二氢嘧啶酶; DPYS
- 5,6-二氢嘧啶酰胺水解酶;二羟丙酸
HGNC 批准的基因符号:DPYS
细胞遗传学位置:8q22.3 基因组坐标(GRCh38):8:104,379,428-104,467,073(来自 NCBI)
▼ 描述
二氢嘧啶酶(DPYS),也称为 5,6-二氢嘧啶酰胺水解酶,或 DHP(EC 3.5.2.2),是尿嘧啶和胸腺嘧啶三步降解途径中继二氢吡啶脱氢酶(DPYD; 612779) 作用后的第二种酶(Hamajima 等,1996)。
▼ 克隆与表达
滨岛等人(1996)从人肝脏 cDNA 文库中分离出编码二氢嘧啶酶的 cDNA 克隆,并从人胎脑 cDNA 文库中分离出 3 个 DPYS 同源物。他们将同源物命名为二氢嘧啶酶相关蛋白(DRP)-1(CRMP1; 602462)、DRP2(DPYSL2; 602463) 和 DRP3(DPYSL3; 601168)。519个氨基酸的DPYS蛋白序列与大鼠DPYS蛋白序列90%相同;DRP1-3 与人 DPYS 具有 57% 至 59% 的氨基酸同一性,彼此之间具有 74% 至 77% 的氨基酸同一性。对成人组织的 Northern 印迹分析表明,DPYS 和 DRP1-3 存在差异表达,其中 DPYS 在肝脏和肾脏中以高水平表达,主要为 2.5 kb 转录本,次要为 3.8 kb 转录本。作者讨论了 DPYS 和 DRP1-3 基因与其他生物体中相似基因序列的关系。
▼ 基因结构
人类DPYS基因跨度超过80 kb,包含10个外显子(Hamajima 等人,1998)。
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通过荧光原位杂交作图,Hamajima 等人(1998) 将 DPYS 基因分配给染色体 8q22。
▼ 分子遗传学
Hamajima 等人在 1 名有症状者和 5 名无症状者中因 DPYS 缺乏而出现二氢嘧啶尿症(DPYSD; 222748)(1998)在DPYS基因中鉴定出1个移码突变和5个错义突变(参见例如613326.0001-613326.0003)。两名未受影响的日本成年同胞经筛查程序鉴定为错义突变纯合子(Q334R;613326.0001)。两名无关的无症状日本婴儿具有相同突变的杂合子,但这种突变在日本人中并不常见。唯一有症状的患者是一名具有畸形特征、发育迟缓和癫痫发作的黎巴嫩女孩(van Gennip 等,1997),她是错义突变纯合子(Y360R;613326.0003)。所有患者都有尿嘧啶、二氢尿嘧啶、胸腺嘧啶、
中岛等人(2017) 在 4 名不相关的 DPYS 缺陷患者(1 名中国人和 3 名日本人)中鉴定出 DPYS 基因中的复合杂合突变,包括 4 个新的错义变异(参见,例如 M250I, 613326.0005 和 R490H, 613326.0006)和 1 个新的缺失。临床表现包括无症状到伴有白质减少和脑萎缩的婴儿痉挛症。中岛等人(2017) 指出,已报告了 31 名经基因证实患有 DPYS 缺乏症的患者。
Tsuchiya 等人通过对一名日本男孩进行桑格测序,偶然发现该男孩的二氢尿嘧啶和二氢胸腺嘧啶水平显着升高(2019) 鉴定了 DPYS 基因中的复合杂合突变:先前鉴定的 R490H 突变和新的错义突变(V59F; 613326.0007)。父母拒绝进行基因研究。
▼ 等位基因变体(7 个选定示例):.
0001 二氢嘧啶酶缺乏症
DPYS,GLN334ARG
Hamajima 等人在 2 名患有二氢嘧啶酶缺乏症的无症状日本成年同胞中(DPYSD; 222748)(1998) 发现 DPYS 基因外显子 6 中 1001A-G 转换的纯合性,导致 gln334 到 arg(Q334R) 的取代。另外两名无血缘关系的日本婴儿也具有相同突变的杂合子。然而,这种突变在日本人群中似乎并不常见。在一名杂合受试者中也检测到了 gly435 至 arg(G435R;613326.0002)错义突变,尽管无法明确确定这 2 个突变是否实际上位于该受试者的不同等位基因上。看来所有这些人都没有症状。COS-7 细胞的体外功能表达研究表明,两种突变蛋白的酶活性均降低,但只有 G435R 的蛋白水平降低。
.0002 二氢嘧啶酶缺乏症
DPYS,GLY435ARG
用于讨论 Hamajima 等人在二氢嘧啶酶缺乏症(DPYSD; 222748) 患者中以复合杂合状态发现的 DPYS 基因中的 gly435-to-arg(G435R) 突变(1998),参见 613326.0001。
.0003 二氢嘧啶酶缺乏症
DPYS,TRP360ARG
在一名近亲父母出生的黎巴嫩女孩中,患有二氢嘧啶酶缺乏症(DPYSD; 222748),Hamajima 等人(1998) 在 DPYS 基因的外显子 6 中鉴定出纯合 1078T-C 转变,导致氨基末端保守区域中的 trp360 至 arg(W360R) 取代。每个未受影响的亲本都是该突变的杂合子。van Gennip 等人之前曾报道过该患者(1997),并有癫痫发作、畸形特征和严重的发育迟缓。COS-7 细胞的体外功能表达研究表明蛋白质水平降低,酶活性降低。滨岛等人(1998) 表明突变可能会阻止蛋白质的四聚化。
.0004 二氢嘧啶酶缺乏症
DPYS, ARG412MET
在 2 名患有二氢嘧啶酶缺乏症的摩洛哥兄弟中(DPYSD; 222748),van Kuilenburg 等人(2007) 鉴定了 DPYS 基因中 2 个突变的复合杂合性:外显子 7 中的 1235G-T 颠换导致 arg412-to-met(R412M) 取代,以及 W360R(613326.0003)。大肠杆菌的体外功能表达研究表明,尽管突变蛋白得到了表达,但这两种突变均没有酶活性。结构分析表明,W360R 突变会损害四聚体的组装,而 R412M 突变会影响氢键,导致不稳定。其中一名兄弟患有言语迟缓和轻度脑白质异常,而另一名兄弟则没有神经系统异常。
.0005 二氢嘧啶酶缺乏症
DPYS、MET250ILE(rs751371011)
Nakajima 等人在新生儿筛查中发现一名日本女孩患有二氢嘧啶酶缺乏症(DPYSD; 222748)(2017) 鉴定了 DPYS 基因中的复合杂合突变:外显子 4 中的 c.750G-A 转换,导致 met250 到 ile(M250I) 替换,以及外显子 9 中的 c.1469G-A 转换,导致 arg490 到 hiss(R490H; 613326.0006) 替换。携带任一变体的重组表达的 DPYS 突变体的功能分析显示残余 DPYS 活性分别为 2.0% 和 0.3%。DPYS 的分子模型表明,点突变可能会导致形成活性位点的环重排,主要影响酶的底物结合和稳定性。患者年龄 5.9 ,无症状。
.0006 二氢嘧啶酶缺乏症
DPYS, ARG490HIS(rs189448963)
用于讨论 DPYS 基因中的 c.1469G-A 转变,导致 arg490 到 his(R490H) 取代,这是 Nakaji 在一名二氢嘧啶酶缺乏症(DPYS; 222748) 的日本女孩中发现的马等人(2017),参见 613326.0005。
.0007 二氢嘧啶酶缺乏症
DPYS,VAL59PHE
通过桑格测序对一名患有二氢嘧啶酶缺乏症的日本男孩进行测序(DPYS;222748),Tsuchiya 等人(2019) 鉴定了 DPYS 基因中的复合杂合突变:R490H(613326.0006) 和外显子 1 中的 c.175G-T 颠换,导致 val59 替换为 phe。男孩的二氢尿嘧啶和二氢胸腺嘧啶水平显着升高。父母拒绝进行基因检测。