TBC1 域家族，成员 16; TBC1D16

HGNC 批准的基因符号：TBC1D16

细胞遗传学位置：17q25.3 基因组坐标（GRCh38）：17:79,932,342-80,035,874（来自 NCBI）

▼ 说明

RAB GTPases（参见 RAB1, 179508）在 GTP 结合形式下具有活性，而在 GDP 结合形式下则无活性，是膜转移的调节剂。 TBC1D16 作为 GTP 酶激活蛋白（GAP） 起作用，通过催化 GTP 水解使 RAB 失活（Goueli et al., 2012）。

▼ 克隆与表达

古埃利等人（2012）克隆了全长TBC1D16。 推导的 767 个氨基酸的蛋白质的计算分子量为 86.4 kD。 较短的异构体包含长异构体的 C 末端，包含 410 个氨基酸，计算分子量为 47.1 kD。 两种蛋白均具有催化 TRE2（USP6; 604334）/酵母 Bub2/CDC16（603461）（TBC） 结构域。 对转染的 HeLa 细胞进行差速离心和免疫荧光分析，将荧光标记的全长 TBC1D16 定位到早期内体。

维佐索等人（2015） 发现编码 47-和 45-kD TBC1D16 蛋白的转录本是从内部转录起始位点启动的。 由于使用了替代剪接受体位点，编码 45-kD 蛋白质的转录物具有较短的外显子 7。

▼ 基因功能

通过筛选 21 种纯化的 RAB GTPases，Goueli 等人（2012） 发现人类 TBC1D16 增强了 RAB4A（179511） 的 GTP 酶活性，这是受体从早期内体快速循环到细胞表面所必需的。 HeLa 细胞中 TBC1D16 的过度表达导致 RAB4A 从内体膜释放到细胞质。 TBC1D16 的 TBC 结构域中的催化精氨酸（arg494） 突变为丙氨酸，消除了该作用。 全长 TBC1D16 或 47-kD TBC1D16 亚型的过度表达会减慢转铁蛋白（TF; 190000） 的回收。 TBC1D16 的表达还促进 HeLa 细胞中的 EGF 受体（EGFR；131550）降解并减少 EGFR 信号传导。

维佐索等人（2015） 发现，与配对的相应原代癌细胞系相比，在 3 种人类转移性癌细胞系中，编码 TBC1D16 47-和 45-kD 同工型的转录本的表达被与内部转录起始位点相关的 CpG 岛的低甲基化激活。 在所有 6 个细胞系中，与全长 TBC1D16 相关的 CpG 岛保持未甲基化且失活。 染色质免疫沉淀分析显示，MITF（156845） 与转移性人黑色素瘤细胞中 TBC1D16 的未甲基化 CpG 岛中的 E 框结合，但不与原代人黑色素瘤细胞中的甲基化序列结合。 47-kD TBC1D16 同种型注射到裸鼠后促进黑色素瘤生长和转移。 免疫共沉淀分析表明，47-kD TBC1D16 直接与 RAB27A（603848）、RAB4A 和 RAB5C（604037） 结合，并且在体外以浓度依赖性方式增强 RAB5C 的 GTPase 活性。 47-kD TBC1D16 亚型与转移细胞中 EGFR 活性降低相关。 47-kD TBC1D16 的表观遗传再激活与人类黑色素瘤的不良临床结果相关。

▼ 基因结构

维佐索等人（2015） 确定 TBC1D16 基因包含 12 个外显子，以及内含子 5 中与内部转录起始位点相关的替代外显子。 初级和内部转录起始位点均与 CpG 岛相关。

▼ 测绘

Hartz（2015） 根据 TBC1D16 序列（GenBank BC001525） 与基因组序列（GRCh38） 的比对，将 TBC1D16 基因对应到染色体 17q25.3。