磷酸二酯酶 1B; PDE1B
- PDE1B1
HGNC 批准的基因符号:PDE1B
细胞遗传学位置:12q13.2 基因组坐标(GRCh38):12:54,549,600-54,579,238(来自 NCBI)
▼ 描述
环核苷酸磷酸二酯酶(PDE) 催化环核苷酸 cAMP 和 cGMP 水解为相应的核苷 5-prime-mono磷酸。哺乳动物 PDE 根据其生化特性分为几个家族。PDE1 家族的成员,例如 PDE1B,是钙调蛋白(参见 114180)依赖性 PDE(CaM-PDE),受钙-钙调蛋白复合物刺激(Repaske 等,1992)。
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使用 PCR 策略进行克隆和表达,Repaske 等人(1992) 克隆了编码 63-kD CaM-PDE 的部分小鼠和人类 cDNA。
江等人(1996)报道了人类PDE1B1完整编码区的序列。预测的 536 个氨基酸蛋白与牛、大鼠和小鼠 PDE1B1 具有 96% 的氨基酸一致性。
于等人(1997) 在酿酒酵母中表达 PDE1B1,并通过蛋白质印迹分析发现它迁移为 61-kD 蛋白。Northern 印迹分析表明,PDE1B1 以组织特异性模式表达为多个转录本。在大脑、心脏和骨骼肌中检测到最高 mRNA 水平。使用原位杂交,Yu 等人(1997) 确定 PDE1B1 主要在小脑、海马和尾状核的神经元细胞中表达。
里德等人(1998) 克隆并表征了小鼠 Pde1b 基因,该基因编码 63-kD 钙/钙调蛋白依赖性 PDE。他们指出,这种 PDE 同工酶在中枢神经系统的嗅道、齿状回和纹状体中表达,表明它可能参与学习、记忆和多巴胺能神经元 DARPP-32 磷酸化的调节。
菲多克等人(2002) 分离出 PDE1B 的剪接变体,他们将其称为 PDE1B2。推导的 516 个氨基酸的蛋白质仅在 N 末端与 536 个氨基酸的 PDE1B1 蛋白质不同。Northern 印迹分析检测到 PDE1B1 在几个特定的大脑区域中表达,特别是尾状核和壳核,但在脊髓或任何外周组织中没有表达。相反,PDE1B2在脊髓中高表达,在甲状腺、胸腺、子宫、小肠、壳核和尾状核中表达较低。在其他组织中未检测到 PDE1B2 的表达。
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使用 RT-PCR 检测基因功能,Jiang 等人(1996) 发现 PDE1B1 在几种类淋巴母细胞和白血病细胞系中表达,但在正常静息外周血淋巴细胞(PBL) 中不表达。然而,在有丝分裂刺激后,PBL 中 PDE1B1 的表达被诱导。抑制淋巴母细胞和白血病细胞系中的 PDE1B1 表达会导致细胞凋亡,这表明了一种治疗白血病的新策略。
于等人(1997) 发现重组 PDE1B1 蛋白具有与 CaM-PDE 一致的生化特性。
▼ 测绘
Yu 等人通过分析体细胞杂交体并包含在作图的 YAC 中(1997) 将 PDE1B1 基因定位于染色体 12q13。Reed 等人使用荧光原位杂交(1998) 将 Pde1b 基因定位于小鼠 15 号染色体的远端。
▼ 进化
Yu 等人(1997) 分离了部分 PDE1B1 基因组序列,发现编码催化结构域的区域内的 2 个剪接点在大鼠 Pde4b(600127) 和 Pde4d(600129) 以及果蝇 'dunce' PDE 中是保守的,表明 PDE 的催化结构域源自共同的祖先基因。
里德等人(1998) 发现小鼠 Pde1b 基因与大鼠 Pde4b 和 Pde4d 基因以及果蝇“dunce”cAMP 特异性 Pde 基因 dnc 有许多相似或相同的外显子边界以及相当大的序列同一性,表明这些基因都起源于共同的祖先。