趋化因子、CC 基序、配体 16; CCL16

  • 小诱导细胞因子亚科 A,成员 16; SCYA16
  • 新 CC 趋化因子 4; NCC4
  • 肝脏表达的趋化因子; LEC
  • 血滤液 CC 趋化因子 4; HCC4
  • 淋巴细胞和单核细胞趋化剂; LMC

HGNC 批准的基因符号:CCL16

细胞遗传学位置:17q12 基因组坐标(GRCh38):17:35,976,492-35,983,619(来自 NCBI)

▼ 说明

趋化因子是小的、结构相关的细胞因子,参与白细胞的迁移。 CXC 趋化因子在前 2 个半胱氨酸之间有一个氨基酸,而 CC 趋化因子没有中间氨基酸。 CCL16 是一种 CC 趋化因子(Shoudai 等人,1998 年总结)。

▼ 克隆与表达

通过搜索 EST 数据库,然后对肝脏 cDNA 文库进行 RACE-PCR,Shoudai 等人(1998) 分离出编码 CCL16 的 cDNA,他们将其命名为 NCC4 或 LEC。 预测的 120 个氨基酸蛋白包含 23 个残基的前导序列和 4 个 CC 趋化因子特征的保守半胱氨酸。 Northern 印迹分析显示 0.8-和 1.8-kb 转录物仅在肝脏中表达。 Southern印迹分析表明每个基因组存在一个拷贝。

赫德里克等人孤立地(1998) 克隆并表征了 CCL16,他们将其命名为 HCC4。 Northern、Southern 和斑点印迹分析表明,HCC4 在人免疫组织中以 0.5 kb 转录本表达,在 IFNG(147570) 或 IL10(124092) 激活的单核细胞中表达最高。

尤恩等人(1998) 还克隆并表征了 CCL16,他们将其命名为 LMC。 他们报告称,推导的 120 个氨基酸蛋白质具有 20 个氨基酸信号序列,计算出的分子量约为 11 kD。

▼ 基因功能

赫德里克等人(1998)观察到重组人HCC4以剂量依赖性方式吸引静息的人单核细胞并诱导人单核细胞系中的Ca(2+)流动。

Youn 等人的功能测定(1998)表明LMC抑制骨髓祖细胞的增殖,并对外周血单核细胞具有有效的趋化活性,但对中性粒细胞没有作用。

▼ 测绘

成濑等人(1996) 在染色体 17q11.2 上鉴定出 CC 家族的趋化因子簇。 他们使用一组具有已知缺失的体细胞杂交体,将 CC 家族的 1 个基因(他们称之为 NCC4)对应到该簇。 NCC4 最初被定性为表达序列标签(EST)。 为该区域组装的 YAC 重叠群的基因推导顺序为:cen--NF1(613113)--MCP3(158106)、MCP1(158105)、NCC1(601391)、I-309(182281)--Y1741 断点--RANTES(187011)--LD78-γ、AT744.2(603782)、LD78-β(601395)--NCC3(601393)、NCC2(601392)、AT744.1(182284)、LD78-α(182283)--NCC4--RARA(180240)--tel。