岩藻糖苷酶,α-L,1; FUCA1
- α-L-岩藻糖苷酶 1
- 岩藻糖苷酶,α-L,组织;FUCA
HGNC 批准的基因符号:FUCA1
细胞遗传学定位:1p36.11 基因组坐标(GRCh38):1:23,845,076-23,868,331(来自 NCBI)
▼ 描述
α-L-岩藻糖苷酶(EC 3.2.1.51) 是一种溶酶体酶,参与含岩藻糖糖蛋白和糖脂的降解(Occhiodoro 等,1989)。在人类中至少识别出 2 种孤立的多态性 α-L-岩藻糖苷酶:组织中的 FUCA1(岩藻糖苷沉积症中缺乏)(230000)和血浆中的 FUCA2(136820)。
▼ 克隆和表达
Occhiodoro 等人(1989)从人肝脏、胎盘和结肠 cDNA 文库中分离出几种 α-L-岩藻糖苷酶 cDNA,并构建了全长 FUCA1 cDNA。推导的蛋白质包含22个氨基酸的信号序列和461个氨基酸的成熟蛋白质。通过 Northern blot 分析,Kretz 等人(1992) 在淋巴母细胞、睾丸和上皮细胞中证明了 2.3 kb 的 FUCA1 mRNA。
在大鼠中,α-L-岩藻糖苷酶是一个四聚体,具有 2 个结构不同的亚基:α 和 β(Carlsen 和 Pierce,1972)。
▼
通过家庭研究绘制地图,Corney 等人(1977)表明Rh(111700)和α-岩藻糖苷酶密切相关。Goss-Harris 作图方法结合了家族重组研究和杂交细胞同线性测试的特征。当应用于 1 号染色体时,该方法显示 AK2(103020) 和 UMPK(191710) 位于 PGM1(171900) 的远端,并且位点的顺序为 PGM1: UMPK:(AK2, α-FUC): ENO1(172430)(Goss 和 Harris, 1977)。
基于椭圆形红细胞增多症和 PGD(172200) 家族分离以及常见的多态性 Rh、PGM1 和 α-岩藻糖苷酶,Cook 等人(1977) 得出结论,在雄性中,1p 的图谱是 1pter--PGD--18%--El--2%--Rh--2%--α-FUC--25%--PGM1--着丝粒。在女性中,上述区间估计分别为 22%、4%、2% 和 37%。Rouleau 等人绘制的 1 号染色体连锁图谱中(1990),FUCA1 被放置在 Rh 远端 8 cM 处。
卡里特等人(1982) 提出了 FUCA 位于 1p34 的证据。在体细胞杂交研究的基础上,Fowler 等人(1986)指出FUCA基因最可能的位置是1p34的远端区域。
假基因
Fowler 等人通过体细胞杂交 DNA 的 Southern 分析(1986)在2号染色体上检测到与FUCA基因同源的位点。他们将第二个位点命名为FUCA1L。Carritt 和 Welch(1987) 在体细胞杂交研究中使用 cDNA,证明了 2 号染色体上存在明显加工过的 FUCA 假基因。 Coucke 等人(1991)通过荧光原位杂交和指趾成像显微镜将假基因 FUCA1P 分配给 2q31-q32。通过 2q24-q32 中 FUCA1P 和 COL3A1(120180) 之间的连锁分析证实了定位,其在 3% 重组时的最大 lod 得分为 4.03。
▼ 基因结构
Kretz 等人(1992)报道了FUCA基因和岩藻糖苷酶假基因的结构。FUCA 包含 8 个外显子,跨度 23 kb。开放解读码组的 5-prime 序列显示多个转录因子结合位点,但没有 TATA 框。发现该假基因与 FUCA cDNA 80% 相同,但不包含开放解读码组。
▼ 分子遗传学
Roychoudhury 和 Nei(1988) 将等位基因变异的基因频率数据制成表格。
特纳等人(1975)通过薄层丙烯酰胺凝胶等电聚焦技术证明了α-岩藻糖苷酶的常见多态性。
在大约 20% 的岩藻糖苷沉积症家族中,Southern 印迹分析表明 FUCA1 基因开放解读码组中的单个 EcoRI 限制位点被消除。克雷茨等人(1989) 证明岩藻糖苷沉积症患者中 EcoRI 位点的缺失是由 FUCA1 基因中的 C 到 T 转变决定的,导致 gln351 到 ter 的取代(612280.0001)。
Seo 等人通过 PCR 扩增和测序 FUCA1 基因的所有 8 个外显子(1993) 确定了 6 个被认为导致岩藻糖苷沉积症的突变(612280.0005-612280.0010)。
克拉格等人(1997) 研究了 8 名根据临床和酶学依据诊断为岩藻糖苷沉积症的患者中 α-L-岩藻糖苷酶缺乏的分子基础。所有患者均未出现 FUCA1 基因缺失或明显改变。SSCP 分析随后对扩增的外显子和侧翼区域进行直接测序,确定了 8 名患者中 6 名的推定致病突变,这些患者患有严重的疾病,残留岩藻糖苷酶活性和蛋白质非常低。这 6 个突变中有 5 个以前没有被描述过。
威廉姆斯等人(1999)回顾了岩藻糖苷沉积症的突变谱。已检测到的 22 个突变包括 4 个错义突变、17 个无义突变和 1 个剪接位点突变。所有这些突变导致酶活性几乎消失,交叉反应免疫物质严重减少。因此,观察到的临床变异被认为是由于次要未知因素造成的。
▼ 等位基因变体(12 个选定示例):
.0001 岩藻糖苷沉积症
FUCA1、GLN351TER
在约 20% 的岩藻糖苷沉积症家族(230000) 中,Southern 印迹分析表明 FUCA1 基因开放解读码组中的单个 EcoRI 限制性位点被消除。克雷茨等人(1989)证明EcoRI位点的丢失是由C到T的转变决定的,这导致在正常终止密码子上游120bp处生成框内TAA终止密码子。
.0002 岩藻糖苷沉积症
FUCA1, 2-EX DEL
在岩藻糖苷沉积症(230000) 患者中,Willems 等人(1991) 证明岩藻糖苷酶基因 3-prime 末端有 2 个外显子缺失。该缺失导致岩藻糖苷酶活性可以忽略不计,并且免疫交叉反应蛋白严重减少。
.0003 岩藻糖苷沉积症
FUCA1、GLU375TER
在患有岩藻糖苷沉积症(230000) 的患者中,Yang 等人(1992) 证明了核苷酸 1141 处的 G 到 T 转变,将 glu375(GAA) 更改为终止密码子(UAA)。母亲,被称为“母本”,是杂合子。尽管关于临床表现的信息很少,但该疾病可能是早发且严重的类型。
.0004 岩藻糖苷沉积症
FUCA1,IVS5DS,GA,+1
在一名患有岩藻糖苷沉积症的 9 岁女孩中(230000),Williamson 等人(1993) 在 FUCA1 内含子 5 的 5-prime 剪接位点的第一个位置发现纯合 G 到 A 的转换。
.0005 岩藻糖苷中毒
FUCA1,GLN77TER
在 2 名患有岩藻糖苷中毒的犹太裔意大利同胞中(230000),Seo 等人(1993) 发现了复合杂合性,一种突变是 C 到 T 的转变,导致外显子 1 中的 gln77 到 ter 变化(Q77X)。
.0006 岩藻糖苷沉积症
FUCA1,TRP382TER
在一名意大利岩藻糖苷沉积症患者(230000) 中,Seo 等人(1993) 发现 C 到 A 的颠换导致外显子 6 中的密码子 382 从色氨酸变为终止密码子(W382X)。
.0007 岩藻糖苷沉积症
FUCA1,TYR211TER
在一名比利时岩藻糖苷沉积症患者(230000) 中,Seo 等人(1993) 发现外显子 3 中 C 至 A 颠换的纯合性,将密码子 211 从酪氨酸转换为终止密码子(Y211X)。
.0008 岩藻糖苷沉积症
FUCA1、1-BP DEL、EX2
在一名意大利岩藻糖苷沉积症患者(230000) 中,Seo 等人(1993) 鉴定了外显子 2 密码子 141(pro) 中单个胞嘧啶缺失的纯合性,导致移码(P141FS)。
.0009 岩藻糖苷沉积症
FUCA1, 1-BP DEL, EX5
在一名患有岩藻糖苷沉积症的葡萄牙患者(230000) 中,Seo 等人(1993) 在外显子 5 中发现了一个单碱基(C) 缺失,导致移码(S265FS)。
.0010 岩藻糖苷沉积症
FUCA1、1-BP DEL、EX3
在一名加拿大-印度岩藻糖苷沉积症患者(230000) 中,Seo 等人(1993) 发现了复合杂合性,一种突变是 FUCA 基因外显子 3 中的单碱基(A) 缺失,导致移码(S216FS)。
.0011 FU1/FU2 多态性
FUCA1、GLN281ARG
Cragg 等人(1994) 证明,gln281 至 arg(Q281R) 氨基酸取代是人 α-L 岩藻糖苷酶中常见电泳多态性(Fu1/Fu2) 的基础。
.0012 岩藻糖苷中毒
FUCA1,LEU405ARG
Fleming 等人(1998) 描述了一名岩藻糖苷沉着症患者(230000) 纯合状态下 FUCA1 基因中的 leu405-to-arg(L405R) 突变,该患者在 1997 年进行审查时年龄为 46 岁。据说这是第一个关于活到 50 岁的岩藻糖苷沉着症患者的报告。取代的氨基酸在 4 个物种中是保守的。α-岩藻糖苷酶的残余活性低于1%,并且在患者的成纤维细胞中未发现交叉反应物质。Primrose(1975) 之前曾描述过该患者。