海藻糖酶; TREH
- α,α-海藻糖-1-D-葡萄糖水解酶
HGNC 批准的基因符号:TREH
细胞遗传学位置:11q23.3 基因组坐标(GRCh38):11:118,657,315-118,679,649(来自 NCBI)
▼ 说明
海藻糖(1-α-D-吡喃葡萄糖基α-D-吡喃葡萄糖苷)在自然界中分布广泛,是真菌的储存二糖和昆虫的血糖。 海藻糖酶(EC 3.2.1.28) 是小肠和肾刷状缘膜的一种内在糖蛋白,可将海藻糖水解为 2 个葡萄糖分子(Ishihara 等人,1997 年;Oesterreicher 等人,2001 年)。 有关海藻糖酶缺乏症的信息,请参阅 612119。
▼ 克隆与表达
笹井武达等人(1996) 分离出人肾海藻糖酶的部分 cDNA。 推导的氨基酸序列与来自兔(Ruf等人,1990)、黄粉虫和蚕的海藻糖酶具有同源性。 Northern 印迹分析检测到 2.0-kb 肾海藻糖酶 mRNA。
通过使用 Sasai-Takedatsu 等报道的部分海藻糖酶 cDNA 筛选肾脏 cDNA 文库(1996),石原等人(1997) 克隆了全长人海藻糖酶。 推导的 583 个氨基酸的蛋白质的计算分子量为 66.6 kD。 它具有一个 N 端信号肽、5 个潜在的 N 糖基化位点和一个用于糖基磷脂酰肌醇(GPI) 附着的 C 端疏水区域。 Northern 印迹分析检测到主要在肾脏、肝脏和小肠中的 2.0-kb 转录物。
奥斯特赖彻等人(2001) 克隆小鼠 Treh,其编码推导的 576 个氨基酸的蛋白质,与人类 TREH 有 82% 的同一性。 小鼠 Treh 的第 162 至 175 位氨基酸的海藻糖酶特征序列与人 TREH 中的相应区域具有 100% 的同一性。 Northern 印迹分析仅在小鼠肾脏和小肠中检测到 Treh 表达。
▼ 基因功能
Sasai-Takedatsu 等人通过对肾脏和尿液中人海藻糖酶特性的研究(1996) 得出结论,尿海藻糖酶可以是肾小管损伤的特异性标志物。
石原等人(1997) 表明重组人 TREH 具有活性,并且其催化活性不需要糖基化或 GPI 锚定。 海藻糖是 TREH 使用的唯一底物。
▼ 基因结构
奥斯特赖彻等人(2001)确定人和小鼠的TREH基因含有15个外显子并且具有高度保守的结构。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Oesterreicher 等人(2001) 将 TREH 基因定位到染色体 11q23。 他们将小鼠 Treh 基因定位到与人类染色体 11q23 具有同线性同源性的 9 号染色体区域。
▼ 分子遗传学
为了识别携带影响 200 多种生化和疾病特征的纯合预测功能丧失(pLoF) 突变的个体,Salheen 等人(2017) 对巴基斯坦心肌梗死风险研究(PROMIS) 中 10,503 名成人参与者的蛋白质编码区进行了测序。 他们鉴定了 49,138 个罕见(次要等位基因频率小于 1%)pLoF 突变,估计这些突变会敲除 1,317 个基因,每个基因至少有 1 名参与者。 他们鉴定出 6 个个体的 TREH 基因(275360.0001) 中剪接受体位点的 pLoF 缺失是纯合的。
▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):
.0001 海藻糖酶缺乏症
TREH、IVS1-EX2、26-BP DEL
Saleheen 等人在巴基斯坦心肌梗塞风险研究(PROMIS) 的 10,503 名成人参与者中进行了研究(2017) 鉴定出 6 个个体(612119) 因 TREH 基因外显子 2 中的剪接受体位点(c.90-9_106delTCTCTGCAGTGAGATTTACTGCCACG, ENST00000264029.4) 缺失而纯合。 萨莱欣等人(2017) 发现,与杂合子和非携带者不同,纯合子的几种含载脂蛋白 B 的脂蛋白亚组分的浓度较低。 没有提供纯合个体特有的表型信息。