含吡啶结构域的蛋白质 2; PYDC2
- 仅吡啶结构域蛋白 2; POP2
HGNC 批准的基因符号:PYDC2
细胞遗传学定位:3q28 基因组坐标(GRCh38):3:191,461,162-191,461,455(来自 NCBI)
▼ 说明
Pyrin 结构域(PYD) 蛋白是信号分子,通过激活炎症介质途径参与宿主防御病原体。 PYDC2 与中央接头蛋白 ASC(PYCARD; 606838) 和含有 PYD 的病原体识别受体 PAN1(NLRP2; 609364) 结合,从而阻断含有冷热蛋白(NLRP3; 606416) 和 PAN1 的炎症小体的形成、半胱天冬酶-1(CASP1; 147678) 的激活以及生物活性白细胞介素 1 的加工和分泌-β(IL1B;147720)(Dorfleutner 等,2007)。
▼ 克隆与表达
通过在数据库中搜索编码细胞 PYD-only 蛋白(POP) 的序列,Dorfleutner 等人(2007) 鉴定了 PYDC2,他们将其称为 POP2。 预测的 97 个氨基酸蛋白与各种炎性体蛋白的 PYD 具有显着的相似性,其中与 PAN1 的 PYD 有 61% 的一致性。 RT-PCR 分析检测到人骨髓细胞系中 294 bp 转录物的表达。 共聚焦显微镜显示,表位标记的 POP2 主要定位于转染的 HEK293 细胞的细胞核和细胞质囊泡结构。
孤立地,Bedoya 等人(2007) 还克隆并表征了 POP2。
▼ 基因功能
Dorfleutner 等人使用 Pull-down 测定、免疫共沉淀分析和酵母 2-杂交测定(2007) 表明 POP2 通过 PYD-PYD 相互作用结合 ASC 和 PAN1。 免疫荧光显微镜显示 POP2 与 PAN1 和 ASC 的 PYD 在点状细胞质结构中部分共定位。 POP2 与 ASC 和冷热蛋白或与 ASC 和 PAN1 一起表达会干扰 半胱天冬酶-1 激活和 IL1B 分泌。 多弗洛特纳等人(2007) 提出 POP2 通过特定炎症小体调节 半胱天冬酶-1 激活。
使用转染和荧光素酶分析,Bedoya 等人(2007) 表明,POP2 通过涉及 NFKB 核输入或分布变化的机制抑制 TNF(191160) 和 p65(RELA; 164014) 诱导的 NFKB(参见 164011) 依赖性基因转录。 免疫荧光显微镜证明 POP2 与 ASC 共定位于核周斑点中,但 POP2 也抑制 CIAS1 斑点的形成(NLRP3; 606416)。 贝多亚等人(2007) 得出结论,POP2 是 NFKB 活性的负调节因子,可能影响 PYD 依赖性复合物的组装。
▼ 基因结构
多弗洛特纳等人(2007)指出PYDC2基因包含1个外显子。
▼ 测绘
多弗洛特纳等人(2007) 指出 PYDC2 基因对应到染色体 3q28。