染色质可及性复合体,亚基 1; CHRAC1

  • 染色质可及性复合体,15-KD 亚基; CHRAC15
  • NFYC 样蛋白 1; YCL1

HGNC 批准的基因符号:CHRAC1

细胞遗传学位置:8q24.3 基因组坐标(GRCh38):8:140,511,321-140,517,153(来自 NCBI)

▼ 说明

CHRAC1 是一种组蛋白折叠蛋白,它与其他组蛋白折叠蛋白相互作用,以序列无关的方式结合 DNA。 这些组蛋白折叠蛋白二聚体在更大的酶复合物中结合,用于 DNA 转录、复制和包装。

▼ 克隆与表达

普特等人(2000) 在从 HeLa 细胞核提取物中纯化的染色质重塑复合物 CHRAC 中鉴定出 CHRAC1,他们将其命名为 CHRAC15 或 p15。 该蛋白含有 131 个氨基酸,通过 SDS-PAGE 显示表观分子量为 15 kD。 CHRAC1 的假定组蛋白折叠结构域与 CBFC 的 H2A 型组蛋白折叠结构域(NFYC; 605344) 相似。 Northern 印迹分析揭示了 2.4 kb 转录物的可变但普遍的表达,与另一种组蛋白折叠蛋白 CHRAC17(POLE3; 607267) 的表达平行。

博洛涅塞等人(2000) 克隆了小鼠 Chrac1,他们将其命名为 Ycl1。 推导的 129 个氨基酸蛋白具有高酸性,包含一个短 N 末端、一个中心 65 个氨基酸组蛋白折叠基序以及一个富含赖氨酸和酸性残基的短 C 末端。 作者指出,除了组蛋白折叠基序之外,还存在高度的系统发育保守性。 Northern 印迹分析揭示了所有测试的小鼠细胞系中 1.2 kb 转录物的表达。

▼ 基因功能

普特等人(2000) 使用与人 ISWI 的 SNF2H(SMARCA5;603375)和 SNF2L(参见 300012)亚型交叉反应的抗体,从 HeLa 细胞核提取物中亲和纯化了人染色质重塑复合物 CHRAC,但不区分它们。 POLE3、CHRAC1 和 BAZ1A(605680)(作者称之为 ACF1)在这个包含 ISWI 的复合物中共免疫沉淀,作者确定该复合物主要包含 ISWI 的 SNF2H 同工型。 Poot 等人使用重组蛋白进行下拉分析(2000) 发现 POLE3 和 CHRAC1 直接相互作用,并得出结论,POLE3 的 H2B 型组蛋白折叠结构域可能与 CHRAC1 的 H2A 型组蛋白折叠结构域相互作用。 他们证实 POLE3-CHRAC1 复合物具有高亲和力 DNA 结合活性,解离常数在亚微摩尔范围内。 POLE3 和 CHRAC1 不单独与 DNA 相互作用,并且 POLE3-CHRAC1 复合物与核小体不能很好地相互作用。

Bolognese 等人使用重组小鼠蛋白和核提取物之间的体外蛋白质-蛋白质相互作用测定(2000) 证实了 Pole3 和 Chrac1 之间的异二聚化。 在核小体重建测定中,Pole3-Chrac1 二聚体与溶液中和 DNA 上的组蛋白形成复合物。

▼ 测绘

基于与 EST(GenBank AI931369) 的序列相似性,Bolognese 等人(2000) 将 CHRAC1 基因定位到染色体 8q11-q12。