含有卷曲螺旋结构域的蛋白质 68; CCDC68
- SE57-1
HGNC 批准的基因符号:CCDC68
细胞遗传学位置:18q21.2 基因组坐标(GRCh38):18:54,901,508-54,959,538(来自 NCBI)
▼ 说明
CCDC68 是胰腺导管腺癌(PDAC;参见 260350) 和可能的其他癌症中的假定肿瘤抑制基因(Radulovich et al., 2015)。
▼ 克隆与表达
Eichmuller 等人使用 SEREX(重组肿瘤 cDNA 表达文库的血清学分析)筛选睾丸 cDNA 文库中的皮肤 T 细胞淋巴瘤(CTCL) 抗原(2001) 克隆了 CCDC68,他们将其称为 SE57-1。 对28个正常人体组织进行RT-PCR,检测到CCDC68在骨髓、结肠、小肠、脾脏、睾丸和气管中的表达。 CCDC68 在所检查的 6% 的 CTCL 组织中表达,并且在所检查的任何 CTCL、白血病或黑色素瘤细胞系中均未检测到。
▼ 基因功能
Radulovich 等人利用综合基因组学和功能筛选(2015) 将 CCDC68 鉴定为 PDAC 中假定的肿瘤抑制因子。 CCDC68 在约一半的原发性 PDAC 患者肿瘤和 PDAC 细胞系以及 30% 的原发性 PDAC 患者来源的异种移植物中显示等位基因丢失。 拉杜洛维奇等人(2015) 在 32 个原发性 PDAC 患者来源的异种移植物中的 10 个(31%) 中,在 CCDC68 的外显子 5 剪接供体位点上游鉴定出 c.620G-A SNP(rs1344011) 1 个核苷酸。 SNP 导致外显子跳跃并产生不稳定的蛋白质,其中残基 69 至 114 被框内删除。在 CCDC68 缺陷的 PDAC 细胞系中,全长 CCDC68 的过表达(而非截短的变体)会降低免疫缺陷小鼠的增殖和致瘤性。 相反,表达 CCDC68 的细胞系中内源性 CCDC68 的下调会增加肿瘤生长速度。
▼ 测绘
拉杜洛维奇等人(2015) 指出,CCDC68 基因对应到染色体 18q,该染色体在 PDAC 中经常丢失。 Gross(2016) 根据 CCDC68 序列(GenBank AF273051) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 CCDC68 基因对应到染色体 18q21.2。