Na+/K+ 转运 ATP 酶相互作用 2; NKAIN2
- Na+/K+ 转运 ATP 酶相互作用蛋白 2;NKAIP2
- 钠/钾转运 ATP 酶相互作用蛋白 2
- T 细胞淋巴瘤断点相关靶标 1;TCBA1
此条目中代表的其他实体:
- 包含 TCBA1/SUSP1 融合基因
HGNC 批准的基因符号:NKAIN2
细胞遗传学位置:6q22.31 基因组坐标(GRCh38):6:123,803,841-124,825,651(来自 NCBI)
▼ 描述
NKAIN2 是哺乳动物蛋白家族的成员(参见 NKAIN1;612871),与果蝇 Nkain 相似,并与 Na,K-ATP 酶的 β 亚基(ATP1B1;182330)相互作用(Gorokhova 等,2007)。
▼ 克隆和表达
通过在2个T细胞淋巴瘤/白血病细胞系中寻找与染色体6q21断点相关的基因,然后进行数据库分析和胎儿大脑mRNA的RACE,Takawa等人(2002)克隆了TCBA1。推导的 188 个氨基酸的蛋白质含有 4 个跨膜螺旋。Northern blot 分析仅检测到胎儿大脑中 TCBA1 的表达。RT-PCR 显示 TCBA1 在成人大脑和胸腺中也表达,但在检查的任何其他正常组织中不表达。对 53 个淋巴瘤/白血病细胞系进行 RT-PCR,仅在弥漫性大 B 细胞淋巴瘤细胞系和 3 个 AML(601626) 细胞系中检测到正常的 TCBA1 转录物。异常 TCBA1 转录物存在于具有染色体 6q21 断点的 2 个细胞系中。
Bocciardi 等人通过 RT-PCR 和直接测序(2005) 由于基因 5-prime 和 3-prime 末端的选择性剪接以及外显子 2 的跳跃,鉴定了几个 TCBA1 变体。
Gorokhova 等人利用 EST 数据库分析筛选哺乳动物中枢神经系统中表达的新型蛋白质,然后对小鼠大脑 RNA 进行 RT-PCR(2007) 克隆了小鼠 Nkain2 并鉴定了人类 NKAIN2。NKAIN2 包含一个预测的可裂解信号肽、3 个假定的跨膜结构域,并且与任何已知的功能蛋白没有相似性。免疫组织化学研究将 Nkain2 在 HEK293T 细胞中表达时定位于细胞膜。小鼠 Nkain2 与果蝇 Nkain 的前 200 个氨基酸有 60% 的相似性,果蝇 Nkain 的 C 端尾部又延伸了 458 个氨基酸,而脊椎动物 Nkain2 则没有。RT-PCR 分析仅检测到小鼠大脑和睾丸中的表达。免疫组织化学研究表明 Nkain2 表达具有神经元特异性。
▼ 基因功能
通过使用 Nkain2 的 C 末端作为诱饵的酵母 2-杂交分析,Gorokhova 等人(2007) 证明了 Nkain2 与 ATP1B1 的相互作用。
▼ 基因结构
Takawa 等人(2002) 确定 TCBA1 基因包含 4 个外显子,跨度约为 900 kb。外显子 1 与外显子 2 相距 450 kb。
通过数据库分析和直接测序,Bocciardi 等人(2005) 确定 TCBA1 基因的“长亚型”包含 8 个编码外显子,跨度约为 1 Mb。
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通过基因组序列分析进行绘图,Takawa 等人(2002) 将 TCBA1 基因定位到染色体 6q21。岳等人(2006) 通过分析破坏 TCBA1 基因的从头易位 t(1;6)(q32.2;q22.3),将 TCBA1 基因定位到 6q22.3。
通过数据库分析,Gorokhova 等人(2007) 将小鼠 Nkain2 基因定位到染色体 10A4。
▼ 细胞遗传学
HT-1 和 ANT-1 是具有复杂细胞遗传学畸变的 T 细胞淋巴瘤/白血病细胞系。在 HT-1 细胞系中,Takawa 等人(2002)发现del(6)(q13q21)导致SUSP1基因(SENP6;605003)的核苷酸551与TCBA1基因的外显子4融合。SUSP1 的核苷酸 489 至 509 在嵌合转录物中被删除。嵌合转录本中 TCBA1 的外显子 4 发生移码,导致嵌合蛋白相对于野生型 SUSP1 具有独特的截短 C 末端。在 ANT-1 细胞系中,t(6;8;8)(q21;q11;q24) 导致 TCBA1 转录物发生改变,其中包含源自衍生 8 号染色体的神秘外显子。然而,RT-PCR 未检测到嵌合转录物。
博恰尔迪等人(2005) 在一名患有严重神经表型的患者中发现了从头平衡易位 t(2;6)(q24.3;q22.31),包括伴有痉挛性四肢轻瘫的癫痫性脑病和与脑室周围白质受累的脑萎缩相关的严重精神运动迟缓。孩子还患有小头畸形、灰乳头(视神经的眼盘头)并伴有脉络膜视网膜萎缩、头发色素沉着不足、其他轻微的面部和手部畸形以及性腺功能减退症,伴有小阴茎和隐睾。通过易位的分子表征,Bocciardi 等人(2005) 发现 TCBA1 基因内含子 4 中的断点截短了长异构体,但不影响短异构体。
在一名发育迟缓和反复感染的儿童中,Yue 等人(2006) 发现 TCBA1 基因在内含子 4 中被从头平衡易位 t(1;6)(q32.2;q22.3) 破坏。他的出生体重位于第 50 个百分位,枕额头围(OFC) 位于第 75 个百分位和第 91 个百分位之间。他患有房室间隔缺损,在出生后的头几个月会自动闭合,并且肺动脉瓣有轻微发育不良。大头畸形被认为是家族性的,父亲的 OFC 为 5 厘米,约为第 99.6 个百分位,母亲的 OFC 为第 91 个百分位。他对未降睾丸进行了双侧睾丸固定术,并对明显的胃食管反流进行了胃底折叠术。其他问题包括反复胸部感染、哮喘和遗尿。他有普遍的学习困难,尤其是在表达性言语方面。他的皮肤非常白皙,头发非常金色,几乎是白色的,尽管他的父母都是深色的头发。患者出现胞质型抗中性粒细胞胞浆抗体(C-ANCA),这通常与血管炎有关。
▼ 动物模型
Gorokhova 等人(2007) 表明,在 Nkain 第一个外显子中插入 P 元件的果蝇突变体表现出温度敏感表型,其特征是当放置在 38 摄氏度时,会出现协调性下降、癫痫样运动和麻痹。