溶质载体家族22(有机阳离子转运体),成员17; SLC22A17

  • 中性粒细胞明胶酶相关脂钙素受体;NGALR
  • 脑型有机离子转运体;银行CT;BOIT

此条目中代表的其他实体:

  • NGALR2,包含
  • NGALR3,包含

HGNC 批准的基因符号:SLC22A17

细胞遗传学位置:14q11.2 基因组坐标(GRCh38):14:23,346,310-23,352,886(来自 NCBI)

▼ 克隆和表达

使用表达克隆,Devireddy 等人(2005) 从小鼠 FL5.12 细胞 cDNA 文库中分离出 lipocalin-2 的细胞表面受体(LCN2; 147740),也称为 24p3。推导的 520 个氨基酸的蛋白质 Slc22a17 包含 12 个跨膜结构域。免疫印迹分析显示 60 kD 条带广泛表达,而 30 kD 条带在某些组织中表达受限。RT-PCR 和数据库分析表明较小的条带代表缺少 N 端 154 个氨基酸的剪接变体。

通过数据库搜索,Devireddy 等人(2005) 鉴定了高度保守的 SLC22A17 人类直系同源物,也被命名为 NGALR2。NGALR2 内部缺失了 57 个核苷酸,但在其他方面与 Ngalr1 剪接变体相同。它包含 11 个跨膜结构域。Fang 等人通过 RT-PCR 检测人食管癌细胞系 EC18(2007) 鉴定了第三个剪接变体 NGALR3。NGALR3 包含 125 个核苷酸的内部缺失,从而产生移码。推导的NGALR3蛋白含有207个氨基酸,具有独特的32个氨基酸C末端,并具有4个潜在的跨膜结构域。

Fang 等人使用 RT 半定量 PCR(2007)发现NGALR2和NGALR3在不同食管癌细胞系中的表达水平存在一些差异。对正常人体组织的 RT-PCR 分析表明 NGALR 变异体广泛表达。在食管癌组织中,70%(14/20)的病例中 NGALR3 表达上调,而 55% 的病例中 NGALR2 表达上调。

▼ 基因功能

德维雷迪等人(2005) 发现 Slc22a17 的异位表达赋予 HeLa 细胞结合和内化 Lcn2 的能力。Holo-Lcn2 的摄取增加了细胞内铁浓度,而 apo-Lcn2 螯合铁并将其转移到细胞外培养基中。在后一种情况下,细胞内铁浓度的降低诱导促凋亡蛋白 Bim(BCL2L11;603827) 的表达,从而导致细胞凋亡。在白细胞介素 3(IL3; 147740) 缺失的细胞中,细胞内铁递送以与细胞凋亡减少相关的方式减少 Bim 诱导。在表达 BCR-ABL 的细胞中,Slc22a17 表达显着降低(参见 151410)。然而,转染 Slc22a17 表达质粒会诱导这些细胞凋亡。德维雷迪等人。

方等人(2007)发现在COS-7细胞中,NGALR3和NGAL主要定位于细胞膜,部分定位于细胞质。NGALR3 和 NGAL 几乎完全共定位。NGALR2 也获得了类似的结果。NGALR3 和 NGAL 发生免疫共沉淀,而 NGALR2 和 NGAL 则没有。

为了研究软脑膜转移瘤中的癌细胞克服抑制性代谢限制同时逃避免疫反应的机制,Chi 等人(2020) 对 5 名软脑膜转移患者的脑脊液(CSF) 进行了单细胞 RNA 测序。他们发现脑脊液内的癌细胞(而非巨噬细胞)表达铁结合蛋白 lipocalin-2(LCN2;600181)及其受体 SLC22A17。这些巨噬细胞产生炎症细胞因子,诱导癌细胞 LCN2 表达,但本身不产生 LCN2。在软脑膜转移的小鼠模型中,癌细胞生长受到 LCN2/SLC22A17 系统的支持,并受到铁螯合疗法的抑制。池等人(2020) 得出的结论是,癌细胞似乎通过与巨噬细胞竞争铁而在脑脊液中生存。

▼ Mapping

Stumpf(2020) 根据 SLC22A17 序列(GenBank BC020565) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 SLC22A17 基因对应到染色体 14q11.2。