tRNA 甲基转移酶 10A; TRMT10A

  • tRNA 甲基转移酶 10,酿酒酵母,A
  • RNA(鸟嘌呤-9-) 甲基转移酶域含蛋白 2 的同源物;RG9MTD2

HGNC 批准的基因符号:TRMT10A

细胞遗传学位置:4q23 基因组坐标(GRCh38):4:99,546,710-99,564,038(来自 NCBI)

▼ 描述

TRMT10A 预计会催化 tRNA 中鸟嘌呤 9 的甲基化(Igoillo-Esteve et al., 2013)。

▼ 克隆与表达

伊戈伊洛-埃斯蒂夫等人(2013)报道推导的全长TRMT10A蛋白含有339个氨基酸。它在其 N 末端附近具有单部分和二部分核定位信号、一个 tRNA(鸟嘌呤-N1)甲基转移酶结构域和一个 tRNA(鸟嘌呤 9-N1)甲基转移酶结构域。数据库分析揭示了几种剪接变体,其中一些被预测编码缺乏第二个甲基转移酶结构域的C端截短蛋白。Northern 印迹分析检测到大鼠组织中普遍存在 Trmt10a 表达,其中胰岛中表达最高。Western blot 分析显示,Trmt10a 蛋白在脑和胰岛中表达最高。人胚胎脑的原位杂交揭示了妊娠 8 周和 11 周时整个背侧端脑的 TRMT10A 表达,在心室区和边缘区表达最高。在后期阶段,TRMT10A 在小脑皮质和小脑核中检测到,但在背侧端脑中未检测到。内源性和荧光标记的 TRMT10A 在大鼠 INS-1E β 细胞的核仁以及人和大鼠胰岛细胞中表达。

▼ 基因结构

Igoillo-Esteve 等人(2013) 确定 TRMT10A 基因包含 8 个外显子,其中第一个是非编码外显子。

▼ 测绘

Igoillo-Esteve 等人(2013) 指出 TRMT10A 基因对应到染色体 4q23。

使用 RNA 干扰的基因功能,Igoillo-Esteve 等人(2013) 发现大鼠 INS-1E β 细胞中 Trmt10a 的敲低增强了总蛋白生物合成,但没有改变胰岛素含量或葡萄糖诱导的胰岛素分泌。TRMT10A 的敲低使分散的人胰岛和原代大鼠 β 细胞对游离脂肪酸和内质网应激诱导的细胞凋亡敏感。

▼ 分子遗传学

Igoillo-Esteve 等人在来自摩洛哥血统近亲家庭的 3 名同胞中发现,他们患有小头畸形、身材矮小和早发性糖尿病,对应到染色体 4q23(MSSGM; 616033)(2013) 鉴定了 TRMT10A 基因(R127X; 616013.0001) 中无义突变的纯合性。这种突变在家族中与疾病分离,但在对照组中没有发现。

Gillis 等人在来自乌兹别克族近亲犹太家庭的 3 名患有小头畸形、身材矮小和高胰岛素性低血糖的同胞中(2014) 鉴定了 TRMT10A 基因(G206R; 616013.0002) 中错义突变的纯合性。这种突变在家族中与疾病分离,但在对照组中没有发现。体外功能分析显示,与野生型相比,G206R 突变体的甲基化活性无法检测到。

▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):.

0001 小头畸形、身材矮小和葡萄糖代谢受损
TRMT10A、ARG127TER
Igoillo-Esteve 等人在来自摩洛哥血统近亲家庭的 3 名患有小头畸形、身材矮小和早发性糖尿病的同胞中(MSSGM; 616033)(2013) 鉴定了 TRMT10A 基因外显子 4 中 c.379G-A 转换的纯合性,导致高度保守残基处的 arg127-to-ter(R127X) 取代。该突变在家族中随疾病分离,在 51 个内部对照外显子组或 dbSNP(版本 135)、1000 基因组计划或外显子组变异服务器数据库中均未发现。通过 Western blot 和实时 PCR 分析患者淋巴母细胞,发现 TRMT10A 蛋白缺失,且 TRMT10A mRNA 表达显着降低;在杂合载体中观察到中间表达。

.0002 小头畸形、身材矮小和葡萄糖代谢受损
TRMT10A、GLY206ARG
来自乌兹别克族近亲犹太家庭的 3 名同胞患有小头畸形、身材矮小和高胰岛素性低血糖(MSSGM; 616033),Gillis 等人(2014) 鉴定了 TRMT10A 基因外显子 6 中 c.616G-A 转换的纯合性,导致高度保守残基处的 gly206 至 arg(G206R) 取代。在体外测定中,即使在突变酶的最高浓度下,G206R突变体的甲基化活性也完全检测不到,这表明与野生型酶相比,甲基化活性降低了至少10(4)倍。