具有序列相似性的家族72,成员A; FAM72A

  • 潜膜蛋白 1 诱导蛋白;LMPIP
  • LMP1 诱导蛋白
  • UGENE

HGNC 批准的基因符号:FAM72A

细胞遗传学位置:1q32.1 基因组坐标(GRCh38):1:206,186,178-206,205,772(来自 NCBI)

▼ 克隆和表达

使用表达谱来鉴定结肠癌中上调的基因,然后进行结肠癌细胞系的 5-prime 和 3-prime RACE,Guo 等人(2008) 克隆了 FAM72A,他们将其称为 UGENE。推导的 149 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 16.9 kD。Northern 印迹分析在几种结肠癌细胞系中检测到 2.4 kb UGENE 转录物。表位标记的 UGENE 定位于转染细胞的细胞核。

Wang 等人通过对 12 种小鼠组织进行蛋白质印迹分析(2011)检测到 Fam72a 在胃中高表达,他们称之为 Lmpip,在肾脏和心脏中表达较低,在其他组织中几乎没有表达。胃的免疫组织化学分析显示 Lmpip 在小凹细胞、壁细胞和主细胞中表达。在肾脏中,Lmpip 主要表达于肾小球周围的内皮细胞、系膜细胞和上皮细胞中。HEK293 细胞的免疫荧光分析检测到点状细胞质分布的内源性 LMPIP,其中一部分 LMPIP 与线粒体相关。

使用实时 PCR 检测基因功能,Guo 等人(2008) 发现与匹配的正常组织相比,UGENE 表达在几种常见癌症中上调。蛋白质下拉和免疫共沉淀分析表明,UGENE 结合了 UNG2 的一个亚群,UNG2 是 UNG(191525) 的核亚型,参与 DNA 碱基切除修复。突变分析表明,UGENE 与 UNG2 N 端 25 个氨基酸结合,并且 UGENE 的 trp125 对于相互作用至关重要。UGENE 结合不会改变 UNG2 的核定位或活性。

Epstein-Barr 病毒(EBV) 癌蛋白潜膜蛋白 1(LMP1) 通过不同的基序激活许多细胞通路,从而改变细胞周期并保护细胞免于凋亡。王等人(2011) 观察到几种 EBV 感染的鼻咽癌(NPC) 中 LMPIP mRNA 和蛋白的表达升高。通过正常外周血单核细胞的 EBV 感染以及将 LMP1(而不是其他 EBV 基因)转染到 293 细胞中,LMPIP mRNA 和蛋白质的表达以时间依赖性方式上调。在培养中,LMPIP 的过度表达可保护 NPC 细胞免受 H2O2 诱导的活性氧产生、线粒体膜电位损失和线粒体细胞色素 c 释放的影响。LMPIP 的过度表达还加速细胞增殖并增强多个细胞周期基因的表达。敲低 NPC 细胞中的 LMPIP 表达会产生相反的效果,并降低裸鼠中 NPC 贴壁依赖性生长和致瘤性。

▼ 基因结构

郭等人(2008)确定FAM72A基因有4个编码外显子。

库茨纳等人(2015) 确定 FAM72A 基因跨度约为 16.2 kb。

通过基因组序列分析进行作图,Guo 等人(2008) 将 FAM72A 基因定位到染色体 1q32。他们在 1 号染色体上发现了 FAM72A 的额外拷贝。

王等人(2011) 鉴定了 2 个 FAM72A 拷贝:FAM72B(614711) 和 FAM72D(614712),分别对应到染色体 1p11 和 1p21。

▼ 进化

通过计算机分析,Kutzner 等人(2015) 发现 4 个 FAM72 基因中的每一个都与 1 号染色体相对链上的 SRGAP2 基因配对。FAM72/SRGAP2 基因对存在于脊椎动物中,但只有原始人类,包括尼安德特人和丹尼索瓦人,有 4 个旁系同源 FAM72/SRGAP2 对。没有物种拥有 2 或 3 个 FAM72/SRGAP2 基因对,包括黑猩猩和大猩猩,它们只有 1 个这样的基因对。