TWEETY FAMILY MEMBER 2; TTYH2

  • TWEETY,果蝇,同源物,2

HGNC 批准的基因符号:TTYH2

细胞遗传学位置:17q25.1 基因组坐标(GRCh38):17:74,213,570-74,262,019(来自 NCBI)

▼ 说明

TTYH2 基因编码大电导钙依赖性氯离子通道(Suzuki 和 Mizuno,2004)。

▼ 克隆与表达

Rae 等人使用差异显示 PCR(2001) 发现了一种在肾细胞癌中上调的新基因产物。 随后用该序列进行数据库搜索,组装出一个全长克隆,命名为 TTYH2,它是果蝇 tweety 的同源物。 推导的 534 个氨基酸的 TTYH2 蛋白的预测分子量为 59.3 kD,包含 5 个预测的跨膜结构域、1 个酪蛋白激酶 II 和 2 个蛋白激酶 C 磷酸化位点、4 个 N-连接糖基化位点、5 个 N-肉豆蔻酰化位点和一个可能能够整合素结合的 RGD 基序。 TTYH2 蛋白与人类 TTYH1(605784) 和果蝇 tweety 分别具有 43% 和 28% 的序列同一性。 雷伊等人(2001)还克隆了小鼠Ttyh2; 小鼠和人类蛋白质具有 81% 的序列同一性。 对人体组织的 Northern 印迹分析检测到 3.8 kb 转录物在大脑和睾丸中的表达水平最高,在卵巢和心脏中的表达水平较低,在骨骼肌、脾脏和外周血白细胞中的表达水平非常低。 RT-PCR 在 16 例肾细胞癌中的 13 例(81%) 中检测到 TTYH2 上调。

▼ 基因功能

Suzuki和Mizuno(2004)确定TTYH2在转染的中国仓鼠卵巢细胞中表达为Ca(2+)依赖性内向整流氯通道。 基于对 3 个 TTYH 通道的分析,Suzuki 和 Mizuno(2004) 得出结论,tweety 基因家族编码大电导氯离子通道。

▼ 基因结构

雷伊等人(2001) 确定 TTYH2 基因包含 14 个外显子,大小范围为 56 至 1,888 bp。

▼ 测绘

Rae 等人通过 FISH 和基因组序列分析(2001) 将 TTYH2 基因定位到染色体 17q24。 他们将小鼠同源物对应到 11 号染色体上。

Stumpf(2021) 根据 TTYH2 序列(GenBank BC107602) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 TTYH2 基因对应到染色体 17q25.1。