ATP 酶,VI 类,11C 型; ATP11C
- ATPase IQ; ATPIQ
- ATPase IG; ATPIG
HGNC 批准的基因符号:ATP11C
细胞遗传学位置:Xq27.1 基因组坐标(GRCh38):X:139,726,345-139,933,082(来自 NCBI)
▼ 描述
ATP11C 基因编码一种“翻转酶”,通过 ATP 依赖性氨基磷脂(如 PS)从外叶到内叶的主动转运,在磷脂酰丝氨酸(PS)定位到红细胞膜内叶中发挥作用(Arashiki 等人的总结,2016)。
▼ 克隆与表达
Nesbit等人通过寻找X连锁甲状旁腺功能减退症基因座(HYPX;307700)附近的基因,然后进行cDNA文库筛选、EST数据库分析和5-prime RACE(2004)克隆了ATP11C。推导的 1,132 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 130 kD。通过搜索 EST 数据库,Nesbit 等人(2004) 鉴定出小鼠和人类 ATP11C cDNA 具有交替的第一外显子,编码推导的 1,128 个氨基酸蛋白质,表观分子质量为 129 kD。小鼠和人类蛋白质具有 94.8% 的氨基酸同一性。Nesbit 等人使用 RT-PCR(2004) 还鉴定了小鼠和人类 ATP11C 变体,其中外显子 29 的选择性剪接导致蛋白质具有不同的 C 末端。对几种人体组织的 Northern 印迹分析检测到普遍表达的 7.4-kb 转录物和较小的 7.
▼ 基因结构
Nesbit 等人(2004) 确定 ATP11C 基因包含 31 个外显子,包括交替的第一个外显子 1a 和 1b,跨度超过 211 kb。
▼
Nesbit 等人通过基因组序列分析进行绘图(2004) 将 ATP11C 基因定位到染色体 Xq27。
▼ 基因功能
Sekawa 等人在人类细胞中使用单倍体遗传筛选(2014) 发现 ATP11C 和 CDC50A(611028) 是氨基磷脂从质膜外层转位至内层质膜小叶所必需的;也就是说,它们表现出翻转酶活性。ATP11C 含有 半胱天冬酶 识别位点,这些位点的突变产生了 半胱天冬酶 抗性 ATP11C,但不影响其翻转酶活性。表达抗 半胱天冬酶 ATP11C 的细胞在凋亡过程中不会暴露磷脂酰丝氨酸,也不会被巨噬细胞吞噬,这表明凋亡磷脂酰丝氨酸暴露需要灭活翻转酶活性。CDC50A缺陷的细胞在其表面展示磷脂酰丝氨酸并被巨噬细胞吞噬,表明磷脂酰丝氨酸足以作为“吃我”信号。
高津等人(2014) 建立了一种使用哺乳动物细胞检测人质膜定位磷脂翻转酶的方法。他们发现,在小鼠 pro-B 细胞中,人 ATP11C 将 PS 和磷脂酰乙醇胺从质膜的外质转移到细胞质小叶。HeLa 细胞中的分析证实 ATP11C 是一种氨基磷脂特异性翻转酶,以 ATP 酶循环依赖性方式发挥作用。
▼ 分子遗传学
Arashiki 等人在一名患有 X 连锁先天性溶血性贫血(301015) 的日本男性中(2016) 在 ATP11C 基因(T418N; 300516.0001) 中发现了一个半合子错义突变。通过全外显子组测序鉴定出的突变在未受影响的母亲中呈杂合状态。流式细胞术分析显示,患者细胞的磷脂酰胆碱翻转酶活性显着降低(3%),与对照相比降低约 10 倍。在大约一半的母亲红细胞中观察到类似的结果,另一半与野生型相似;这些发现与随机 X 失活一致。与对照组相比,患者总红细胞显示暴露的 PS 水平略有增加(8.86% vs 6.32%),少数致密衰老细胞的增幅更高(患者为 15.86%,对照组为 9.17%)。然而,Arashiki 等人(2016) 指出,患者和对照组的致密衰老细胞数量相似,约占细胞总数的 0.1%,并且在缺乏扰乱酶活性的情况下,大多数患者细胞的内叶上仍然具有 PS。这些发现表明扰乱酶活性(参见例如PLSCR1, 604170)主要负责PS 外化。
▼ 动物模型
在 N-乙基-N-亚硝基脲(ENU) 筛选中,Yabas 等人(2011) 鉴定出 2 个孤立的小鼠品系具有相同的 X 连锁 B 细胞缺陷综合征。突变小鼠在外观、大小、体重、行为和生育力方面与野生型小鼠相似,并且 T 细胞和自然杀伤(NK) 细胞的频率正常。突变小鼠的其他表型异常包括贫血、高胆红素血症和肝细胞癌。连锁和序列分析揭示了两种菌株中 Atp11c 基因的突变:一种突变菌株中内含子 27 位置 +1 处的外显子 27 剪接供体序列中存在 G 至 A 转换,而另一种菌株中内含子 26 位置 +2 处的外显子 26 剪接供体序列中存在 T 至 G 转换。两种突变都使 Atp11c 蛋白失活,导致原 B 细胞中 PS 易位率较低,前 B 细胞和 B 细胞数量也较低。边缘区 B 细胞是突变小鼠中唯一未受影响的 B 细胞亚群。表达预先重排的免疫球蛋白转基因或 Bcl2(151430) 来预防细胞凋亡并不能纠正突变小鼠的 B 细胞发育缺陷。此外,突变小鼠中的 Atp11c 缺陷消除了对 Il7(146660) 转基因的反应的前 B 细胞群体扩张。作者得出结论,ATP11C 对于 B 淋巴细胞的 PS 内化和分化至关重要。突变小鼠中的 Atp11c 缺陷消除了对 Il7(146660) 转基因的反应的前 B 细胞群体扩张。作者得出结论,ATP11C 对于 B 淋巴细胞的 PS 内化和分化至关重要。突变小鼠中的 Atp11c 缺陷消除了对 Il7(146660) 转基因的反应的前 B 细胞群体扩张。作者得出结论,ATP11C 对于 B 淋巴细胞的 PS 内化和分化至关重要。
亚巴斯等人(2014) 分析了 Atp11c 突变小鼠血液中的血液学参数,他们之前报告称这些小鼠患有贫血(Yabas 等人,2011)。与野生型相比,突变型小鼠红细胞数量减少,红细胞较大,平均红细胞体积较高,但溶血情况正常。突变小鼠的骨髓和脾脏中红细胞发育正常,但红细胞的寿命比野生型小鼠短。形态学研究表明,大多数突变红细胞形成了形状异常的口细胞。然而,Atp11c 缺乏对红细胞 Na+ 和 K+ 稳态没有显着影响。突变型小鼠和野生型小鼠的血清铁和转铁蛋白(TF;190000)水平相当。突变红细胞中翻转酶活性降低,导致外周循环中成熟红细胞表面 PS 积累增加。作者得出结论,ATP11C 对于红细胞形态和存活至关重要。
▼ 等位基因变异(1 个选定示例):.
0001 溶血性贫血,先天性,X 连锁
ATP11C,THR418ASN(1 名患者)
Arashiki 等人在一名患有 X 连锁先天性溶血性贫血(301015) 的日本男性中(2016) 在 ATP11C 基因的外显子 13 中鉴定出半合子 c.1253C-A 颠换(c.1253C-A,NM_001010986),导致保守残基处的 thr418 到 asn(T418N) 取代。通过全外显子组测序鉴定出的突变在未受影响的母亲中呈杂合状态。在 dbSNP 数据库(版本 132 和 135)或内部数据库中未找到它。流式细胞术分析显示,患者细胞的磷脂酰胆碱(PS) 翻转酶活性显着降低(3%),与对照相比降低约 10 倍。在大约一半的母亲红细胞中观察到类似的结果,另一半与野生型相似;这些发现与随机 X 失活一致。