SRY框 7; SOX7
HGNC Approved Gene Symbol: SOX7
细胞遗传学位置:8p23.1 基因组坐标(GRCh38):8:10,723,767-10,730,510(来自 NCBI)
▼ 描述
SOX 基因家族的成员,包括 SOX7,含有一个由 79 个氨基酸组成的 DNA 结合域,称为 HMG(高迁移率基团)框。SOX 蛋白是在多种发育过程的调节中发挥关键作用的转录因子(Takash 等,2001)。
▼ 克隆与表达
Takash 等人通过使用基于小鼠 Sox7 的引物对胎儿胸腺 cDNA 文库进行 PCR,然后进行 EST 数据库分析(2001)获得了全长SOX7序列。推导的 388 个氨基酸的蛋白质包含一个 N 端 HMG 框,在结构域的两端包含 2 个假定的核定位信号。推导的小鼠和人类蛋白质具有 87.4% 的氨基酸同一性,在 HMG 框中具有 100% 的同一性。对人体组织的 Northern 印迹分析检测到所有检查组织中主要 5-kb 转录物的可变表达。在成人结肠和胎儿肺中也检测到约 2.5 kb 的转录本,在胎儿肺中也检测到稍大的转录本。在所有受检查的成年小鼠组织以及交配后 9.5 至 17.5 天的胚胎小鼠中也检测到了 Sox7。对 8 周大的人类胚胎进行原位杂交,在大脑、舌头、心脏、肝脏、肺和椎骨中检测到 SOX7。在胚胎小鼠中,交配后 8 天在体节和头部区域检测到 Sox7 表达,交配后 17.5 天在脑、耳蜗、舌头、软骨、肺、肝脏和椎骨中检测到 Sox7 表达。表位标记的小鼠 Sox7 定位于转染的 COS-7 细胞的细胞核。
▼ 基因功能
Takash 等人(2001) 指出小鼠 Sox7 的重组 HMG 框与序列 AACAAT 结合。在 COS-7 细胞中进行的转染实验表明,全长小鼠 Sox7 激活 SOX 报告基因,而 C 端结构域缺失的 Sox7 无法激活转录。在共转染的 293 细胞中,Sox7 减少 Wnt(参见 WNT1;164820)/β-连环蛋白(参见 CTNNB1;116806)刺激的转录。
村上等人(2004) 发现转录因子 Gata4(600576) 结合 PS4A,PS4A 是小鼠 Fgf3(164950) 启动子的关键调控元件。他们利用内胚层样分化小鼠 F9 细胞的核提取物,在 PS4A 上检测到了 Sox2(184429)、Sox7 和 Sox17(610928) 的复合物;然而,只有 Sox7 显着激活这些细胞中的 Fgf3 启动子。Sox7 与 Gata4 竞争 PS4A 占用并激活 Fgf3 启动子。原位杂交显示Sox7在胚胎第7.5天的小鼠壁层内胚层中与Fgf3和Gata4共表达。在培养中,Gata4缺陷型胚胎干细胞在分化为胚状体时表达低水平的Fgf3,并且当通过RNA干扰抑制Sox7表达时,Fgf3表达实际上被消除。村上等人。
多伊尔等人(2019) 发现小鼠 Sox7 在胚状体(EB) 分化过程中抑制心脏细胞谱系,但促进内皮细胞谱系。Sox7 通过与与内皮细胞或心肌细胞发育相关的独特基因子集结合而发挥转录激活子或抑制子的作用。Sox7 通过 Sox7 的 HMG 结构域与心脏基因转录的正调节因子 Gata4 共表达并相互作用。通过这种相互作用,Sox7 抑制了 Gata4 介导的心脏基因反式激活。相比之下,Sox7 正向调节 WNT 和 BMP 信号传导,以牺牲心肌细胞分化为代价促进内皮细胞谱系分化。
▼ 基因结构
Takash 等人(2001) 确定 SOX7 基因至少包含 2 个外显子。
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使用 FISH 进行绘图,Takash 等人(2001) 将 SOX7 基因对应到染色体 8p22,将小鼠 Sox7 基因对应到与人类染色体 8p22 具有同源同源性的 14D 染色体区域。
多伊尔等人(2019) 指出 SOX7 基因位于染色体 8p23.1 上。
▼ 动物模型
Sox7 和 Sox18(601618) 的斑马鱼同源物在成血管细胞和胚胎新生血管的内皮成分中表达。切尔梅纳蒂等人(2008) 发现任一基因的敲除对血管的影响极小;然而,同时敲除这两个基因会导致主要轴向血管之间的多重融合。使用转基因系和分子标记,他们表明内皮细胞是特定的,但未能获得正确的动静脉身份。静脉内皮细胞分化比动脉内皮细胞分化受到更严重的影响。切尔梅纳蒂等人(2008) 得出的结论是,Sox7 和 Sox18 在斑马鱼动静脉身份的建立中发挥着冗余但共同重要的作用。
Wat 等人使用免疫组织化学分析(2012)表明Sox7在小鼠膈肌发育的血管内皮细胞中表达。Sox7 杂合缺失导致一些小鼠胸骨后先天性膈疝(CDH),且呈品系依赖性。Sox7 -/- 小鼠大多在胚胎 14.5 天之前因心血管衰竭而死亡。