MICRO RNA 31 宿主基因,非编码; MIR31HG
- MIR31 宿主基因
- 长非编码 RNA MIR31HG
- lncRNA MIR31HG
-LOC554202
HGNC 批准的基因符号:MIR31HG
细胞遗传学位置:9p21.3 基因组坐标(GRCh38):9:21,454,267-21,559,797(来自 NCBI)
▼ 说明
长非编码 RNA(lncRNA),例如 MIR31HG,长度超过 200 个核苷酸,由 RNA 聚合酶 II(参见 180660)转录,并且被聚腺苷酸化。 MIR31HG 似乎在细胞周期调节中发挥作用(Shi et al., 2014)。 MIR31HG 的内含子 1 包含 microRNA-31(MIR31; 612155)(Augoff et al., 2012)。
▼ 克隆与表达
奥戈夫等人(2012) 确定 MIR31HG 转录本(他们称之为 LOC554202)长 2,246 bp,不具有蛋白质编码潜力。
蒙特斯等人(2015)发现MIR31HG在正常人成纤维细胞的细胞质和细胞核中表达。
▼ 基因功能
Augoff 等人通过定量实时 RT-PCR(2012)发现MIR31及其宿主基因MIR31HG的表达在basal亚型三阴性乳腺癌(TNBC)细胞系中下调,而在luminal亚型乳腺癌细胞系中表达上调。 单独用去甲基化剂或与去乙酰化剂联合处理 TNBC 细胞系会导致 MIR31 和 MIR31HG 的表达显着增加。 甲基化特异性 PCR 分析和亚硫酸氢盐转化的 DNA 测序证实,与 MIR31HG 相关的 CpG 岛在 TNBC 细胞系中重度甲基化,而在管腔亚型细胞系中低甲基化。
施等人(2014) 发现与正常组织相比,MIR31HG 在乳腺癌组织中表达上调,并且较高的 MIR31HG 表达与肿瘤大小和晚期病理分期相关。 通过小干扰 RNA(siRNA) 敲低 MIR31HG 会减少乳腺癌细胞系的增殖、迁移和侵袭,导致 G0/G1 期细胞积累,S 期细胞损失。 MIR31HG 的敲低还增加了 MDA-MB-435S 乳腺癌细胞的凋亡,并阻碍了裸鼠异种移植物中 MDA-MB-435S 肿瘤的生长。 施等人(2014) 得出结论,MIR31HG 在调节 G1/S 检查点和细胞凋亡中发挥作用。
细胞衰老可以由多种刺激触发,包括癌基因,癌基因诱导的衰老被认为是对抗肿瘤发生的障碍。 蒙特斯等人(2015) 观察到致癌突变小鼠 Braf(164757) 的激活导致人二倍体成纤维细胞中 MIR31HG 上调,同时诱导衰老表型。 通过 siRNA 敲除成纤维细胞中的 MIR31HG 也会诱导衰老表型。 蒙特斯等人(2015) 发现 MIR31HG 的敲低和致癌 Braf 的激活都会减少核 MIR31HG 的积累。 在不存在致癌 Braf 的情况下,核 MIR31HG 与 Polycomb 族(PcG) 蛋白(例如 SUZ12;606245)蛋白相互作用,这些相互作用导致 CDKN2A(600160) 的 INK4A 同工型表达受到抑制,该亚型距离 MIR31HG 约 400 kb。 INK4A 表达的激活和细胞衰老的发生与核 MIR31HG 的减少同时发生,表明 MIR31HG 是 PcG 介导的 INK4A 抑制所必需的。 由核 MIR31HG 减少引起的细胞衰老不需要 CDKN2A 基因座表达的任何其他肿瘤抑制因子。 通过染色质环化,MIR31HG 还与位于 MIR31HG 和 INK4A 之间的增强子元件相互作用,并且该增强子区域在衰老过程中也被激活。 蒙特斯等人(2015) 发现 MIR31HG 的核输出是通过 mRNA 输出蛋白 ALY(THOC4; 604171) 发生的。
▼ 基因结构
奥戈夫等人(2012) 确定 MIR31HG 基因有 4 个外显子,跨度超过 106 kb。 外显子 1 包含 CpG 岛,内含子 1 包含 MIR31。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Shi 等人(2014) 将 MIR31HG 基因定位到染色体 9p21.3。