核仁蛋白 8; NOL8
- NOP132
HGNC 批准的基因符号:NOL8
细胞遗传学位置:9q22.31 基因组坐标(GRCh38):9:92,297,357-92,325,993(来自 NCBI)
▼ 说明
NOL8 是一种核仁蛋白,在核糖体生物合成中发挥作用(Sekiguchi 等,2006)。
▼ 克隆与表达
Sekiguchi 等人通过使用 RRAGA(612194) 作为诱饵进行酵母 2-杂交分析,然后进行数据库分析和 HeLa RNA 的 RT-PCR(2004) 克隆了 NOL8,他们将其称为 NOP132。 推导的 1,168 个氨基酸蛋白的计算分子量为 132 kD,在 N 端和 C 端区域与其小鼠直系同源物分别具有 83.8% 和 70.7% 的氨基酸同一性。 NOL8 包含 C 端核定位信号和 3 个预测的卷曲螺旋结构。 免疫荧光和免疫细胞化学研究将 NOL8 定位于核仁。
Jinawath 等人使用 cDNA 微阵列分析了 20 种弥漫型胃癌(2004) 鉴定出 NOL8 是与非癌性粘膜相比在胃癌组织中特异性上调的基因。 NOL8 具有 N 端 RNA 识别基序(RRM) 结构域和 C 端 KOG4365 结构域。 Northern 印迹分析在骨骼肌中检测到 4.4 kb 的转录物,而在其他 22 个检查的组织中几乎没有表达。 半定量RT-PCR检测7个胃癌细胞系中NOL8的表达; 所有细胞系均表现出比正常骨骼肌更高的 NOL8 表达。 使用 lambda 蛋白磷酸酶进行的免疫印迹分析表明 NOL8 被磷酸化。
▼ 基因功能
关口等人(2004) 表明 NOL8 在 Sf9 昆虫细胞中表达,与 RRAGA、RRAGC(608267) 和 RRAGD(608268) 共免疫沉淀。 通过使用 RRAGA 突变体进行酵母 2 杂交分析,他们发现 NOL8 特异性结合 GTP 结合的 RRAGA,但不结合 GDP 结合的 RRAGA。 酵母 2 杂交分析和 GST Pull-down 测定表明 NOL8 与 NIP7 相互作用(619204)。 在幼仓鼠成纤维细胞中,NOL8 分别与 RRAGA 和 NIP7 共定位于细胞核。 缺失分析和其他相互作用测定表明,NOL8 C 端氨基酸 966-1116 介导与 NIP7、RRAGA 和 RRAGC 的相互作用。 NOL8 的反义寡核苷酸抑制会导致 HeLa 细胞出现剂量依赖性生长抑制,并伴有 DNA 合成减少。
吉纳瓦斯等人(2004) 表明 NOL8 的 siRNA 敲低抑制了胃癌细胞的生长。 NOL8 敲低细胞的 FACS 分析显示亚 G1 细胞群有所增加。 吉纳瓦斯等人(2004) 得出结论,抑制 NOL8 表达会诱导细胞凋亡。
关口等人(2006) 对来自人 293EBNA 细胞的带有表位标记的 NOP132 进行免疫沉淀的蛋白质进行了表征。 质谱和数据库分析揭示了来自大核糖体亚基和小核糖体亚基的许多蛋白质,以及先前在人类前核糖体核蛋白复合物中表征的蛋白质。 在 NOP132 免疫沉淀物中也检测到了假定的 RNA 解旋酶 DDX18(606355) 和 DDX47(615428)。 使用 DDX18 或 DDX47 免疫沉淀的类似蛋白质补体。 免疫共沉淀实验证实 NOP132 与 DDX18 和 DDX47 相关,但与其他 DDX 蛋白无关。 RNase 处理显着降低了 NOP132 与 DDX18 和 DDX47 的关联,表明它们的相互作用取决于 RNA。 同样,RNase 处理释放了大部分 NOP132、DDX18 和 DDX47 相关蛋白。 在 HeLa 细胞中,NOP132、DDX18 和 DDX47 与核仁蛋白 KIAA0559(NAP1;608865) 共定位,小干扰 RNA 敲低 NOP132 会导致 DDX47 错误定位到核仁周围。 突变分析显示 NOP132 的卷曲螺旋区域与 DDX47 的 HELICc 基序相互作用。 关口等人(2006) 得出结论,在核糖体生物发生过程中,NOP132 是 DDX47 正确靶向核仁组织区所必需的。
▼ 基因结构
吉纳瓦斯等人(2004) 确定 NOL8 基因包含 16 个外显子,跨度为 30 kb。
▼ 测绘
Jinawath 等人通过基因组序列分析(2004) 将 NOL8 基因定位到染色体 9q22.32。