APH1 同源物 A,伽马分泌酶亚基; APH1A
- 前咽缺陷 1,C. 线虫,A 的同源物
HGNC 批准的基因符号:APH1A
细胞遗传学位置:1q21.2 基因组坐标(GRCh38):1:150,265,403-150,282,178(来自 NCBI)
▼ 描述
APH1 是一种多次跨膜蛋白,作为 γ-分泌酶复合物的功能成分,与早老素(参见 PSEN1,104311)和尼卡斯特林(NCSTN;605254)相互作用。γ-分泌酶复合物是许多膜蛋白的膜内蛋白水解所必需的,包括淀粉样β前体蛋白(APP; 104760) 和 Notch(190198)。
▼ 克隆和表达
通过在序列数据库中搜索秀丽隐杆线虫 Aph1 基因的同源物,该基因携带前咽缺陷表型的突变,Goutte 等人(2002) 鉴定了人类 APH1A 和 APH1B(607630)。预测的 251 个和 257 个氨基酸的 APH1A 和 APH1B 蛋白与线虫 Aph1 分别具有 33% 和 34% 的同一性。APH1A 已被 Lai 等人鉴定为 CGI-78(2000)。
弗朗西斯等人(2002) 在线虫中鉴定出 2 个早老素增强子:Aph1 和 Pen2(607632)。通过搜索序列数据库,他们将 APH1A 和 APH1B 鉴定为 Aph1 的人类同源物,并在小鼠、斑马鱼和果蝇中鉴定了同源物。预测的 247 个氨基酸的 APH1A 蛋白包含 7 个跨膜结构域,与 APH1B 具有 59% 的同一性,与小鼠 Aph1a 具有 99% 的同一性。弗朗西斯等人(2002) 还在人和小鼠中鉴定了 APH1A 的替代剪接形式,产生具有不同 C 末端的 265 个氨基酸的蛋白质。
李等人(2002) 从胶质母细胞瘤 cDNA 文库中分离出 APH1A 和 APH1B cDNA。通过Western blot分析,他们表明APH1A的相对分子质量约为30 kD。
▼ 基因功能
Goutte 等人(2002) 表明,Aph1 基因突变的线虫胚胎缺乏前咽,但可以发育出相对正常的后咽,这种表型与 Notch 通路成分突变相关的表型相似。在分析 Aph1 突变胚胎后,他们得出结论,Notch 成分 Aph2(尼卡斯特林)的细胞表面定位需要 Aph1 和早老素。
通过分析秀丽隐杆线虫突变表型,Francis 等人(2002) 确定在胚胎模式和胚胎后种系增殖中,Aph1 和 Pen2 是 Glp1/Notch 介导的信号传导所必需的。他们观察到,人类 APH1 和 PEN2 基因部分挽救了线虫突变表型,表现出保守的功能。人类 APH1 和 PEN2 必须同时提供才能拯救突变表型,而包含 PSEN1 则可以改善拯救。弗朗西斯等人(2002) 得出结论,APH1 和 PEN2 在同一过程中密切合作,促进早老素活性。Francis 等人使用 RNA 介导的干扰测定法灭活培养的果蝇细胞中的 Aph1、Pen2 或 nicastrin(2002)观察到β-APP和Notch底物的γ-分泌酶裂解减少以及加工的早老素水平减少。他们得出结论,APH1 和 PEN2 是 Notch 通路信号传导、β-APP 的 γ-分泌酶裂解和早老素蛋白积累所必需的。在评论中,Goutte(2002) 讨论了 Francis 等人的贡献(2002)目前对早老素如何介导Notch跨膜受体和跨膜β-APP的γ-分泌酶裂解的理解。
Lee 等人使用免疫共沉淀和镍亲和力下拉方法(2002) 表明哺乳动物 APH1A 和 APH1B 在体内与尼卡斯特林和早老素异二聚体物理相关。使用小干扰RNA灭活内源性APH1会导致早老素水平降低、γ-分泌酶底物积累以及γ-分泌酶产物减少。李等人(2002) 假设 APH1 是 APP 和 Notch 膜内蛋白水解所需的 γ-分泌酶复合物的功能成分。
γ-分泌酶活性需要形成稳定的高分子量蛋白质复合物,该复合物除了内切蛋白水解的早老素片段形式外,还含有尼卡斯特林、APH1 和 PEN2 等必需辅因子。高杉等人(2003) 表明果蝇 APH1 增加了复合物中果蝇早老素全蛋白的稳定性。通过 RNA 干扰消除 PEN2 可以防止早老素的内切蛋白水解,并促进果蝇和哺乳动物细胞(包括原代神经元)中全蛋白的稳定。果蝇 Pen2 与 Aph1 和 nicastrin 的共表达增加了早老素片段的形成以及 γ 分泌酶活性。因此,高杉等人(2003) 得出结论,APH1 稳定了复合物中的早老素全蛋白,
▼ 基因结构
通过基因组序列分析,Lee 等人(2002) 确定 APH1A 基因跨度为 3.6 kb。较长的 APH1A 同工型(APH1AL) 由 7 个外显子编码,而较短的同工型(APH1AS) 由 6 个外显子编码。
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通过辐射混合分析进行绘图,Francis 等人(2002) 将 APH1A 基因定位到 1 号染色体。
▼ 生化特征
冷冻电子显微镜
γ-分泌酶复合物由早老素(PSEN1; 104311)、PEN2(PSENEN; 607632)、APH1AL 和 NCSTN 组成,是一种膜嵌入蛋白酶,通过底物裂解控制许多重要的细胞功能。卢等人(2014) 报道了通过冷冻电子显微镜单颗粒分析确定的 4.5 埃分辨率的完整人类 γ-分泌酶复合物的 3 维结构。γ-分泌酶复合物包含一个马蹄形跨膜结构域,其中包含 19 个跨膜片段和一个来自尼卡斯特林的大细胞外结构域,该结构域位于跨膜马蹄形形成的中空空间的正上方。尼卡斯特林胞外结构域在结构上与以谷氨酸羧肽酶 PSMA 为代表的一大肽酶家族相似。