PAXX 非同源末端连接因子; PAXX

• XRCC4 和 XLF 的 PARALOG

  • 9号染色体开放解读码组142； C9ORF142
  • XRCC4 样小蛋白； XLS

HGNC 批准的基因符号：PAXX

细胞遗传学位置：9q34.3 基因组坐标（GRCh38）：9:136,992,421-136,993,975（来自 NCBI）

▼ 说明

DNA 双链断裂（DSB） 出现在暴露于 DNA 损伤剂的细胞中，并且也在免疫受体基因位点的 V（D）J 和类别转换重组过程中作为中间体产生（参见 147020）。 非同源末端连接（NHEJ） 是一条关键的 DNA 修复途径，涉及 DSB 的识别和修复蛋白的组装。 PAXX 通过稳定 NHEJ 蛋白组装来促进 DSB 修复（Ochi et al., 2015）。

▼ 克隆与表达

通过使用 DSB 修复蛋白 XRCC4（194363） 作为查询搜索数据库，Ochi 等人（2015） 确定了 PAXX。 推导的 204 个氨基酸蛋白具有与 XRCC4 相似的结构域，包括 N 端头结构域、中央卷曲螺旋区域和低复杂度的 C 端结构域。 头域包含 PISA（存在于 SAS6, 609321）基序，该基序在整个 XRCC4 超家族中都是保守的。 荧光标记的 PAXX 主要定位于转染的 U2OS 细胞的细胞核。 数据库分析揭示了 PAXX 的直系同源物存在于脊椎动物、无脊椎动物和单细胞生物中，但在昆虫或真菌中没有。

克拉克斯顿等人（2015） 报道称 C9ORF142（他们称之为 XLS）具有 C 端二分核定位序列。

▼ 生化特征

大智等人（2015）解析了PAXX的晶体结构，发现它与XRCC4的晶体结构相似。 电喷雾质谱表明PAXX在溶液中形成二聚体。

▼ 基因功能

Ochi 等人使用蛋白质下拉分析、免疫共沉淀分析和突变分析（2015） 发现人 PAXX 的 C 末端直接与 DSB 修复蛋白 Ku70（XRCC6; 152690） 和 Ku80（XRCC5; 194364） 相互作用。 荧光标记的 PAXX 被招募到 U2OS 细胞中的 DNA 损伤位点。 U2OS 细胞中的 RNA 干扰和 PAXX-null RPE-1 细胞的生成表明，PAXX 与 XRCC4 和 XLF（NHEJ1; 611290） 一起发挥作用，介导 DSB 修复和细胞存活，以响应 DSB 诱导剂。 大智等人（2015） 还发现 PAXX 在体外促进 Ku 依赖性 DNA 连接，并在人类细胞受损染色质上组装核心 NHEJ 因子。 他们得出的结论是，PAXX 是 NHEJ 机器的一个新颖组件。

Craxton 等人使用亲和纯化和质谱分析（2015） 发现 C9ORF142（他们称之为 XLS）与 PRKDC（600899） 和其他核心 NHEJ 因子相互作用。 小干扰 RNA 敲低 XLS 会损害 DSB 修复，这与 NHEJ 的缺陷一致。 克拉克斯顿等人（2015） 得出结论，XLS 是 NHEJ DNA 修复途径的一个组成部分。

Xing 等人通过免疫沉淀转染 HEK293 细胞中 NHEJ 通路的成分，然后进行质谱分析（2015） 在 NHEJ 核心蛋白 Ku70、Ku80、LIG4（601837） 和 XLF 以及非核心 NHEJ 蛋白 APLF（611035） 和 POLL（606343） 的免疫沉淀物中鉴定出 PAXX。 缺乏 PAXX 的鸡和人类细胞对 DSB 致病剂敏感。 突变分析表明 PAXX 的 N 和 C 末端都是其功能所必需的。 其他实验表明，PAXX 作用于 XRCC4-LIG4 复合物的上游，并且它与 XLF 一起在共同和平行的途径中发挥作用，响应电离辐射诱导的 DSB。 PAXX 与 XLF 一起促进复杂而非简单 DNA 末端的连接。 邢等人（2015） 得出的结论是，PAXX 在修复不同 DSB 类型的 NHEJ 复合体的组织中发挥着关键作用。

库马尔等人（2016） 发现，在 G1 期停滞的小鼠 pro-B 细胞系中，Paxx 和 Xlf 的缺陷（而不是单独的 Paxx）会消除 V（D）J 重组过程中的 DSB 连接，并使细胞对电离辐射敏感。

▼ 测绘

Hartz（2015） 根据 PAXX 序列（GenBank BC002613） 与基因组序列（GRCh38） 的比对，将 PAXX 基因对应到染色体 9q34.3。