乳糜泻,易感性,6; CELIAC6
- 麸质敏感性肠病,易感性,6
此条目中代表的其他实体:
- 自身免疫性疾病,包括 5 种疾病的易感性;AIS5,包括
细胞遗传学位置:4q27 基因组坐标(GRCh38):4:119,900,000-122,800,000
▼ 描述
乳糜泻,也称为乳糜泻和麸质敏感性肠病,是一种受环境和遗传因素影响的多因素小肠疾病。其特征是摄入小麦麸质或相关黑麦和大麦蛋白后小肠粘膜炎症损伤导致吸收不良(Farrell 和 Kelly,2002 年总结)。
有关乳糜泻遗传异质性的更多信息和讨论,请参阅 212750。
有关自身免疫的讨论,请参阅 109100。
▼ 测绘
对乳糜泻(CELIAC6) 和自身免疫(AIS5) 的易感性已定位到 4q27 区域,位于包含 KIAA1109(611565)、TENR(ADAD1)、IL2(147680) 和 IL21(605384) 基因的连锁不平衡(LD) 区域内。
乳糜泻易感性
在一项旨在确定乳糜泻(CD) 诱发因素的全基因组研究中,Van Heel 等人(2007) 鉴定了包含 KIAA1109、TENR(ADAD1)、IL2 和 IL21 基因的连锁不平衡(LD) 区块中的遗传变异作为 CD 的易感因素。他们利用来自英国(UK) 的 778 名 CD 患者和 1,422 名英国对照个体的 310,605 个全基因组 SNP,在染色体 4q27 上的 KIAA1109 基因(611565) 的 rs13119723(P = 2.0 x 10(-7)) 处实现了 HLA 区域之外最显着的连锁(参见 146880)。该关联在 2 个进一步的收集中得到证实,即 508 名荷兰 CD 患者和 929 名对照者以及 483 名爱尔兰 CD 患者和 560 名对照者(荟萃分析 P = 4.8 x 10(-11))。总体上最强的关联是在位于 IL21 基因 25 kb 5-prime 的 rs6822844(荟萃分析 P = 1.3 x 10(-14))处实现的。范·希尔等人(2007) 得出结论,染色体 4q27 的遗传变异位于跨越 KIAA1109、TENR(ADAD1)、IL2 和 IL21 基因的 LD 区块中,易患 CD。作者表示,由于广泛的 LD,无法确定 4q27 区域与 CD 相关的因果变异。
Hunt 等人在一个单独的复制样本中,包括来自 3 个孤立的欧洲乳糜泻收集中心的 1,643 例乳糜泻病例和 3,406 例对照(2008) 发现 rs6822844 显示与乳糜泻有很强的相关性(总体 P = 2.82 x 10(-13))。
在一项涉及 538 名乳糜泻患者和 593 名健康对照的意大利队列中,Romanos 等人(2009) 证实了 rs6822844 上的关联(p = 0.0253)。
自身免疫性疾病易感性
热尔纳科娃等人(2007) 假设 van Heel 等人报道的 KIAA1109/TENR/IL2/IL21 CD 易感区(2007) 可能代表多种自身免疫性疾病的一般风险位点。他们在 350 名 1 型糖尿病(T1D;参见 222100) 和 1,047 名类风湿关节炎(RA;180300) 影响的荷兰患者和 929 名对照者中测试了 rs6822844 与疾病的关联。与对照组(18.5%) 相比,T 等位基因频率在 T1D(12.7%) 和 RA(14.1%) 组中均出现下降。这种关联在 T1D(P = 0.0006,OR = 0.64,95% CI 0.50-0.83)和 RA(P = 0.0002,OR = 0.72,95% CI 0.61-0.86)中均显着。Wellcome Trust Case Control Consortium(2007) 在 T1D 的全基因组关联研究中报告了 4q27 上的一个位点,其中包含 KIAA1109/TENR/IL2/IL21 区域;Todd 等人的后续复制研究(2007) 表明 KIAA1109/TENR/IL2/IL21 区域的 SNP 与 T1D 存在中等关联。热尔纳科娃等人(2007) 在 Wellcome Trust Case Control Consortium(2007) 研究中发现,与 T1D 最相关的 SNP rs3136534 与 van Heel 等人鉴定的 SNP 之一完全 LD(2007),rs4505848。热尔纳科娃等人(2007) 发现与对照组相比,T1D 和 RA 患者的 rs4505848 的 G 等位基因略有增加。总的来说,Zhernakova 等人(2007) 发现 rs6822844 SNP 的 T 等位基因是单倍型 AATGG 的完美代表,
银屑病关节炎易感性
在一项对 223 名美国银屑病患者(包括 91 名银屑病关节炎患者和 519 名欧洲对照者)进行的全基因组关联研究中,Liu 等人在英国队列中进行了复制,该研究包括 576 名银屑病关节炎患者和 480 名对照者(2008) 发现了染色体 4q27 上一个基因座的证据,该基因座包含 IL2(147680) 和 IL21(605384) 基因。发现集中最显着的关联是与 rs13151961(p = 4 x 10(-5));rs13151961、rs7684187 和 rs6822844 在复制队列中显示与银屑病关节炎相关(p 值从 0.001 到 0.008)。刘等人(2008) 指出该区域与 PSORS3 基因座(601454) 和 CELIAC6 基因座重叠。