SEC61 转运蛋白，β 亚基; SEC61B

SEC61 复合体，β 亚基

HGNC 批准的基因符号：SEC61B

细胞遗传学位置：9q22.33 基因组坐标（GRCh38）：9:99,222,281-99,230,614（来自 NCBI）

▼ 描述

SEC61B 是异聚 SEC61 复合物的一个亚基，该复合物还包含 α（SEC61A1; 609213）和 γ（SEC61G; 609215）亚基。SEC61 复合体形成哺乳动物内质网（ER）易位子的核心，这是蛋白质穿过 ER 膜易位的跨膜通道（Greenfield 和 High, 1999）。

▼ 克隆和表达

Hartmann 等人（1994）从犬胰腺微粒体中纯化了 Sec61 复合物。他们使用基于肽序列的简并寡核苷酸来探测 HeLa 细胞 cDNA 文库，克隆了人类 SEC61B。推导的 96 个氨基酸蛋白质的计算分子量约为 10 kD。

▼ Mapping

Gross（2018）根据 SEC61B 序列（GenBank BC001734）与基因组序列（GRCh38）的比对，将 SEC61B 基因对应到染色体 9q22.33。

▼ 基因功能

SEC61 复合体是一种重要的易位成分，可以与核糖体或 SEC62（602173）/SEC63（608648）复合体结合，分别执行共翻译或翻译后转运（Wiertz et al., 1996）。最初认为它仅在蛋白质从细胞质易位到内质网中发挥作用。然而，维尔茨等人（1996），Bebok 等人（1998），陈等人（1998）和 Petaja-Repo 等人（2001）提出的证据表明，人类 SEC61 复合物还可以在多结构域整合膜蛋白从内质网逆行转运至胞质溶胶以进行蛋白酶体降解中发挥作用。

贝博克等人（1998）发现 CFTR（602421）可以在 HeLa 细胞胞质部分中与 SEC61B 形成复合物共免疫沉淀，这表明 CFTR 可以与 SEC61B 复合物从膜上切下。他们假设 SEC61B 护送复合膜蛋白逆行通过 SEC61 复合物，以便被蛋白酶体或其他蛋白水解系统降解。

通过将荧光标记的犬 Sec61a 转染到 COS-1 细胞中进行免疫定位，Greenfield 和 High（1999）确定 Sec61 复合物分布到 ER 和 ER-高尔基体中间室，但不分布到跨高尔基体网络。内源性Sec61b和Sec61g表现出相同的分布。另一种易位子成分，糖蛋白 Tram（参见 605190）也存在于 ER 后区室中，这表明哺乳动物 ER 易位子的核心成分并非永久驻留在 ER 中，而是通过特定的修复机制维持在 ER 中。

塞申斯等人（2009）通过使用成熟的 22,632 双链 RNA 文库在黑腹果蝇细胞中进行全基因组 RNA 干扰筛选，确定了登革热病毒（参见 614371）遗传所需的昆虫宿主因子。该筛选确定了 116 种候选登革热病毒宿主因子（DVHF）。尽管其中一些先前与黄病毒有关，但大多数 DVHF 最近与登革热病毒遗传有关。双翅目 DVHF 具有 82 个易于识别的人类同源物，并且使用靶向短干扰 RNA 筛选，他们显示其中 42 个是人类 DVHF。其中包括 NPR2（108961）、SEC61B、TMEM214、TAZ（300394）、EXDL2 和 CNOT2（604909）。塞申斯等人（2009）的结论是，这种重叠表明双翅目和人类宿主之间所需因子的显着保守。

▼ 分子遗传学

关联有待确认

贝斯等人（2017）在 2 名不相关的成年患者中鉴定了 SEC61B 基因的 2 个杂合变异（609214.0001 和 609214.0002），这些患者是从 102 名多囊肝病患者（参见例如 PCLD1, 174050）组成的队列中确定的，这些患者在 PRKCSH（177060）或 SEC63（60864）中没有突变8）基因以及谁接受了全外显子组测序。预计这些变异会导致功能丧失。与对照组相比，对患者中这些变异的频率进行统计分析表明，它是该疾病的候选基因。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究，但小鼠上皮细胞系中两个 Sec61b 等位基因的失活导致 Pkd1（601313）蛋白的水平几乎检测不到，并且有证据表明未折叠的蛋白反应被激活。Sec61b 的重新表达恢复了 Pkd1 水平。研究结果表明，SEC61B 的缺失会导致内质网中 PKD1 的成熟缺陷，这表明 PKD1 功能和信号传导受损在机制上是囊肿发生的基础。

▼ 等位基因变异体（2 个选定示例）：

.0001 意义不明的变异体
SEC61B、2-BP INS、102AA
该变异体被归类为意义不明的变异体，因为其对伴或不伴肾囊肿的多囊肝病的影响尚未得到证实（参见例如 PCLD1, 174050）。

Besse 等人对一名患有多囊肝病并伴有 1 个肾囊肿的 42 岁女性（患者 YU356）进行了研究（2017）在 SEC61B 基因中发现了一个杂合 2-bp 插入（c.102_103AA），预计会导致移码和提前终止（Arg34fs）。该变异是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的，但 ExAC 数据库中不存在该变异。患者有多个小肝囊肿和1个肾囊肿；没有提供更多临床细节。

.0002 意义不明的变体
SEC61B, c.1A-G
该变体被归类为意义不明的变体，因为其对伴或不伴肾囊肿的多囊肝病的影响尚未得到证实（参见例如 PCLD1, 174050）。

Besse 等人对一名患有多囊肝病但无肾囊肿的 51 岁男性（患者 T-38）进行了研究（2017）在 SEC61B 基因中发现了一个杂合的 c.1A-G 转变，预计会破坏起始密码子并导致功能丧失。该变异是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的，但 ExAC 数据库中不存在该变异。患者有多个小肝囊肿，无肾囊肿；没有提供更多临床细节。