X射线抗辐射性1; XRRA1
HGNC 批准的基因符号:XRRA1
细胞遗传学位置:11q13.4 基因组坐标(GRCh38):11:74,840,909-74,949,186(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
梅萨克等人(2003) 从未受辐射的人结直肠癌细胞系 HCT116 中分离出几个对 X 辐射(XR) 具有广泛反应的克隆。 使用 cDNA 微阵列,他们鉴定了一种新基因,命名为 XRRA1,该基因在 XR 抗性细胞克隆(HCT116Clone2_XRR) 中下调了 2 倍。 他们通过计算机方法获得了全长人类XRRA1 cDNA,从猕猴睾丸中克隆了全长XRRA1 cDNA,并从HCT116Clone2_XRR中克隆了剪接变体(缺少外显子3的截短的cDNA)。 人类 XRRA1 基因编码推导的 559 个氨基酸的蛋白质,具有 2 个可能的富含亮氨酸重复序列、一个 PEST 序列、2 个酪氨酸磷酸化位点和二分核靶向序列。 梅萨克等人(2003) 发现 XRRA1 基因在哺乳动物中似乎高度保守。 RT-PCR 检测到人类 XRRA1 转录物主要存在于睾丸、前列腺和卵巢中,并且在所有测试的癌细胞系中存在不同水平。 DNA微阵列分析显示,与混合组织相比,猕猴睾丸中XRRA1的表达量高出3倍,并且猕猴和人类睾丸中的表达水平相似。 HCT116 细胞和 COS-7 细胞中 GFP-XRRA1 构建体的过度表达仅导致短暂表达,表明高于基础水平的 XRRA1 水平可能对细胞致命。 XRRA1 定位于转染细胞的细胞核和细胞质。
▼ 基因功能
梅萨克等人(2003) 发现 HCT116Clone2_XRR 细胞中的 XRRA1 表达在 XR 后几乎立即增加,并在治疗后 24 小时降至几乎照射前的水平。 XRRA1 在 COS-7 细胞中的过度表达消除了 Ku86(一种参与非同源末端连接机制的 DNA 修复蛋白)的核免疫染色,表明在细胞对 XR 的反应过程中,XRRA1 和 Ku86 表达之间可能存在负相关。
▼ 基因结构
梅萨克等人(2003) 确定 XRRA1 基因包含 11 个外显子,跨度为 64 kb。
▼ 测绘
通过序列分析,Mesak 等人(2003) 将 XRRA1 基因定位到染色体 11q13.3,位于标记 D11S916 和 D11S911 之间。