氧化戊二酸脱氢酶; OGDH
- α-酮戊二酸脱氢酶;AKGDH
-E1K
HGNC 批准的基因符号:OGDH
细胞遗传学位置:7p13 基因组坐标(GRCh38):7:44,606,571-44,709,065(来自 NCBI)
▼ 描述
α-酮戊二酸脱氢酶复合物是由 3 个蛋白质亚基组成的多酶复合物,氧化戊二酸脱氢酶,也称为 α-酮戊二酸脱氢酶或 E1k(EC 1.2.4.2.)、二氢硫辛酰琥珀酰转移酶(DLST,或 E2k;126063) 和二氢硫辛酰脱氢酶(DLD,或 E3;126063)。 238331)。该络合物催化克雷布斯三羧酸循环中的关键反应(Szabo 等人,1994 年总结)。
▼ 克隆和表达
Koike 等人(1992) 从胎儿肝脏 cDNA 文库中克隆了人类 OGDH cDNA。ORF编码40个氨基酸的前序列和963个氨基酸的成熟蛋白,分子量为108,642道尔顿。它位于内膜/基质隔室内的线粒体中。
▼ 基因结构
Koike(1995)发现人类OGDH基因包含22个外显子,跨度约85 kb。所有外显子/内含子剪接点均遵循 GT/AG 规则。初步延伸分析表明,OGDH 转录起始点是 ATG 起始密码子上游 55 bp 处的胸腺嘧啶残基。5素数侧翼区域缺少规范的 TATA 或 CAAT 框。
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使用 2 个人类/啮齿动物体细胞混合组进行绘图,Szabo 等人(1994) 将 OGDH 基因定位到 7p13-p11.2。第二个相关序列(可能是假基因)被鉴定并定位到 10 号染色体。
Koike(1995) 使用来自人类/啮齿动物体细胞杂交体的 DNA 并结合荧光原位杂交,将 OGDH 基因分配到条带 7p13 和 7p14 之间的边界。
▼ 基因功能
氧化戊二酸脱氢酶是催化2-氧化戊二酸转化为琥珀酰辅酶A的酶复合物的一个组成部分(Koike et al., 1992)。
萨博等人(1994)指出,在阿尔茨海默病大脑和培养的阿尔茨海默病患者皮肤成纤维细胞中,这种复合物的活性降低可能具有重要意义。
尹等人(2017) 证明 NRD1(602651) 是 OGDH 的正确折叠和稳定性所必需的。
刘等人(2019) 报道称,为了应对病毒感染,宿主细胞会损害 RNA m6A 去甲基化酶 ALKBH5 的酶活性(613303)。这种行为会增加 OGDH mRNA 上的 m6A 甲基化,从而降低其 mRNA 稳定性和蛋白质表达。OGDH 减少会减少病毒复制所需的代谢物衣康酸的产生。由于体内 Ogdh 和衣康酸产量减少,Alkbh5 缺陷小鼠表现出对病毒暴露的先天免疫反应孤立的抵抗力。刘等人(2019) 得出的结论是,他们的研究结果表明,m6A RNA 修饰介导的 OGDH-衣康酸途径下调会重新编程细胞代谢以抑制病毒复制,从而提出了控制病毒感染的潜在目标。
▼ 分子遗传学
Yap 等人在 2 名近亲结婚的叙利亚同胞中发现,患有氧化戊二酸脱氢酶缺乏症(2021) 鉴定了 OGDH 基因中的纯合错义突变(N320S; 613022.0001)。该突变影响了硫胺素结合所需的 TPP 结合域中的保守位点。对其中一名同胞的成纤维细胞进行的研究表明,与对照组相比,OGDH 蛋白表达降低,酶活性降低。叶等人(2021) 还表明,野生型人类 OGDH 的表达可挽救 Ogdh 缺陷果蝇的胚胎致死率,但具有 N320S 突变的人类 OGDH 并不能挽救致死率。此外,RNAi 敲低果蝇神经系统中的 Ogdh 会导致进行性运动缺陷,野生型 Ogdh 可以挽救这种缺陷,但具有 N320S 突变的 Ogdh 则不能挽救这种缺陷。
▼ 动物模型
Yoon 等人(2017) 证明,果蝇幼虫中 Ogdh 的敲低导致致死率增加,并且 α-酮戊二酸、谷氨酰胺和赖氨酸显着增加。感光细胞中 Ogdh 的敲低会导致突触传递逐渐丧失,类似于在敲低 Ogdh 分子伴侣 Nrd1(602651) 的果蝇中观察到的情况。Ogdh 的缺失导致 mTOR(601231) 活性增加,从而导致自噬减少。用雷帕霉素治疗 Ogdh 缺失果蝇可部分挽救光感受器缺陷,表明 mTOR 的过度激活是神经变性的基础。野生型人OGDH的表达能够挽救致死性缺陷。
▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):.
0001 氧化戊二酸脱氢酶缺乏症(1 个家族)
OGDH、ASN320SER
Yap 等人在 2 名近亲结婚的叙利亚同胞中发现,患有氧化戊二酸脱氢酶缺乏症(OGDHD;203740)(2021) 鉴定了 OGDH 基因外显子 8 中 c.959A-G 转变(c.959A-G, NM_002541.3) 的纯合性,导致高度保守残基处的 asn320 到 Ser(N320S) 取代。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,在父母和 3 名未受影响的同胞中均以杂合状态存在。ExAC 和 gnomAD 数据库中不存在该突变。对其中一名同胞的成纤维细胞进行的研究表明,与对照组相比,OGDH 蛋白表达和活性降低。与用野生型OGDH转染的细胞相比,用含有N320S突变的OGDH转染的HEK293细胞显示OGDH蛋白表达降低。