原钙粘蛋白 18; PCDH18
- KIAA1562
HGNC 批准的基因符号:PCDH18
细胞遗传学位置:4q28.3 基因组坐标(GRCh38):4:137,518,917-137,532,529(来自 NCBI)
▼ 说明
原钙粘蛋白形成钙粘蛋白超家族中钙依赖性细胞-细胞粘附分子的亚家族。 Protocadherin-18 属于原钙粘蛋白的一个亚类,具有高度保守的 17 个氨基酸胞质基序(Wolverton 和 Lalande,2001)。
▼ 克隆与表达
Nagase 等人通过筛选大脑 cDNA 文库中可能编码大蛋白质的序列(2000) 克隆了 PCDH18,他们将其命名为 KIAA1562。 RT-PCR ELISA检测到在包括脑在内的所有组织中表达,其中在肺和卵巢中表达最高。
通过数据库检索,Wolverton 和 Lalande(2001) 鉴定并表征了 3 种原钙粘蛋白:PCDH18、PCDH10(608286) 和 PCDH19(300460),它们与 PCDH8(603580) 共享高度保守的 17 个氨基酸胞质基序(CM2)。 推导的 1,129 个氨基酸的 PCDH18 蛋白的表观分子质量为 125 kD。 所有 4 种原钙粘蛋白均含有 6 个钙粘蛋白样细胞外重复(EC) 结构域。 与 PCDH8 的脑特异性表达相反,RT-PCR 证明 PCDH10、PCDH18 和 PCDH19 不仅在脑中表达,而且在心脏、肾、肺和气管中也表达。 PCDH18也在肝脏中表达,与PCDH19和PCDH18相比,PCDH10在气管中表达减少。
Homayouni 等人使用酵母 2 杂交策略(2001) 将小鼠 Pcdh18 分离为与 Dab1 相互作用的蛋白质(603448)。
▼ 基因结构
Wolverton和Lalande(2001)通过序列分析确定PCDH18基因包含4个外显子,其中第一个外显子异常大。 霍马尤尼等人(2001)确定小鼠和人类PCDH18的基因结构高度保守。
▼ 测绘
通过计算机分析,Homayouni 等人(2001) 将 PCDH18 基因对应到染色体 4q31,将小鼠 Pcdh18 基因对应到染色体 3。