SORTING NEXIN 27; SNX27

甲基苯丙胺反应记录 1；MRT1

HGNC 批准的基因符号：SNX27

细胞遗传学位置：1q21.3 基因组坐标（GRCh38）：1:151,612,026-151,699,079（来自 NCBI）

▼ 说明
分选连接蛋白家族的成员（参见 SNX1；601272），包括SNX27，含有 Phox 同源 (PX) 结构域，并参与内吞运输的调节（MacNeil 等，2007）。

▼ 克隆与表达
Joubert 等人通过亲和层析，使用对应于 5-HT4A (HTR4; 602164 ) 变体的合成序列作为诱饵，结合小鼠全脑提取物中的蛋白质，然后进行质谱分析，并对人类 cDNA 文库进行 PCR (2004)克隆了 SNX27A 和 SNX27B 亚型。推导的 SNX27A 和 SNX27B 序列包含 PDZ 结构域和 Phox 同源 (PX) 结构域，但 C 末端的长度不同。免疫荧光染色将 SNX27A 和 5-HT4A 定位于人鳞状癌细胞的早期内体。

通过质谱分析，Rincon 等人(2007)将SNX27鉴定为二酰基甘油激酶-zeta (DGKZ; 601441 ) 相关蛋白。他们指出，SNX27还包含 Ras（参见190020）关联（RA）域。Western blot 分析检测了人类、大鼠和小鼠细胞以及造血来源细胞系（包括人类 Jurkat T 细胞白血病和 K562 慢性粒细胞白血病系）中SNX27 的表达。亚细胞分级分离将SNX27主要定位于细胞质，部分定位于质膜和对应于高密度和低密度微粒体的内膜。Jurkat T 细胞的免疫荧光研究将内源性SNX27定位于胞质溶胶，并在囊泡结构中积累。删除研究表明，PX 结构域是囊泡定位所必需的，并且在缺少 PDZ 结构域的情况下，SNX27囊泡定位会降低。使用分选途径标记物的共定位研究将SNX27转定位至分选内体，并表明SNX27在循环内吞途径的囊泡中富集。

使用 PCR，Cai 等人(2011)克隆了人类SNX27的 2 个剪接变体，他们将其命名为 SNX27A 和 SNX27B。推导的SNX27A和SNX27B蛋白分别含有541和528个氨基酸。两种蛋白均具有 N 端 PDZ 结构域、PX 结构域和 RA 结构域。SNX27A和SNX27B之间的唯一区别是SNX27A的C端15个氨基酸被SNX27B中的2个氨基酸取代。人类细胞系的蛋白质印迹分析检测到表观分子质量为 60 kD 的内源性SNX27 。在猴子、大鼠、小鼠和水貂细胞系以及所有检查的大鼠组织中也检测到了Snx27蛋白。转染后，两种SNX27亚型均定位于核内体。数据库分析揭示了果蝇、蠕虫和斑马鱼中存在 SNX27直系同源物，但酵母中没有。

▼ 基因功能
Joubert 等人使用 HEK293 细胞中表达的 SNX27A 和 SNX27B 亚型(2004)表明 5-HT4A 与两种 SNXA27 亚型相互作用，这与合成肽的肽亲和色谱结果相反。使用 SNX27A 和 5-HT4A PDZ 结构域缺失突变体，他们发现野生型和 PDZ 缺失的SNX27和野生型 5-HT4A 都定位于早期内体；然而，PDZ 删除的 5-HT4A 未能与SNX27共定位。朱伯特等人(2004)得出结论认为，SNX27A 相互作用是将 HTR4 靶向早期内体所必需的。

通过免疫沉淀，Rincon 等人(2007)表明 SNX27A 和 SNX27B 同工型与 HeLa 细胞中的 DGKZ 相互作用。使用缺失突变体，他们表明这些相互作用需要 DGKZ 和两种SNX27亚型的 PDZ 结构域。Jurkat T 细胞中的SNX27囊泡关联在用 PI3K 抑制剂渥曼青处理后被破坏，表明SNX27囊泡定位需要 PI3K 产品。DGKZ C 端结构域的过度表达破坏了SNX27与囊泡的结合，表明SNX27与内源性 DGKZ 相互作用的破坏减少了SNX27与囊泡的结合。SNX27A 与小 GTPase RAB11（参见 RAB11A，605570）和转铁蛋白受体（TFRC；190010 ）的共定位进一步支持了SNX27在内吞回收机制中的作用。

通过质谱分析和 GST Pull-down 测定，MacNeil 等人(2007)表明SNX27 PDZ 结构域介导与 PSCDBP C 末端区域的相互作用 ( 604448 ) 内源蛋白的免疫共沉淀研究证明了SNX27、PSCDBP 和 cytohesin-1 (PSCD1; 182115 ) 之间的相互作用。麦克尼尔等人(2007)将SNX27和 PSCDBP 共定位于 HEK293 细胞早期内体区室的大结构，并表明SNX27可能将 PSCDBP 募集到内体膜上，在那里它们相互作用，在运输或信号传导机制中发挥作用。

蔡等人(2011)发现从 SNX27A 和 SNX27B 中删除 PX 结构域或同时删除 PX 和 PDZ 结构域会导致细胞质分布。PI3K 的抑制也减少了 SNX27A 与内体的关联。人脑 cDNA 文库的酵母 2 杂交分析表明，SNX27A 与 NR2C (GRIN26；138254 ) 相互作用。突变分析表明，NR2C 的 C 端 PDZ 结合三肽基序 (SEV) 直接与SNX27的 PDZ 结构域相互作用。对转染的 HEK293 细胞和小鼠脑提取物的免疫沉淀分析证实 NR2C 与SNX27相互作用。SNX27B 也获得了类似的结果。

▼ 测绘
Hartz (2012)根据SNX27序列 (GenBank AB007957 ) 与基因组序列 (GRCh37) 的比对，将SNX27基因映射到染色体 1q21.3。

▼ 动物模型
蔡等人(2011)以低于预期的孟德尔比率获得了Snx27 -/- 小鼠幼崽。Snx27 -/- 小鼠的体型比野生型和Snx27 +/- 同窝小鼠小，并且生长速度慢得多。所有Snx27 -/- 小鼠在断奶前死亡。Snx27 -/- 大脑显示 Nr2c 含量升高，并且从Snx27 -/- 大脑培养的皮层神经元在表位标记的 Nr2c 的表面内化方面受到损害。