锌指 DBF 域包含蛋白 2; ZDBF2

DBF 型锌指结构域蛋白 2
KIAA1571

此条目中代表的其他实体：

包括 ZDBF2 的长异构体；包括丽兹

HGNC 批准的基因符号：ZDBF2

细胞遗传学位置：2q33.3 基因组坐标（GRCh38）：2:206,273,571-206,314,426（来自 NCBI）

▼ 克隆和表达

Nagase 等人通过对从大小分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序，（2000）获得了 ZDBF2 的部分克隆，他们将其命名为 KIAA1571。RT-PCR ELISA 检测到所有成人和胎儿组织中 KIAA1571 的表达。成人卵巢中的表达最高，其次是脑、骨骼肌和肾脏，肺中表达最低。KIAA1571 在所检查的所有特定成人大脑区域中表达，其中在小脑和丘脑底核中表达最高。

小林等人（2009）指出小鼠 Zdbf2 基因编码一个 2,493 个氨基酸的蛋白质，预测质量为 270 kD。

ZDBF2 的印记

Kobayashi 等人通过对体外受精小鼠胚胎的孤雌生殖和对照进行微阵列分析，然后进行等位基因特异性 RT-PCR（2009）发现小鼠Zdbf2是父系表达的。在成年小鼠中，Zdbf2 在除胎盘和睾丸之外的所有组织中均呈父系表达，显示出双等位基因表达。人 ZDBF2 在淋巴细胞中父系表达，但在胎盘中不表达。

ZDBF2 长亚型

杜菲等人（2014）在小鼠 Zdbf2 基因座上鉴定出一个母系遗传的瞬时种系差异甲基化区域（DMR）和 3 个父系遗传的种系/体细胞 DMR。母本 DMR 位于 Zdbf2 转录起始位点上游约 100 kb，并与相反链上的 Gpr1 基因（600239）重叠，父本 DMR 位于 Zdbf2 转录起始位点上游 8.5 至 16 kb。与母系遗传的 DMR 相关的启动子的转录物的父系表达导致“Zdbf2 长亚型”（Liz）转录物的表达。Liz 转录物包括 Zdbf2 编码外显子上游的非编码外显子，最长的 Liz 转录物包括 Zdbf2 编码外显子。在雄性种系、植入前胚胎和胚胎外组织中检测到 Liz 转录本。从与父系遗传的 DMR 相关的启动子表达的转录本仅编码 Zdbf2。这些 Zdbf2 转录物在卵母细胞和植入后胚胎以及整个生命周期的体细胞组织中短暂检测到。Northern 印迹分析在胎盘中检测到超过 12 kb 的人类 LIZ 转录本，但在大脑中未检测到。定量 RT-PCR 检测到长 LIZ 转录物在人胎盘和睾丸中的表达，但在成人体细胞组织中未检测到。在胎盘和胎儿睾丸中也检测到截短的 LIZ 转录本。检测到的大多数 LIZ 转录本包含规范 ZDBF2 的外显子 4，表明较长的 LIZ 转录本编码功能性 ZDBF2 蛋白。杜菲等人（2014）得出结论，LIZ 既可以充当调节 RNA，也可以充当 ZDBF2 编码 mRNA。这些 Zdbf2 转录物在卵母细胞和植入后胚胎以及整个生命周期的体细胞组织中短暂检测到。Northern 印迹分析在胎盘中检测到超过 12 kb 的人类 LIZ 转录本，但在大脑中未检测到。定量 RT-PCR 检测到长 LIZ 转录物在人胎盘和睾丸中的表达，但在成人体细胞组织中未检测到。在胎盘和胎儿睾丸中也检测到截短的 LIZ 转录本。检测到的大多数 LIZ 转录本包含规范 ZDBF2 的外显子 4，表明较长的 LIZ 转录本编码功能性 ZDBF2 蛋白。杜菲等人（2014）得出结论，LIZ 既可以充当调节 RNA，也可以充当 ZDBF2 编码 mRNA。这些 Zdbf2 转录物在卵母细胞和植入后胚胎以及整个生命周期的体细胞组织中短暂检测到。Northern 印迹分析在胎盘中检测到超过 12 kb 的人类 LIZ 转录本，但在大脑中未检测到。定量 RT-PCR 检测到长 LIZ 转录物在人胎盘和睾丸中的表达，但在成人体细胞组织中未检测到。在胎盘和胎儿睾丸中也检测到截短的 LIZ 转录本。检测到的大多数 LIZ 转录本包含规范 ZDBF2 的外显子 4，表明较长的 LIZ 转录本编码功能性 ZDBF2 蛋白。杜菲等人（2014）得出结论，LIZ 既可以充当调节 RNA，也可以充当 ZDBF2 编码 mRNA。但不在大脑中。定量 RT-PCR 检测到长 LIZ 转录物在人胎盘和睾丸中的表达，但在成人体细胞组织中未检测到。在胎盘和胎儿睾丸中也检测到截短的 LIZ 转录本。检测到的大多数 LIZ 转录本包含规范 ZDBF2 的外显子 4，表明较长的 LIZ 转录本编码功能性 ZDBF2 蛋白。杜菲等人（2014）得出结论，LIZ 既可以充当调节 RNA，也可以充当 ZDBF2 编码 mRNA。但不在大脑中。定量 RT-PCR 检测到长 LIZ 转录物在人胎盘和睾丸中的表达，但在成人体细胞组织中未检测到。在胎盘和胎儿睾丸中也检测到截短的 LIZ 转录本。检测到的大多数 LIZ 转录本包含规范 ZDBF2 的外显子 4，表明较长的 LIZ 转录本编码功能性 ZDBF2 蛋白。杜菲等人（2014）得出结论，LIZ 既可以充当调节 RNA，也可以充当 ZDBF2 编码 mRNA。

格林伯格等人（2017）指出，Liz 在多能小鼠囊胚中由父系等位基因表达，然后在植入时停止表达，与其相关上游 DMR 处的 DNA 甲基化平行。他们使用小鼠外胚层样细胞作为早期胚胎发育的模型，发现在 Zdbf2 表达上调之前，需要 Liz 转录来破坏下游 DMR 和 CpG 岛启动子处 H3K27me3 修饰的抑制性块。缺失分析表明，Zdbf2 启动子的 Liz 依赖性激活涉及 H3K36me3 的获得和拮抗性 DNA 甲基化的沉积，从而导致 H327me3 从启动子中被驱逐，从而允许 Zbdf2 在体细胞组织中表达。

▼ 基因结构

Kobayashi 等人（2009）确定ZDBF2基因有5个外显子。

杜菲等人（2014）报道规范的 ZDBF2 基因包含 7 个外显子。外显子 1 至 3 是非编码的，外显子 4 和 5 包含翻译起始位点，是交替剪接的。杜菲等人（2014）还鉴定了 4 个上游外显子和一个调节 LIZ 转录本表达的上游启动子。较长的 LIZ 变体包括规范的 ZDBF2 编码外显子。

▼

通过人-啮齿动物杂交小组的 PCR 作图，Nagase 等人（2000）将 ZDBF2 基因对应到 2 号染色体。

小林等人（2009）指出 ZDBF2 基因对应到染色体 2q33.3。小鼠 Zdbf2 基因定位于 1C2 号染色体。

▼ 分子遗传学

关联有待确认

有关 ZDBF2 基因变异与鼻睑脂肪瘤缺损综合征（NPLCS；167730）之间可能关联的讨论，请参阅 617059.0001。

▼ 动物模型

Greenberg 等人（2017）以预期的孟德尔比例和性别比例获得了母系和父系 Liz 基因敲除小鼠。突变小鼠表现正常并表现出正常的生育能力。然而，雄性和雌性父系 Liz 基因敲除小鼠均表现出产后生长减少。他们还显示 H3K27me3 在 Zdbf2 体细胞 DMR 上持续存在，并且缺乏 Zdbf2 表达。

▼ 等位基因变异体（1 个选定示例）：

.0001 意义不明的变异体
ZDBF2、2-BP INS、6245TT
该变异体被归类为意义不明的变异体，因为其对鼻睑脂肪瘤-缺损综合征（NPLCS；167730）的贡献尚未得到证实。

对一名患有 NPLCS 的 2 岁墨西哥女孩进行全外显子组测序，最初由 Chacon-Camacho 等人描述（2013），查孔-卡马乔等人（2016）鉴定了 ZDBF2 基因第三个编码外显子中从头 2 bp 插入（c.6245_6246insTT, NM_020923）的杂合性，导致预计会导致过早终止密码子（His2082fsTer67）的移码。在先证者未受影响的父母、300 个种族匹配的对照等位基因或 dbSNP（版本 126、129 和 131）、外显子组变异服务器（ESP6500SI-V2）、1000 基因组计划或 ExAC 数据库中均未发现该突变。先证者还携带 ZDBF2 的第二个变体，即 c.2086A-C 颠换，导致 asn696 到 his（N696H）替换，这是从她母亲遗传的。查孔-卡马乔等人。