趋化因子、CC 基序、配体 15; CCL15

  • 小诱导细胞因子亚科 A,成员 15;SCYA15
  • 白细胞趋化素 1;LKN1
  • 新 CC 趋化因子 3;NCC3
  • HCC2
  • 巨噬细胞炎症蛋白 5;MIP5

HGNC 批准的基因符号:CCL15

细胞遗传学位置:17q12 基因组坐标(GRCh38):17:35,997,581-36,001,552(来自 NCBI)

▼ 克隆和表达

趋化因子是参与免疫调节和炎症过程的分泌蛋白。尤恩等人(1997) 分离出了人类 β-趋化因子家族成员的 cDNA,他们将其命名为 leukotactin-1(LKN1)。假定的成熟 LKN1 由 92 个氨基酸组成,计算分子量为 10,162 Da。

通过使用 MIP3(参见 601960)作为探针搜索 EST 数据库,Coulin 等人(1997) 鉴定了 CCL15,他们将其命名为 MIP5。MIP5 与 MIP3 和 MIP1A(CCL3;182283) 具有约 76% 的同一性。Northern 印迹分析显示肝脏、小肠和结肠中存在 0.6 kb 的主要转录本以及 1.1 和 1.6 kb 的次要转录本。RT-PCR 分析检测到非贴壁肺白细胞中的表达和肺泡巨噬细胞中的弱表达。

帕迪戈尔等人(1998) 孤立分离并表征了 CCL15,他们将其命名为 HCC2。与其他 CC 趋化因子不同,HCC2 蛋白由 113 个氨基酸组成,有 6 个半胱氨酸,形成 3 个二硫键。第三个二硫键将 C 端结构域锚定到分子的核心。Northern印迹分析显示转录物仅在肝脏和结肠中表达。

▼ 基因功能

Youn 等人(1997) 发现重组 LKN1 是中性粒细胞、单核细胞和淋巴细胞的有效化学引诱剂。它诱导表达 CCR1(601159) 和 CCR3(601268) 的细胞系中的钙流动,并抑制由生长因子组合刺激的人粒细胞-巨噬细胞、红细胞和多能祖细胞的集落形成。尤恩等人(1997) 得出结论,LKN1 是一种人类 C6 β 趋化因子,是 CCR1 和 CCR3 的有效激动剂,并显示出广泛的生物活性,包括白细胞趋化作用。

库林等人(1997) 发现 MIP5 仅在表达 CCR1 或 CCR3 的细胞中诱导钙流动。

Pardigol 等人的化学引诱剂分析(1998)表明HCC2诱导嗜酸性粒细胞、单核细胞和淋巴细胞的迁移,但不诱导中性粒细胞的迁移。他们确定 HCC2 主要通过 CCR1 发挥作用。

▼ 基因结构

通过基因组序列分析,Pardigol 等人(1998) 确定,与其他 CC 趋化因子基因不同,HCC2 基因包含 4 个外显子。HCC2 基因与 HCC1 基因(CCL14; 601392) 位于头尾相连的位置,它们在染色体 17q11.2 上相距 12 kb。帕迪戈尔等人(1998) 鉴定了 HCC2 启动子中 IRF2(147576)、ELK1(311040) 和 YY1(600013) 的结合位点。

▼ 测绘

成濑等人(1996) 在染色体 17q11.2 上鉴定出 CC 家族的趋化因子簇(以 cys-cys 序列基序为特征),并与以 cys-xxx-cys(CXC) 基序为特征的第二个趋化因子家族区分开来(参见 173460)。他们使用一组具有已知缺失的体细胞杂交体,将 CC 家族的 1 个基因(他们称之为 NCC3)对应到簇中。NCC3 最初被定性为表达序列标签(EST)。为该区域组装的 YAC 重叠群的基因推导顺序为:cen--NF1(613113)-​​-MCP3(158106)、MCP1(158105)、NCC1(601391)、I309(182281)--Y1741 断点--RANTES(187011)--LD78-γ、AT744.2( 603782),LD78-β(601395)--NCC3,NCC2(601392),AT744.1(182284),LD78-α(CCL3)--NCC4(601394)--RARA(180240)--tel。

通过荧光原位杂交,Youn 等人(1997) 将 LKN1 基因定位到 17q12,与其他 β 趋化因子基因(如 RANTES、MCP1 和 MCP3)非常接近。SCYA11(601156) 也位于 17 号染色体上,并且可能位于同一区域。