蛋白酶体 26S 亚基,非 ATP 酶,9; PSMD9
- BRIDGE 1,大鼠,同系物
HGNC 批准的基因符号:PSMD9
细胞遗传学位置:12q24.31 基因组坐标(GRCh38):12:121,888,789-121,918,296(来自 NCBI)
▼ 正文
26S 蛋白酶体是一种真核 ATP 依赖性蛋白酶,可选择性降解通过共价连接泛素修饰的细胞内靶蛋白。 它由一个中央催化 20S 蛋白酶体(由一系列小蛋白质组成)和 2 个大型调节模块(名为 PA700)组成,后者由大约 20 个异质蛋白质组成。 蛋白酶体调节复合物由 p27、p42 和 p50 亚基组成,刺激 20S 蛋白酶体与 PA700 结合,形成活性 26S 蛋白酶体。 渡边等人(1998) 克隆了 2 个编码 p27 或 PSMD9 的不同人脑 cDNA。 与较长的 cDNA 相比,较短的 cDNA 在 3-prime 区域附近有 65 bp 的缺失,从而在下游产生了一个新的框内终止密码子。 较长的 cDNA 编码推导的 209 个氨基酸的蛋白质,计算分子量为 22,764 Da。 较短的 cDNA 编码推导的 223 个氨基酸的蛋白质,计算分子量为 24,652 Da。 较长的 PSMD9 蛋白与酿酒酵母蛋白具有 36% 的序列同一性,作者将其命名为 NAS2(意为“非 ATP 酶亚基 2”),与秀丽隐杆线虫蛋白具有 31.9% 的序列同一性。 酵母 NAS2 基因的破坏不会影响细胞活力或增殖。 渡边等人(1998) 证明 PSMD9 蛋白与 ATP 酶成分 TBP1(PSMC3; 186852) 和 p42(PSMC6; 602708) 一起与调节剂复合物和 26S 蛋白酶体复合物相关。 Northern 印迹分析在所有检查的组织中检测到大约 1.3 kb PSMD9 转录物,其中肝脏和肾脏中的水平最高。
E12 和 E47(参见 TCF3;147141)是普遍存在的 E2A 蛋白家族的成员,与碱性螺旋-环-螺旋(bHLH) 蛋白一起发挥作用,通过称为 E 框的保守序列元件结合并反式激活启动子。 Thomas等人使用E12的含有bHLH结构域的C末端作为诱饵,通过酵母2-杂交筛选大鼠胰岛素瘤细胞cDNA文库(1999)获得了编码大鼠Bridge-1的cDNA。 序列分析预测,222 个氨基酸的 Bridge-1 蛋白在前 184 个氨基酸上与人类 PSMD9 具有 98% 的氨基酸相似性,但在 C 末端有所不同,Bridge-1 包含一个从氨基酸 138 到 178 的 PDZ 样结构域,形成 3 个 β 折叠和 2 个 α 螺旋。 SDS-PAGE分析显示Bridge-1表达为28kD蛋白,接近推定值25kD。 使用 Bridge-1 cDNA 作为探针,Northern 印迹分析在所有测试的大鼠和人体组织中检测到 1.0-kb 转录物,其中在胰腺、睾丸、肾脏和肝脏中表达最高。 免疫细胞化学评估表明 Bridge-1 主要定位于核,细胞质中水平较低。 免疫沉淀分析确定,抗 Bridge-1 抗体通过其 C 端 bHLH 结构域共免疫沉淀 E12 或 E12 和 E47,但仅在存在 Bridge-1 的 PDZ 结构域的情况下。 CAT 测定表明 Bridge-1 与 E12 或 E47 一起共同激活胰岛素(176730) 启动子元件。
通过荧光原位杂交,Watanabe 等人(1998) 将 PMSD9 基因对应到 12q24.2-q24.3。