锌指蛋白 638; ZNF638

• 核蛋白，220-KD； NP220

HGNC 批准的基因符号：ZNF638

细胞遗传学定位：2p13.2 基因组坐标（GRCh38）：2:71,331,781-71,435,060（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

Inagaki 等人通过筛选 HeLa 细胞 cDNA 文库中与人类线粒体启动子相互作用的蛋白质，然后额外筛选 HeLa、Namalwa Burkitt 淋巴瘤和心脏 cDNA 文库以及 5-prime RACE（1996） 克隆了 ZNF638，他们将其称为 NP220。 推导的 1,978 个氨基酸的蛋白质的计算分子量为 220.6 kD。 它具有 N 端大鼠 matrin-3（MATR3; 164015） 同源（MH） 结构域，随后是富含精氨酸和丝氨酸（RS） 结构域、第二个 MH 结构域、DNA 结合区、9 个重复的高酸性序列和 C 端 MH 结构域。 第二个 MH 结构域包含 RNA 识别基序。 间期 HeLa 细胞和其他人类细胞系的免疫荧光显微镜显示 NP220 以核点状模式积累。 在有丝分裂期间，NP220 扩散到细胞质，并被浓缩染色质排除。 SDS-PAGE 检测到 NP220 的表观分子量为 250 kD。

梅鲁武等人（2011） 克隆小鼠 Znf638，其编码推导的 1,927 个氨基酸的蛋白质，具有 N 端和 C 端锌指结构域。 小鼠和人类 ZNF638 在其 N 和 C 末端含有假定的核定位信号。

▼ 基因功能

通过突变分析，Inagaki 等人（1996） 鉴定了人 NP220 的 C 端一半区域（残基 1353 至 1477），该区域对于体外 DNA 结合至关重要。 NP220 优先与双链 DNA 任一链中的胞苷簇结合。 共有序列是CCCCC（G/C）。

Ng 等人通过酵母 2-杂交分析鼻咽癌细胞 cDNA 文库（2002） 发现 FHL2（602633） 结合 NP220。 突变分析显示 NP220 的 C 端部分与 FHL2 的 LIM 结构域 2 至 4 相互作用。 在不存在 NP220 的情况下，FHL2 定位于转染的 HepG2 细胞的细胞质和细胞核，但当与 NP220 共表达时，FHL2 定位于细胞核。 在存在或不存在 FHL2 的情况下，NP220 定位于细胞核。

梅鲁武等人（2011） 发现 Znf638 的表达在小鼠 3T3-L1 细胞的脂肪细胞分化早期被诱导，并在分化后期迅速下降。 报告基因测定和免疫沉淀分析表明，Znf638 通过与 Ppar-γ 启动子中 CEBP 结合位点的 Cebp-β（CEBPB；189965） 相互作用来调节 Ppar-γ（PPARG；601487） 表达。 Meruvu 等人使用突变分析（2011） 证实 Znf638 的 N 端和 C 端核定位信号均具有功能。 Znf638 在核斑点处的特异性积累需要 RS 域。

朱等人（2018） 对沉默整合酶缺陷型 MLV-GFP 报告病毒所需的基因进行了全基因组 CRISPR-Cas9 筛选，以探索抑制人类细胞中未整合病毒 DNA 的机制。 该筛选鉴定出 DNA 结合蛋白 NP220； 组成 HUSH 复合体的 3 种蛋白（MPP8，611626；TASOR，616493；和 PPHLN1，608150）可沉默异染色质和反转录转座子中的原病毒； 组蛋白甲基转移酶 SETDB1（604396）； 以及沉默所需的其他宿主因素。 染色质免疫沉淀的进一步测试表明，NP220 是招募 HUSH 复合物、SETDB1 以及组蛋白脱乙酰酶 HDAC1（601241） 和 HDAC4（605314） 以沉默未整合的逆转录病毒 DNA 的关键蛋白。 NP220 的敲除加速了逆转录病毒的复制。 朱等人（2018） 的结论是，他们的实验确定了沉默染色体外逆转录病毒 DNA 的分子机制。

▼ 测绘

Hartz（2011） 根据 ZNF638 序列（GenBank AF273049） 与基因组序列（GRCh37） 的比对，将 ZNF638 基因对应到染色体 2p13.2。