患者）
FOXN1，15-BP DEL，NT1089
用于讨论 FOXN1 基因外显子 7 中的 15-bp 缺失（c.1089_1103del），预计会导致 trp 到 cys 替换，然后框内删除 5 个高度保守的氨基酸（Trp363_ Pro367delinsCys），由 Du 等人在患有胸腺发育不全的 T 细胞免疫缺陷患者（TIDTA; 242700） 中发现，处于复合杂合状态（2019），参见 600838.0004。

.0006 T 细胞淋巴细胞减少症，婴儿，伴有指甲营养不良，常染色体显性
FOXN1，HIS321ASN
Bosticardo 等人在一名患有常染色体显性婴儿 T 细胞淋巴细胞减少症并伴有指甲营养不良的 4 岁女孩（P4） 中（TLIND; 618806）（2019） 在 FOXN1 基因中发现了一个杂合的 c.961C-A 颠换（c.961C-A，NM_003593），导致叉头结构域中发生 his321 到 asn（H321N） 的取代。该突变是通过对涉及免疫缺陷的基因进行靶向测序发现的，但在 gnomAD 数据库中并未发现。没有进行该变异的功能研究和患者细胞的研究，但预计该变异会导致单倍体不足。该患者是通过新生儿 SCID 筛查发现的，胸腺阴影较小、指甲营养不良、反复上呼吸道感染和特应性皮炎。她接受了造血干细胞移植，但没有治愈，

.0007 T 细胞淋巴细胞减少症，婴儿，伴或不伴指甲营养不良，常染色体显性
FOXN1，16-BP DEL，NT1201
Bosticardo 等人在 5 名无血缘关系的儿童（P9 至 P13）及其 2 名患有常染色体显性婴儿 T 细胞淋巴细胞减少症（伴或不伴指甲营养不良）的父母（P26 和 P29）中进行了研究（TLIND；618806）（2019） 在 FOXN1 基因中发现了一个杂合 16 bp 缺失（c.1201_1216del16, NM_003593），导致移码和提前终止（Pro401AlafsTer144）。该突变是通过对涉及免疫缺陷的基因进行靶向测序发现的，但在 gnomAD 数据库中并未发现。没有进行该变异的功能研究和患者细胞的研究，但预计该变异会导致单倍体不足。通过新生儿 SCID 筛查发现的儿科患者具有轻微的变异特征，包括胸腺阴影缺失（2 例）、指甲营养不良（1 例）、反复上呼吸道感染（1 例）、和特应性皮炎/湿疹（3）。一名成年患者患有指甲营养不良，另一名患者患有复发性中耳炎和肺炎。

.0008 T 细胞淋巴细胞减少症，婴儿，伴有指甲营养不良，常染色体显性
FOXN1，1-BP DEL，1418C
Bosticardo 等人在一名患有常染色体显性婴儿 T 细胞淋巴细胞减少症并伴有指甲营养不良的 4 岁女孩（P19） 中（TLIND; 618806）（2019） 在 FOXN1 基因（c.1418delC, NM_003593） 中发现了一个杂合 1-bp 缺失，导致移码和提前终止（Pro401AlafsTer144）。该突变是通过对涉及免疫缺陷的基因进行靶向测序发现的，但在 gnomAD 数据库中并未发现。没有进行该变异的功能研究和患者细胞的研究，但预计该变异会导致单倍体不足。该患者患有严重的疾病，胸腺阴影较小，并且反复呼吸道感染。她接受了造血干细胞移植，但没有治愈，这与 FOXN1 分子的胸腺内在作用一致。

.0009 T 细胞淋巴细胞减少症，婴儿，伴有指甲营养不良，常染色体显性
FOXN1，10-BP DEL，NT1392
Bosticardo 等人在 2 名患有常染色体显性婴儿 T 细胞淋巴细胞减少症并伴有指甲营养不良的无关儿童（P23 和 P24）中（TLIND; 618806）（2019） 在 FOXN1 基因（c.1392_1402del, NM_003593） 中发现了一个杂合的 10 bp 缺失，导致移码和提前终止（Pro465ArgfsTer82）。该突变是通过对涉及免疫缺陷的基因进行靶向测序发现的，但在 gnomAD 数据库中并未发现。没有进行该变异的功能研究和患者细胞的研究，但预计该变异会导致单倍体不足。这些患者患有严重的疾病，胸腺阴影较小，并且反复出现严重感染，包括 CMV 和 HHV6。一名患者接受了造血干细胞移植，但没有治愈，与 FOXN1 分子的胸腺内在作用一致。患者两年后去世。

.0010 婴儿 T 细胞淋巴细胞减少症，伴或不伴指甲营养不良，常染色体显性
FOXN1，1-BP DEL，907G
在一名 2 岁男孩（P2） 及其未受影响的母亲（P27） 中，Bosticardo 等人（2019） 在 FOXN1 基因中发现了一个杂合 1-bp 缺失（c.907delG, NM_003595），导致移码和提前终止（Glu303SerfsTer247）。该突变是通过对涉及免疫缺陷的基因进行靶向测序发现的，但在 gnomAD 数据库中并未发现。尚未进行该变体的功能研究，但预计该变体会导致单倍体不足。P2 是通过新生儿 SCID 筛查发现的，患有指甲营养不良，而他的母亲则没有症状。